吴巍巍，男，汉族，福建顺昌人，博士。现任福建师范大学闽台区域研究中心研究员、博士生导师，中国海外交通史研究会副秘书长、《海交史研究》副主编。主要研究方向为两岸文化与东亚海域史。已出版著作10部（含主编），发表学术论文60余篇。主持国家社科基金冷门“绝学”重大研究专项等项目4项，主持教育部人文社科项目、福建省社科规划项目等部厅级课题10项；参与国家社科基金重大项目、教育部人文社科重大攻关项目、国家社科基金重点项目、教育部人文社科重点研究基地项目及其他各类纵、横向科研项目30余项。研究成果获教育部高等学校科学研究优秀成果（人文社会科学）普及奖、福建省社会科学优秀成果二等奖、三等奖各1项；入选“福建省高校新世纪优秀人才支持计划”、“福建省高校****科研人才培育计划”；获“福建师范大学优秀青年科研骨干教师”与“福建师范大学‘宝琛青年英才’”等荣誉。
代表性科研成果：
（一）、专著
1、《西方传教士与晚清福建社会文化》（独著），海洋出版社，2011年。
2、《“三通”潮》（主编），福建教育出版社，2011年。
3、《钓鱼岛：历史与主权》（第2），海洋出版社，2012年。
4、《福州市古村镇历史与文化》（执行主编），海峡文艺出版社，2014年。
5、《福建与中西文化交流史论》（第2），海洋出版社，2015年。
6、《闽台基督宗教关系研究》（独著），福建教育出版社，2016年。
7、《台湾文献汇刊续编》（副主编），九州出版社，2016年。
8、《明清宫藏闽台关系档案汇编》（副主编），福建教育出版社，2016年。
9、《图说福建与海上丝绸之路丛书——舟行天下：福建与欧美》（丛书副主编），福建教育出版社，2018年。
10、《明清宫藏闽台关系档案图录》（副主编），福建人民出版社，2018年。
11、《两岸合编妈祖文化志》（第四卷），国家图书馆出版社，2018年。
（二）、代表性论文
1、《近代中国基督教史上的“传教区划”现象探论——以福建为考察中心》，《世界宗教研究》，2015年第1期。人大复印资料《宗教》2015年第3期全文转载。
2、《家族?科举?诗社——明末莆田奉教士大夫黄鸣乔研究》，《世界宗教研究》，2017年第5期。
3、《19世纪美国传教士中国观建构之文化心态论析》，《宗教学研究》，2016年第2期。《中国社会科学文摘》，2016年第11期转载。
4、《19世纪美国传教士的中国观》，《中国社会科学文摘》，2016年第11期。
5、《侨居者与文化适应：考察近代传教士在华活动的一个视角——以福建地区为例》，《宗教学研究》，2011年第3期。
6、《试论近代来华传教士中国报道与研究对西方世界的影响》，《福建师范大学学报》（哲社版），2011年第6期。
7、《西方传教士与华南沿海地区考古发现初探》，《中原文物》，2014年第1期。
8、《晚清开埠后福州城市社会经济的发展与变化》，《中国社会经济史研究》，2015年第2期。
9、《日本殖民统治台湾时期闽台基督教间的互动关系》，《基督宗教研究》（第18辑），北京：宗教文化出版社，2015年10月。
10、《宗族、乡邻与基层信众——近代福建基督教华人牧师的人际网络关系初探》，《福建师范大学学报》（哲社版），2016年第2期。
11、《琉球闽人后裔的祖根情结及其对中华文化的持守——以中琉民间家谱对接为考察中心》，《太平洋学报》2017年第3期。
12、《<明清宫藏闽台关系档案汇编>评介》，《历史档案》，2017年第3期。
13、《闽台基督教长老会传教史中的闽南文化脉络》，《泉州师范学院学报》，2011年第3期。
14、《台湾道台与海东书院的教育管理及其影响》，《教育史研究》，2013年第1期。
15、论日本政府对钓鱼岛“国有化”的险恶用心，《中国海洋报》，2012年9月12日。
16、《清代涉台文献中的钓鱼岛资料记录及相关考证》，《海交史研究》，2014年第1期。
17、《试论台湾师范教育转型的历史经验及其启示》，《教育史研究》，2014年第1期。
18、《明清之际的福建与中西文化交流——“海上丝绸之路”的历史契机与当代启示》，《海交史研究》，2015年第2期。
19、《清代钓鱼岛隶属于台湾行政管辖史实考》，《福州大学学报》（哲社版）2016年第1期。
20、《評論：<離散中的基督徒身份建構>》（Review: Identity Development of Christian Diaspora: Thought Process of N.Z. Zia），《漢語基督教學術論評》（Sino-Christian Studies），2014年12月No.18。A&HCI收录
21、《評論：<民國福建協和大學之研究>》（Review: A Study of the Fukien Christian University during the Republican Period），《漢語基督教學術論評》（Sino-Christian Studies），2014年12月No.18。A&HCI收录
22、評論：《被遗忘的中国童年》，《漢語基督教學術論評》（Sino-Christian Studies），2015年12月 No.20。A&HCI收录
23、评论：《中西并重：监理会在华事业研究》，《漢語基督教學術論評》（Sino-Christian Studies），2018年6月No.25。A&HCI收录