韩智杰
学术学位硕士生导师

副教授



zhijiehan@cqmu.edu.cn

基础医学院





学科信息


个人简介
基本情况：
韩智杰博士本、硕、博分别毕业于贵州大学、哈尔滨工业大学和重庆大学，生物信息学专业。自2020年起，供职于重庆医科大学基础医学院，特聘副教授，硕士研究生导师。
科研方向：
利用生物信息学方法，重点关注和研究神经类疾病（CNS disorders）在基因组和转录组层面上的发病机理。兴趣点主要集中在：基因组和转录组数据分析，二代测序数据分析， 单细胞测序数据分析。 Genome-wide association study (GWAS)， Single nucleotide polymorphism (SNP)， Long non-coding RNA (lncRNA)， Expression quantitative trait loci (eQTL)， Alzheimer’s Disease (AD)， Multiple sclerosis (MS)。此外，meta分析，孟德尔随机化，算法和数据库的开发也有涉猎。
发表论文：
1. He Y, Wang L, Tang J, Han Z^* Genome-wide identification and analysis of the methylation of lncRNAs and prognostic implications in the glioma. Front Oncol. 2020; doi: 10.3389/fonc.2020.607047.
2. Han Z, He D, et al. Genetic variant rs** regulates the expression of indoleamine 2,3-dioxygenase 1 in brain regions. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2020; doi:10.1073/pnas..
3. Han Z, Wei B, et al. PARK16 rs708730 polymorphism decreases Parkinson’s Disease risk in European ancestry population: a meta-analysis. Journal of Geriatric Medicine. 2020; doi: https://doi.org/10.30564/jgm.v1i2.798.
4. Han Z, Xue W, et al. Genome-wide identification and analysis of the eQTL lncRNAs in multiple sclerosis based on RNA-seq data. Brief Bioinform. 2020, 21: 1023-1037.
5. Han Z, Hua J, et al. Integrating the RNA-seq data from various studies to explore multiple sclerosis-related lncRNAs and their functions. Front Genet. 2019; 10: 1136.
6. Han Z, Xue W, et al. Identification of key long non-coding RNAs in the pathology of Alzheimer's Disease and their functions based on genome-wide associations study, microarray, and RNA-seq data. J Alzheimers Dis. 2019; 68: 339-355.
7. Han Z, Xue W, et al. Identification of novel immune-relevant drug target genes for Alzheimer's Disease by combining ontology inference with network analysis. CNS Neurosci Ther. 2018; 24: 1253-1263.
8. Han Z, Qu J, et al. Genetic variant rs755622 regulates expression of the multiple sclerosis severity modifier D-dopachrome tautomerase in a sex-specific way. Biomed Res Int. 2018; 2018: **.
9. Han Z, Qu J, et al. Analyzing 74,248 samples confirms the association between CLU rs** polymorphism and Alzheimer's Disease in caucasian but not Chinese population. Sci Rep. 2018; 8: 11062.
10. Han Z, Jiang Q, et al. Analyzing large-scale samples confirms the association between the rs** polymorphism and lung cancer susceptibility. Sci Rep. 2015; 5: 15642.
11. Han Z, Qu J, et al. Using mathematical modeling to analyze the mortality of Tetranychus urticae infested by Hirsutella thompsonii. Chinese Journal of Applied Entomology. 2013; 50: 406-412.
12. Ding W, Xu L, Zhang L, Han Z, Jiang Q, Wang Z, Jin S. Meta-analysis of association between TCF7L2 polymorphism rs** and type 2 diabetes mellitus. BMC Med Genet. 2018; 19: 38.
13. Tan R, Wang J, Wu X, Wan G, Wang R, Ma R, Han Z, Zhou W, Jin S, Jiang Q ERDS-pe: A paired hidden Markov model for copy number variant detection from whole-exome sequencing data. In: Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2016 IEEE International Conference on, 2016. IEEE, pp 141-144.
14. Jiang Q, Wang J, Wu X, Ma R, Zhang T, Jin S, Han Z, Tan R, Peng J, Liu G, Li Y, Wang Y. LncRNA2Target: a database for differentially expressed genes after lncRNA knockdown or overexpression. Nucleic Acids Res. 2015; 43: D193-196.
招生说明：
从事生物信息学研究的人大致可以粗略地分为三类。第一类主要由数学相关专业出身的人组成。他们主要从事设计和开发底层算法的工作。第二类主要由计算机相关专业出身的人组成。他们主要进行生物信息学软件和数据库的开发。包括我在内的第三类，主要由生物医学相关专业出身的人组成。他们致力于利用生物信息学方法解决生物学问题。
我的研究工作（包括正在进行和计划的）主要涉及三个方向。它们全部都围绕神经类疾病展开。首先，最主要的一个方向是基因组和转录组层面上的数据分析和挖掘，包括：芯片、bulk和单细胞测序等的数据。其次，一些源自公卫领域的计算工作有时也会开展。比如：meta分析、孟德尔随机化等。再次，如果自身的课题需要，也会进行某些新的算法和数据库的开发。当然，我还只是科研界的一个小学生。大概在未来很长的一段时期内，都只能以一种边学习边工作的方式开展我的课题。所以我们可以抽时间，一起来多读读论文，学学相关的课程。
我希望我未来学生在科研上的目标和我的大致相符，并以研究探索和阅读撰写论文为乐趣。我很愿意鼓励你将科学研究作为一生的事业。若能如此，我们的利害得失可能更容易趋近于一致。在这个前提下，我希望可以为我的团队创造一个自由的环境。让权利义务对等。每个人被充分授权，同时承担相应的结果。如合作者般对待，如朋友般相处。我们相互学习，共同进步。把科研工作当成一场游戏，我们一起闯关、打怪、升级。如果你有不错的思路，我会尽量让你自由地安排时间、课题等等方面。如果你完全是一个新手，我会详细地告诉你每一步该怎么做，直到你能独当一面。当然，我猜测更多的情况是介于这两者之间。我将你视为我的投资人，你投资了时间、精力和青春，我会和你一起做一些努力，以保证你的投资在未来几年里不断增值。同时，我希望因为你的投资，让我的团队越发强大。
以上就是我想对我未来学生所说的话。欢迎生物医学、计算机和数学等相关专业背景的同学报考我的研究生（如果你没有这些背景却依然喜欢，同样欢迎）。也欢迎感兴趣的本科生过来一起工作学习。
邮箱：zhijiehan@cqmu.edu.cn








研究方向
生物信息学与神经系统疾病