个人简介
高芳銮，博士，硕士生导师，九三学社社员，福建农林大学植物保护学院副研究员，主要从事植物病毒的检测、鉴定及其分子进化研究，以第一作者或通讯作者在《Virus Evolution》、《Evolutionary Applications》、《Virology》、《Virus Research》、《Ecology and Evolution》和《中国农业科学》等国内外期刊发表学术论文35篇，其中SCI论文23篇，出版编著《生物信息学分析实践》（科学出版社）1 部（主编），获得福建省技术发明奖三等奖2项、福建省标准贡献奖二等奖1项、计算机软件著作权1项，主持国家自然科学基金面上项目1项目、福建省自然科学基金面上项目2项，制定国家标准2项、行业标准3项。
学习与工作简历
2017年7月-2018年7月，悉尼大学生命与环境科学学院，访问****
2015年9月至今，福建农林大学植物病毒研究所，副研究员
2009年10月-2015年8月，福建农林大学植物病毒研究所，助理研究员
2006年10月-2009年9月，福建农林大学植物病毒研究所，研究实习员
2010年9月-2014年12月，福建农林大学植物检疫专业，获农学博士学位
2003年9月-2006年7月，福建农林大学植物病理学，获农学硕士学位
1998年9月-2002年7月，福建农林大学植物保护专业，获农学学士学位
主持或参加的科研项目
(1) 国家自然科学基金面上项目《我国马铃薯Y病毒群体的适应性进化机制研究》（No. **），主持；
(2) 福建省自然科学基金面上项目《基于贝叶斯谱系动力学的水仙黄条病毒群体时空动态特征研究》（No. 2019J01653），主持，在研；
(3) 福建省自然科学基金面上项目《南方马铃薯Y病毒的群体结构分析》（No. 2013J01088），主持，已结题；
(4) 福建省教育厅科技项目《马铃薯Y病毒福建群体HC-pro、CP基因的遗传多样性分析》（No. JA12119），主持，已结题；
(5) 国家自然科学基金面上项目《烟草花叶病毒RNA 3′-尿苷化修饰的研究》，参与，结题。
获得荣誉
(1)《适应性进化和群体历史动态导致中日两国马铃薯Y病毒遗传结构的差异》，2020年，第十四届福建省自然科学优秀学术论文，二等奖；
(2)《我国马铃薯Y病毒的检测及CP基因的分子变异》，2016年，第十二届福建省自然科学优秀学术论文，三等奖；
(3)《进出境重要花卉、果树和蔬菜病毒快速检测关键技术及应用》，2019年度福建省科学技术奖，科学技术进步奖三等奖（4/5）；
(4)《水仙病毒快速检疫鉴定技术及应用》，2014年度福建省技术发明奖，三等奖(2/5)；
(5)《水稻瘤矮病毒的检疫方法》，2012年度福建省标准贡献奖，二等奖(3/6)；
(6) 2016年度福建农林大学优秀教师；
(7) 2016年《中国农业科学》优秀审稿专家
研究生培养
(1) “大北农杯”第一届全国农林院校研究生学术科技作品竞赛二等奖（2015级邹文超、沈林林等《采用多基因联合方法鉴定福建长乐和福清产区马铃薯Y 病毒株系组成》）；
(2) 2015年度中国精品科技期刊顶尖学术论文F5000（2012级常飞、2015级邹文超《不同寄主来源的马铃薯Y病毒遗传结构的比较分析》）；
(3)《遗传》2015年度优秀论文（2012级常飞、2015级邹文超《不同寄主来源的马铃薯Y病毒遗传结构的比较分析》）；
(4) 2014年度研究生国家奖学金（2012级常飞）和2017年度研究生国家奖学金（2015级邹文超和沈林林）；
(5) 2013年中国马铃薯大会优秀论文三等奖（2011级史凤阳《马铃薯Y病毒简并引物的开发与检测应用》）；
(6) 2014年度中国精品科技期刊顶尖学术论文F5000（2011级史凤阳《马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征》）；
(7) “英龍人才培育战略”优秀硕士生（2012级常飞）；
发表论文（^*为通讯作者，⁺为共同第一作者）
(1)第一作者或通讯作者SCI论文
²³Xu, Y., Zhang, S., Shen, J., Wu, Z., Du, Z.*, Gao, F.^*, 2021. The phylogeographic history of tomato mosaic virus in Eurasia. Virology554, 42-47.
²²Chen, X., Lin, S., Shen, J., Liao, F., Chen, S.,Gao, F.^*, 2021.Complete genome analysis of a divergent isolate of narcissus yellow stripe virus from China.Journal of Plant PathologyIn press.
²¹Gao, F., Kawakubo, S., Ho, S.Y.W., Ohshima, K.^*, 2020. The evolutionary history and global spatio-temporal dynamics of potato virus Y. Virus Evolution6, veaa056.
²⁰Yang, J., Fang, D., Shen, J., Chen, X., Gao, F.^*, 2020. Molecular characterization of tobacco ringspot virus fromIris ensata. European Journal of Plant Pathology158, 805-809.
¹⁹Gao, F., Chen, C., Li, B., Weng, Q., Chen, Q.^*, 2020. The gene flow direction of geographically distinct Phytophthora infestanspopulations in China corresponds with the route of seed potato exchange. Frontiers in Microbiology11, 1077.
¹⁸Xie, L., Gao, F.^*, Shen, J., Zhang, X., Zheng, S., Zhang, L., Li, T.^*, 2020. Molecular characterization of two recombinant isolates of telosma mosaic virus infecting Passiflora edulisfrom Fujian Province in China. PeerJ8, e8576.
¹⁷Mao, Y.⁺, Sun, X.⁺, Shen, J.,Gao, F.^*, Qiu, G., Wang, T., Nie, X., Zhang, W., Gao, Y., Bai, Y.^*, 2019. Molecular evolutionary analysis of potato virus Y infecting potato based on the VPg gene.Frontiers in Microbiology10,1708.
¹⁶Gao, F.^+*, Chen, C.^{+ *}, Arab, D.A., Du, Z., He, Y., Ho, S.Y.W., 2019. EasyCodeML: A visual tool for analysis of selection using CodeML.Ecologyand Evolution9, 3891-3898. (高被引论文)
¹⁵ Gao, F.⁺, Liu, X., Du, Z., Hou, H., Wang, X., Wang, F., Yang, J., 2019. Bayesian phylodynamic analysis reveals the dispersal patterns of tobacco mosaic virus in China.Virology528, 110-117.
¹⁴ Xie, L.,Gao, F.^*, Zheng, S., Zhang, X., Zhang, L., Li, T.^*, 2019. Molecular characterization of a new potyvirus infecting passion fruit.Archives of Virology164, 1903-1906.
¹³Duan, G., Zhan, F., Du, Z., Ho, S.Y.W.,Gao, F.^*, 2018. Europe was a hub for the global spread of potato virus S in the 19th century.Virology525, 200-204.
¹²Guan, X., Yang, C., Fu, J., Du, Z., Ho, S.Y.W.,Gao, F.^*, 2018. Rapid evolutionary dynamics of pepper mild mottle virus.Virus Research256, 96-99.
¹¹ Gao, F., Shen, J., Liao, F., Cai, W., Lin, S., Yang, H., Chen, S., 2018. The first complete genome sequence of narcissus latent virus fromNarcissus.Archives of Virology165, 1383-1386.
¹⁰ Gao, F.,Du, Z., Shen, J., Yang, H., Liao, F., 2018. Genetic diversity and molecular evolution ofOrnithogalum mosaic virusbased on the coat protein gene sequence.PeerJ6, e4550.
⁹Gao, F., Zou, W., Xie, L., Zhan, J., 2017. Adaptive evolution and demographic history contribute to the divergent population genetic structure of potato virus Y between China and Japan.Evolutionary Applications10, 379-390.
⁸ Gao, F., Lin, W., Shen, J., Liao, F., 2016. Genetic diversity and molecular evolution of arabis mosaic virus based on the CP gene sequence.Archives of Virology161, 1047-1051.
⁷ Gao, F., Jin, J., Zou, W., Liao, F., Shen, J., 2016. Geographically driven adaptation of chilli veinal mottle virus revealed by genetic diversity analysis of the coat protein gene.Archives of Virology161, 1329-1333.
⁶ Gao, F., Chang, F.⁺, Shen, J., Shi, F., Xie, L., Zhan, J., 2014. Complete genome analysis of a novel recombinant isolate of potato virus Y from China.Archives of virology159, 3439-3442.
⁵He, Y.,Gao, F.⁺, Shen, J., Liao, F., Chen, X., Zhang, H., Yang, H., Chen, S., 2019. A multiplex RT-PCR method for the simultaneous detection of narcissus yellow stripe virus, narcissus latent virus and narcissus mosaic virus.Canadian Journal of Plant Pathology,41, 115-123.
⁴Tang, Y.,Gao, F.⁺, Yang, Z., Wu, Z., Yang, L., 2016. Complete genome analysis of jasmine virus T fromJasminum sambacin China.Archives of Virology161, 2033-2036.
³Lin, W.,Gao, F.⁺, Yang, W., Yu, C., Zhang, J., Chen, L., Wu, Z., Hsu, Y.-H., Xie, L., 2016. Molecular characterization and detection of a recombinant isolate of bamboo mosaic virus from China.Archives of Virology161, 1091-1094.
²Chang, F.,Gao, F.⁺, Shen, J., Zou, W., Zhao, S., Zhan, J., 2015. Complete genome analysis of a PVY^N-Wirecombinant isolate fromSolanum tuberosumin China.Potato Research58, 377-389.
¹Xu, M.,Gao, F.⁺, Yang, J., Wu, J., Xie, L., Chi, Y., 2014. Complete genome sequence of peanut stripe virus isolated in China.Journal of Phytopathology162, 828-832.
中文文章
¹²邹林峰⁺,涂丽琴⁺,沈建国,杜振国,蔡伟,季英华^*,高芳銮^*,2020. 番茄褪绿病毒的进化动态与适应性进化特征.中国农业科学,Accepted.
¹¹杨宏凯,杨晶文,沈建国^*,蔡伟,高芳銮^*,2020. 辣椒脉斑驳病毒的多基因联合检测与鉴定.中国农业科学53, In press.
¹⁰邹文超,沈林林,沈建国,蔡伟,詹家绥,高芳銮^*, 2017.马铃薯Y病毒多基因系统发育分析及其在株系鉴定中的应用.遗传39, 918-929.
⁹蔡伟,杨宏凯,沈建国,邹文超,高芳銮^*,2017.全基因组序列的系统发育与重组分析鉴定我国马铃薯Y病毒株系.激光生物学报26, 350-359.
⁸沈林林,邹文超,高芳銮^*,詹家绥^*, 2016.采用多基因联合方法鉴定福建长乐和福清产区马铃薯Y病毒株系组成.中国农业科学49, 3918-3926.
⁷沈建国^{+, *},高芳銮⁺,蔡伟,金晶,廖富荣,吴祖建^*, 2016.进境大豆种子上菜豆荚斑驳病毒和大豆花叶病毒的多重RT-PCR检测.中国农业科学49, 667-676.
⁶高芳銮,常飞,沈建国,谢联辉,詹家绥, 2015. PVY^NTN-NW榆林分离物的全基因组序列测定与分析. 中国农业科学, 48, 270-279.
⁵史凤阳,高芳銮⁺,沈建国,常飞,詹家绥, 2014.马铃薯Y病毒福建分离物P1基因的分子变异和结构特征.遗传36, 713-722.
⁴高芳銮,沈建国,史凤阳,方治国,谢联辉,詹家绥, 2013.我国马铃薯Y病毒的检测及CP基因的分子变异.中国农业科学46, 3125-3133.
³高芳銮,沈建国,史凤阳,常飞,谢联辉,詹家绥, 2013.马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析.遗传35, 1125-1134.
²高芳銮,范国成,沈建国,谢荔岩,林奇英,吴祖建,谢联辉, 2009.水稻瘤矮病毒P8蛋白的结构分析及其表达.中国生物工程杂志29, 51-56.
¹高芳銮,范国成,谢荔岩,黄美英,吴祖建, 2008.呼肠孤病毒科的系统发育分析.激光生报学报17, 486-490.
合作文章：
²Kawakubo, S., Gao, F., Li, S., Tan, Z., Huang Y. K., Adkar-Purushothama, C. R., Gurikar, C., Maneechoat, P., Chiemsombati, P., Ayej, S. S., Furuyak, N., Shevchenkol, O., ?pakm, J., ?kori?n D., Ho, S. Y. W., Ohshima K.^*, 2021. Genomic analysis of the brassica pathogen turnip mosaic potyvirus reveals its spread along the former trade routes of the Silk Road. Proceedings of the National Academy of SciencesIn press.
¹ Zhang, D., Gao, F., Li, W.X., Jakovli?, I., Zou, H., Zhang, J., Wang, G.T.^*, 2020. PhyloSuite: an integrated and scalable desktop platform for streamlined molecular sequence data management and evolutionary phylogenetics studies. Molecular Ecology Resources20, 348-355. (高被引论文)
出版著作：
吴祖建,高芳銮,沈建国.生物信息学分析实践.北京：科学出版社, 2010
计算机软件著作权：
高芳銮，陈程杰. 自然选择的可视化分析工具EasyCodeML软件[简称EasyCodeML] v1.21
电子信箱：raindy(at)fafu.edu.cn