副教授 硕士生导师
性别：男
学历：博士研究生毕业
学位：工学博士
在职信息：在职
所在单位：生物学院
办公地点：生物学院一号楼4楼


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个人简介：白明泽，博士，副教授，硕士生导师。重庆市生物信息学会理事，国家自然科学基金网评专家，Frontiers in Plant Science (Bioinformatics and Computational Biology)杂志审稿人。

教育经历 [1] 1999.9-2003.7
重庆邮电学院 | 理学学士
[2] 2003.9-2006.6
重庆邮电大学 | 工学硕士
[3] 2007.9-2012.12
电子科技大学 | 工学博士

研究方向 [1] 蛋白质组学大数据存储、分析方法研究

[2] 生物组学大数据存储与知识挖掘


联系方式 邮编：

通讯/办公地址：

邮箱：

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副教授 硕士生导师
性别：男
学历：博士研究生毕业
学位：工学博士
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所在单位：生物学院
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研究领域
1）生物组学大数据存储与知识挖掘
与欧洲生物信息学研究所PRIDE团队合作建立了多组学数据检索平台OmicsDI（http://www.omicsdi.org），OmicsDI(Omics Discovery Index)整合了蛋白质组学、转录组学、代谢组学和基因组学的多组学实验数据，并面向全球提供类似于PubMed的实验数据检索服务、相似实验推荐服务以及实验数据关联挖掘服务等等。目前该平台已包含来自3个大洲的11个数据库的数据，总实验数目已经超过80,000。
2）蛋白质组学大数据存储、分析方法研究
拟发展包含聚类、机器学习等模型的蛋白质组学大数据存储分析平台，为发现新biomarker、提高蛋白质的鉴定质量和数量贡献力量。
主持国家自然科学基金等国家级项目1项，另外主持参与国家级、省部级科研项目10余项，发表SCI检索论文10余篇，其中以共同第一作者署名在Nature Biotechnology发表论文1篇（OmicsDI）。近年来讲授研究生《生物信息学算法》，本科生《生物信息学算法》、《生物数据挖掘》等课程，参与省部级重点教改项目1项，一般项目2项，发表教改论文多篇。


论文成果
校园生物多样性数据库建设及其在普通生物学教学中的作用.安徽农业科学.2013,41(6):2372-2373
Performance of LAMMPS code on Intel quad-core Xeon.Proceedings of the 2009 Sixth IFIP International Conference on Network and Parallel Computing.2009:156-160
目标-诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展, 生物化学与生物物理进展.2016(43(7)):661-672
Study on human P53 downstream genes' consensus sequences.Journal of Chongqing University of Posts and Telecommunications (Natural Science，重庆邮电大学学报自然科学版).2006(18(4)):544-547
Molecular response to ultrashort laser pulses.Computing in Science and Engineering.2009(11(3)):47-53
Molecular calculations for HeH+ with two-center correlated orbitals.Science in China Series B: Chemistry.2009(52(12)):2249-2256
Molecular Dynamics Simulation of the Laser-Induced Melting of an Al Nanofilm.Acta Physico-Chimica Sinica(物理化学).2010(26(12)):3143-3149
Application of hybrid MPI + TBB parallel programming model for molecular dynamics simulation.Application Research of Computers(计算机应用研究).2012(29(5)):1772-1774
Performance analysis and improvement of parallel molecular dynamics algorithm based on OpenMP.Journal of Computer Applications(计算机应用).2012(32(1)):163-166
Computer simulations of laser-induced melting of aluminum.Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section B: Beam Interactions with Materials and Atoms.2013(301):36-40
An SPMD-Like Algorithm for Parallelizing Molecular Dynamics Using OpenMP.Computing in Science & Engineering.2013(15(4)):4
Fast Intra prediction algorithm for quality scalable video coding.Signal, Image and Video Processing.2016(10(4)):625-632
A fast mode decision algorithm applied in medium-grain quality scalable video coding.Journal of Visual Communication and Image Representation.2016(34):78-88
Omics Discovery Index-Discovering and Linking Public Omics Datasets.Nature Biotechnology
偶氮苯调控DNA解链的机理研究.重庆邮电大学学报（自然科学版）.2009,21


专利
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著作成果
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科研项目
生物技术与产业信息共享平台的设计和构建
PBX炸药颗粒粉压制过程细观力学行为的数值模拟研究
基于质谱网络和谱图归档库的内源肽鉴定方法
BD2K Centers of Excellence for Big Data Computing 子项目
“蛋白质组信息学关键技术及分析系统研发”子项目
冲击波引爆含能材料的量子分子动力学模拟


科研团队
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