彭作刚，博士，研究员，博士生导师。教育部“国家级青年人才”。主要从事鱼类多样性与演化方面的研究工作。主持国家自然科学基金、国家重点研发计划子课题等项目多项。担任学术期刊《Journal of Applied Ichthyology》（Subject Editor）、《PLoS ONE》（Academic Editor）编委；世界自然保护联盟物种存续委员会（IUCN/SSC）鲟鱼专家组成员、重庆市动物学会理事。近年来在《BMC Genomics》、《GigaScience》、《Molecular Biology and Evolution》、《Molecular Phylogenetics and Evolution》、《Science》以及《水生生物学报》等国内外重要学术刊物上发表论文80余篇。


教育经历（ACADEMIC DEGREES）
2002-2005中国科学院水生生物研究所博士
1999-2002西南师范大学生命科学学院硕士
1995-1999西南师范大学生命科学学院学士
工作经历（PROFESSIONAL EXPERIENCE）
2010至今 西南大学生命科学学院 研究员
2009-2010 西南大学生命科学学院 ****
2007-2009Georgia Institute of TechnologyResearch Scientist
2005-2007 中国科学院水生生物研究所 助理研究员


研究方向（RESEARCH INTERESTS）
主要以鱼类为对象，围绕基因组、演化、生物多样性（GEB）开展研究工作
1.分子系统学（Molecular Systematics）
2.保护遗传学（Conservation Genetics）
3.进化基因组学（Evolutionary Genomics）
4.环境DNA（Environmental DNA; eDNA）

主持项目（RESEARCH GRANTS）
1.国家自然科学基金项目
2.国家重点研发计划子课题
3.中央高校基本科研业务费重点/团队项目
4.教育部新世纪优秀人才支持计划项目


代表论著（PUBLICATIONS）
*同等贡献（* equal contribution）；#通讯作者（# corresponding author）
1.Shao F., Ludwig A., Mao Y., Liu N.,Peng Z^#. 2020. Chromosome-level genome assembly of the female western mosquitofish (Gambusia affinis).GigaScience, 9: giaa092.
2.Shu L., Ludwig A.^#,Peng Z^#. 2020. Standards for methods utilizing environmental DNA for detection of fish species.Genes, 11: 296.
3.Zhao Q., Zhang R., Xiao Y., Niu Y., Shao F., Li Y.,Peng Z^#. 2020. Comparative transcriptome profiling of the loachesTriplophysa bleekeriandTriplophysa rosareveals potential mechanisms of eye degeneration.Frontiers in Genetics, 10: 1334.
4.Shao F., Han M.,Peng Z^#. 2019. Evolution and diversity of transposable elements in fish genomes.Scientific Reports, 9: 15399.
5.Shen Y., Hubert N., Huang Y., Wang X., Gan X.,Peng Z., He S. 2019. DNA barcoding the ichthyofauna of the Yangtze River: Insights from the molecular inventory of a mega-diverse temperate fauna.Molecular Ecology Resources, 19: 1278-1291.
6.Luo D., Li Y., Zhao Q., Zhao L., Ludwig A.^#,Peng Z^#. 2019. Highly resolved phylogenetic relationships within order Acipenseriformes according to novel nuclear markers.Genes, 10: 38.
7.Xie M., Ming Y., Shao F., Jian J., Zhang Y.,Peng Z^#. 2018. Restriction site-associated DNA sequencing for SNP discovery and high-density genetic map construction in southern catfish (Silurus meridionalis).Royal Society Open Science, 5: 172054.
8.Shao F., Wang J., Xu H.,Peng Z^#. 2018. FishTEDB: a collective database of transposable elements identified in the complete genomes of fish.Database, 2018: bax106.
9.Li Y., Ludwig A.,Peng Z^#. 2017. Geographical differentiation of theEuchiloglanisfish complex (Teleostei: Siluriformes) in the Hengduan Mountain Region, China: Phylogeographic evidence of altered drainage patterns.Ecology and Evolution, 7: 928-940.
10.Zhao J., Xu D., Zhao K., Diogo R., Yang J.,Peng Z^#. 2016. The origin and divergence of Gobioninae fishes (Teleostei: Cyprinidae) based on complete mitochondrial genome sequences.Journal of Applied Ichthyology, 32: 32-39.
11.Liu M., Zhang Z.^#,Peng Z^#. 2015. The mitochondrial genome of the water spiderArgyroneta aquatica(Arachnida: Araneae: Cybaeidae).Zoologica Scripta, 44: 179-190.
12.Zhao H., Sullivan J.P., Zhang Y.,Peng Z^#. 2014.Paraqianlabeo lineatus, a new genus and species of labeonine fishes (Teleostei: Cyprinidae) from South China.Zootaxa, 3841: 257-270.
13.Diogo R.,Peng Z., Wood B. 2013. First comparative study of primate morphological and molecular evolutionary rates including muscle data: implications for the tempo and mode of primate and human evolution.Journal of Anatomy, 222: 410-418. (Journal of AnatomyBest Paper Winner 2013)
14.Wang J., Yu X., Zhao K., Zhang Y., Tong J.^#,Peng Z^#. 2012. Microsatellite development for an endangered breamMegalobrama pellegrini(Teleostei, Cyprinidae) using 454 sequencing.International Journal of Molecular Sciences, 13: 3009-3021.
15.Park J.*,Peng Z.*, Zeng J., Elango N., Park T., Wheeler D., Werren J.H., Yi S.V. 2011. Comparative analyses of DNA methylation and sequence evolution usingNasoniagenomes.Molecular Biology and Evolution, 28: 3345-3354.
16.Nasonia Genome Working Group (Peng Z.as a member). 2010. Functional and evolutionary insights from the genomes of three parasitoidNasoniaspecies.Science, 327: 343-348.
实验室欢迎对进化遗传学感兴趣的优秀同学/同事加入（本科生、研究生、博士后等）！

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