经过近二十年的发展，软件所研究生教育已形成硕士（包括同等学力硕士）、博士（包括硕博连读、直博、同等学力博士）及博士后多层次、多类型的人才培养体系；现有“计算机科学与技术”一级学科博士点和硕士点；并建有“计算机科学与技术”博士后科研工作流动站。

迄今，软件所已累计招收研究生1801人，博士后109人。现有在岗博士生指导教师37人，硕士生指导教师84人；在学博士生225人，硕士生289人，博士后6人。近年来，软件所在保证培养质量的前提下，利用国家扩招的契机，稳步扩大了招生规模，并且从2003年起开始招收外国留学生。软件所现已成为我国计算机专业人才培养的重要基地之一。