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SPR蛋白质芯片在输入性疟疾筛查中的应用

本站小编 Free考研考试/2021-12-26

陈凡1, 何建安2, 董瑞玲2, 杨凡1, 刘厚明3, 顾大勇4, 王伟4
1. 湖北大学 生命科学学院 省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室,湖北 武汉 430062;
2. 深圳市国际旅行卫生保健中心,广东 深圳 518033;
3. 深圳市第三人民医院检验科,广东 深圳 518112;
4. 深圳大学第一附属医院检验科 深圳市第二人民医院检验科,广东 深圳 518035
收稿日期:2020-08-10;接收日期:2020-10-20;网络出版时间:2020-11-19
基金项目:国家重点研发计划(No. 2018YFC0809200),深圳市第二人民医院临床研究项目(No. 20203357006) 资助

摘要:输入性疟疾已是我国疟疾防控的主要危险因素,如何对入境人员进行疟疾快速筛查是急需解决的难题。蛋白质芯片已被广泛应用于高通量筛选和诊断,本研究尝试构建了表面等离子共振技术(Surface plasmon resonance,SPR) 蛋白芯片用于恶性疟疾的快速检测。采用聚乙二醇高分子处理的特异性吸附表面,以恶性疟疾特异性抗原富组氨酸蛋白Ⅱ (Histidine-rich protein Ⅱ,HRP2) 作为捕获探针,建立疟疾的微阵列芯片,并对芯片的最佳抗原固定浓度,检测的灵敏性和特异性,以及抗干扰能力进行了分析。该芯片可成功应用于恶性疟疾的筛查,具有无标记、即时快速的特点,与荧光定量PCR法相比,两种方法在敏感度和特异性方面无统计学差异。研究结果为一步研制疟疾分型鉴定蛋白质芯片奠定了基础,有利于对入境人员进行疟疾快速筛查。
关键词:蛋白质芯片表面等离子共振技术疟疾筛查
Application of SPR protein chip in screening for imported malaria
Fan Chen1, Jian'an He2, Ruiling Dong2, Fan Yang1, Houming Liu3, Dayong Gu4, Wei Wang4
1. State Key Laboratory of Biocatalysis and Enzyme Engineering, School of Life Science, Hubei University, Wuhan 430062, Hubei, China;
2. Shenzhen International Travel Health Care Center, Shenzhen 518033, Guangdong, China;
3. Clinical Laboratory of Shenzhen Third People's Hospital, Shenzhen 518112, Guangdong, China;
4. Department of Laboratory Medicine, the First Affiliated Hospital of Shenzhen University, Shenzhen Second People's Hospital, Shenzhen 518035, Guangdong, China
Received: August 10, 2020; Accepted: October 20, 2020; Published: November 19, 2020
Supported by: National Key Research and Development Program of China (No. 2018YFC0809200), Clinical Research Project of Shenzhen Second People's Hospital (No. 20203357006)
Corresponding author: Dayong Gu. Tel: +86-755-83366388-8833; Fax: +86-755-83356952; E-mail: wanhood@163.com;
Dayong Gu. Tel: +86-755-83366388-8833; Fax: +86-755-83356952; E-mail: wanhood@163.com.

Abstract: Imported malaria has become a major risk factor for malaria prevention and control in China. How to screen malaria quickly for people entering China is an urgent problem to be solved. Protein microarrays are widely used in high-throughput screening and diagnosis. In this study, surface plasmon resonance (SPR) technique for malaria detection was established by using the specific adsorption surface treated by polyethylene glycol polymer, and the malaria specific antigen HRP2 was used as capture probe. The optimal concentration of antigen, sensitivity and specificity of detection, as well as anti-interference ability of the chip were analyzed. The SPR protein chip was applied to detect specific antibodies of malignant malaria in serum with the advantage of label-free, instant and fast. Compared with fluorescence quantitative PCR, there were no significant difference in sensitivity and specificity between the two methods. This study lays a foundation for further development of protein microarray for malaria typing identification, and it is conducive to the rapid screening of malaria for people entering.
Keywords: protein chipsurface plasmon resonancemalariascreening
疟疾(Malaria) 是一种由疟原虫引起的、经蚊叮咬而传播的重要虫媒传染病,极大地威胁着人类的健康。近年来疟疾的防治已经取得了很大的进展,但全球范围内仍有33亿人面临疟疾感染的威胁,2018年有2.28亿新发病例,死亡人数高达40.5万[1-3]。我国自2010年启动消除疟疾行动计划以来,疟疾疫情得到了很好的控制[4-5]。但随着我国经济发展,近年来输入性病例呈上升趋势[6-9]。早期疟疾感染者因疟原虫含量低,易造成临床漏检,常常是潜在的疟疾传染源[10]。目前疟疾的主要诊断方法包括:显微镜镜检、免疫学诊断、PCR检测技术等。尽管显微镜镜检仍是疟疾诊断的金标准,但是显微镜镜检方法最大的问题在于检测结果强烈依赖检验人员的专业技术水平,不适合快速检测和大规模样品的筛查;免疫学检测和PCR检测方法提高了疟疾检出的灵敏度,但是操作步骤较多,耗时长,仍然不能满足对入境人员快速筛查的需求[11]
蛋白质芯片(Protein chips) 是高通量、高灵敏度、易于操作、实用性高的蛋白质研究工具[7]。表面等离子体共振(Surface plasmon resonance,SPR) 技术是检测生物传感芯片上配位体与分析物作用的一种前沿技术[12-13]。其突出的特点是可以实时、在线检测,而且不需要标记及纯化,耗样量很少。将传感器技术与蛋白芯片技术相结合,既可以充分发挥传感器技术的高特异性、高灵敏度、不需标记及纯化、实时检测等特点,又可进一步利用芯片技术的高通量、高速度、高效率的特点,从而实现对检测样品的快速、简单、准确的检测。利用SPR蛋白芯片技术对疟疾进行快速鉴定,对疟疾的筛查具有重要意义。
1 材料与方法1.1 疟疾样本样本来源2018年1月–2019年10月从深圳市国际旅行卫生保健中心和深圳市第三人民医院收集的疟疾患者76例,在高热时采集全血标本保存备用(EDTA-K2抗凝)。未感染疟疾的健康人血清来自深圳市第二人民医院保留血清样本(伦理批件号KS20180130001)。
1.2 仪器与试剂SPR分析仪(美国GWC公司,SPR imager@ Ⅱ型)、SPR检查芯片(广州高通)、活化液EDC/NHS:1-乙基-3-(3-二甲基氨丙基)-碳化二亚胺(EDC) 和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)、封闭液乙醇胺、再生液甘氨酸、疟原虫核酸测定试剂盒(上海之江生物)、PCR扩增仪(美国ABI7 500)。
1.3 SPR蛋白芯片的制备和条件优化1.3.1 芯片的制备① 芯片的表面改性:芯片经过去离子蒸馏水、95%乙醇的清洗后再用等离子清洗仪清洗10 min;然后将芯片立即浸泡于现配的1 mmol/L SH-PEG- COOH (MW3400) 溶液中,氮气保护下静置芯片8–10 h,乙醇清洗,氮气吹干。②芯片的活化:分别溶解0.383 9 g EDC和0.430 g NHS,配制成10 mL EDC/NHS活化液,浸泡芯片活化30 min,水洗冲干。③抗原点样:用乙酸-乙酸钠(0.2 mmol/L,pH 4.5) 与甘油配制成10%的甘油点样液,将HRP2抗原、NS1抗原和人类IgG用点样液作5倍稀释处理后,取0.5 μL混合液点样于芯片表面的位置,室温固定2 h。④芯片表面封闭:将完成点样的SPR芯片,固定并安装在SPR分析仪上,用PBS液调试最佳共振角(最佳共振角约为70°至100°之间),基线平稳后,用封闭液乙醇胺处理封闭芯片未反应的活化表面。完成后用再生液处理,去除物理吸附的物质和封闭液,然后可上样检测。
1.3.2 抗原浓度选择确定反应体系的离子强度、pH值后,以乙酸-乙酸钠缓冲液稀释HRP2抗原,分别配制成HRP2抗原浓度为600 μg/mL、500 μg/mL、300 μg/mL和200 μg/mL的溶液,点样芯片后检测SPR信号,找到最佳抗原点样浓度。
1.3.3 SPR蛋白芯片灵敏性和特异性检测将特异性HRP2抗原以最佳点样浓度固定在SPR芯片上,分别以NS1抗原(200 μg/mL) 和IgG (100 μg/mL) 作为对照,按照3×4设计芯片,检测HRP2抗体分别按照1:500、1:1 000、1:2 000、1:4 000、1:5 000、1:6 000倍稀释,以2 μL/s的流速进样检测,测定芯片灵敏度。在同一张芯片上点上特异性的HRP2抗原和非特异性NS1抗原,另外点上点样液作为对照点,在SPR仪上检测HRP2抗体的阳性血清,测定芯片特异性。
1.3.4 检测样本的筛选分别用SPR蛋白芯片检测阳性患者全血和血清样本,检测信号背景,特征信号与背景信号区别大的,即为优选检测样本。
1.3.5 芯片抗干扰性能检测用制备好的SPR蛋白芯片检测未感染疟疾的健康血清样品,观测信号变化幅度。再用甘氨酸处理芯片后,检测其再生能力。
1.4 SPR蛋白芯片技术在疟疾筛查中的应用1.4.1 显微镜镜检每份血样均涂制厚薄血膜,吉氏染色后油镜下观察血涂片。根据染色后红细胞内找到疟原虫的不同阶段形态(滋养体、裂殖体或环状体) 为确认标准。血片由深圳市国际旅行保健中心同一专家进行显微镜镜检。
1.4.2 SPR检测和分析将点样好的SPR芯片安装在SPR分析仪(美国GWC公司,SPR imager@Ⅱ型) 上,以PBS缓冲溶液(10 mmol/L,pH 7.4) 为流动相,流速2 μL/s,待基线平稳后,用封闭液乙醇胺(1 mol/L,pH 8.5)处理10 min,封闭芯片未反应的活化表面。取5 μL临床样本血清溶于995 μL PBS缓冲溶液,然后在微流控进样系统的控制下,加入SPR反应池中,待检测的血清样本经过PBS稀释后可上样进行检测,每个样本检测完后可用再生液甘氨酸(100 mmol/L,pH 2.0) 再生芯片,然后进行下一个样本的测定。SPR信号通过SPR分析仪BIA evaluation软件系统模拟的反应曲线图来进行检测和分析。
1.4.3 RT-PCR参照疟原虫核酸检测试剂盒说明书进行,试剂盒采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR) 技术结合荧光探针技术对恶性疟原虫特异性核酸片段进行核酸检测。
1.5 统计学处理应用SPSS20.0进行统计数据分析,采用配对四格表资料χ2检验,计量资料采用t检验,P < 0.05为差异有统计学意义。
2 结果与分析2.1 芯片的设计点样设计矩阵为3×4,分成3行进行排列,分别以疟疾特异性HRP2抗原、登革热NS1抗原和人IgG点样,其中IgG作为芯片的质控,把PBS设为空白对照点。设计的芯片图如图 1所示。
图 1 芯片点样设计图 Fig. 1 Chip sample design drawing. The dot matrix is 3×4, the first line is malaria specific HRP2 antigen, the second line is dengue non-structural protein NS1 antigen, the third line is IgG, as the chip quality control, one of the points is PBS as the blank control point.
图选项




2.2 抗原点样浓度确定摸索最佳HRP2抗原固定浓度是建立SPR蛋白芯片检测疟疾的首要条件。实验结果表明HRP2抗原浓度为高于300 μg/mL时,检测信号基本饱和,低于300 μg/mL时,检测信号随着抗原的浓度减低而显著减弱,HRP2抗原浓度为低于100 μg/mL未能检测到SPR信号。因此,HRP2抗原浓度为300 μg/mL时,检测信号最佳(图 2)。
图 2 HRP2抗原固定浓度的摸索 Fig. 2 Exploration of fixed concentration of HRP2 antigen.
图选项




2.3 SPR芯片检测疟疾HRP2抗体的灵敏度和特异性HRP2最佳固定浓度为300 μg/mL时,分别用含14 μg/mL、7.0 μg/mL、3.5 μg/mL、1.75 μg/mL、1.4 μg/mL和1.17 μg/mL浓度的HRP2抗体检测。结果显示在HRP2抗体为1.4 μg/mL仍有检测信号,1:6 000倍稀释(浓度为1.17 μg/mL) 无法检出,最低检测限为1.4 μg/mL左右。由Igor分析软件处理,去除空白对照值后作图如下,对应的强度(Intensity) 值如图 3A所示,具有较好的灵敏度。随着抗体浓度的增高,信号强度也随之增加(图 3B)。特异性检测结果显示HRP2点样点有特异性信号出现,而对照样品NS1探针点没有明显的信号变化(图 3C)。表明SPR蛋白芯片能特异性地检测疟疾特异性HRP2抗体。
图 3 SPR蛋白芯片检测HRP2抗体的灵敏度和特异性 Fig. 3 SPR protein chip was used to detect the sensitivity and specificity of HRP2 antibody. (A) Detection signal of different antibody concentration. (B) SPR chip was used to detect the dose response of HRP2 antibody; the independent experiment was repeated six times. (C) Detection signal of different antigens.
图选项




2.4 SPR蛋白芯片对全血和血清样本的检测用SPR蛋白芯片检测全血和血清样本时,均可以检测到HRP2的特征信号,但全血样本的其他信号背景较多,且与HRP2特征信号区别不是很明显(图 4A)。而在血清样本中,其他背景信号与HRP2特征信号区别明显(图 4B),表明该系统适合检测血清样本。
图 4 SPR蛋白质芯片检测疟疾全血标本(A) 和疟疾血清样本(B) Fig. 4 The SPR protein chip was used to detect malaria blood samples (A) and malaria serum samples (B).
图选项




2.5 SPR蛋白芯片的抗干扰性检测应用SPR蛋白芯片直接检测阴性血清样品,SPR信号变化较小,无特异性的阳性信号,用甘氨酸处理后,芯片的信号背景快速降低,说明蛋白芯片具有良好的再生功能,表明芯片具有良好的抗蛋白质干扰及较好的抗非特异性吸附能力(图 5)。
图 5 SPR蛋白芯片抗干扰能力检测 Fig. 5 Detection of anti-interference ability of SPR protein chip.
图选项




2.6 病人样本检测2.6.1 血液涂片镜检待检血液样本涂片后,经吉氏染色后油镜下观察,如果发现疟原虫大滋养体、裂殖体或环状体之一(图 6),即可判断该样本疟疾感染为阳性。
图 6 血液涂片镜检下的疟原虫形态 Fig. 6 Plasmodium morphology under blood smear microscopy.
图选项




2.6.2 SPR芯片检测方法与荧光定量PCR方法的比较76例经血涂片确诊的疟疾标本分别用SPR蛋白芯片技术和荧光定量PCR进行检测,结果见表 1。与荧光定量PCR方法相比,SPR芯片技术灵敏度为96.5%,特异性为94.7%,阳性预警值为98.2%,阴性预警值为90.0%,总一致性为96.1%。采用配对χ2检验结果表明两种检测方法比较差异无统计学意义(P > 0.05),说明SPR蛋白芯片检测方法与RT-PCR方法性能基本相当,可以满足临床上疟疾快速检测的要求。
表 1 SPR蛋白芯片技术与荧光定量PCR的结果比较Table 1 Comparison of results between SPR protein chip technology and fluorescence quantitative PCR
SPR protein chipRT-PCRTotalPositive warning value (%)Negative warning value (%)
+
+5515698.2
2182090.0
Total571976
Sensitivity (%)96.5
Specificity (%)94.7
χ2=0.33, P > 0.05, there was no significant difference between the two methods.

表选项


3 讨论近年来,由于疟原虫对药物的耐药性增强,境外人员输入性传染增加,疟疾的快速诊断对疟疾的防控显得尤为重要[14-16]。输入性疟疾患者中,恶性疟疾是目前危害最大、患病率最高的种类。HRP2是恶性疟原虫分泌的一种特有的水溶性蛋白,是疟原虫红内期的重要抗原,主要是由生活在完整的受染红细胞中的发育期原虫所合成,并可主动地从受染红细胞排出到血清中,HRP2是构建疟疾疫苗的重要候选抗原,也是目前用于疟疾诊断最重要的抗原[17]。本研究将疟原虫特异性抗原HRP2固定在金芯片表面(图 1),结合SPR传感器系统进行分析[18-19],用聚乙二醇高分子处理吸附表面后,发现HRP2抗原浓度为300 μg/mL时,检测信号最佳(图 2)。在此固定抗原浓度上检测HRP2抗体时,具有较好的灵敏度(图 3A),并与抗体浓度呈剂量依赖关系(图 3B),而且对照样品NS1探针点没有明显的信号变化,显示出较好的特异性(图 3C)。表明SPR蛋白芯片能特异性地检测恶性疟疾特异性HRP2抗体。用SPR蛋白芯片检测全血和血清样本时,发现在血清样本中,其他背景信号与HRP2特征信号区别明显,表明该系统适合检测血清样本(图 4)。而抗干扰实验表明芯片具有良好的再生及较好的抗非特异性吸附能力(图 5)。临床上检测疟疾常用的免疫学检测方法是胶体金法,然而早期疟疾感染者因疟原虫含量低,易造成临床漏检。基于核酸检测的PCR技术可大大提高检测的灵敏度,但临床上样本较少,使得PCR检测的耗费较高。而在输入性疟疾检测时,常用PCR检测技术对大范围样本进行筛查,以提高检测的灵敏度。本研究利用SPR蛋白芯片对显微镜检确诊的76例疟疾患者血清进行分析,发现检查结果的敏感性和特异性与荧光定量PCR十分接近,没有显著性差异(表 1)。
本研究建立一种恶性疟疾检测的新方法和新技术,具有如下的优势:(1) 高特异性:本项目采用疟疾特异性抗原的作为反应底物,充分暴露隐藏在蛋白质深处的隐性表位,提高对目标抗体的识别能力;(2) 超灵敏:采用SPR技术,实现了信号的放大,其检测灵敏度高于酶联免疫吸附(ELISA) 法[20-21];(3) 无标记检测:避免了免疫学检测方法中需要酶标、荧光、化学发光物质的标记,容易出现交叉污染等缺点;(4) 低消耗:单次实验的样品消耗量仅为5 μL,比传统的检测方法节省样品10–100倍;(5) 快速:芯片准备好了后,样本检测在20 min内就得到实验结果,操作简单迅速,适合疟疾快速筛查。
本研究结合蛋白芯片和SPR技术针对恶性疟的快速诊断作了积极有效的探索。我国大型城市的输入性疟疾中,还有部分是间日疟、三日疟和卵形疟,因此,可以考虑建立疟疾的多个特异性抗原结合芯片,可以一步鉴定出疟疾类型,为临床治疗和输入性疟疾防控提供指导建议[22-25]
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  • 通过“现代微生物学技术”课程教学培养研究生创新能力的实践
    孙东昌浙江工业大学生物工程学院,浙江杭州310000收稿日期:2020-07-31;接收日期:2020-10-13;网络出版时间:2020-10-22基金项目:浙江工业大学研究生教改项目(No.2017202),浙江工业大学研究生示范性全英文(双语)课程项目(No.2018111),浙江省重点研发计 ...
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  • 组学技术在产油微生物中的应用
    卢恒谦,陈海琴,唐鑫,赵建新,张灏,陈卫江南大学食品学院,江苏无锡214122收稿日期:2020-10-08;接收日期:2021-02-04基金项目:国家自然科学基金(Nos.32072186,31722041)资助作者简介:陈海琴??博士,江南大学教授、博士生导师。主要从事食品微生物学及分子生物学 ...
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  • 枯草芽孢杆菌在系统与合成生物技术中研究进展及工业应用
    康倩1,2,向梦洁1,2,张大伟1,21.中国科学院天津工业生物技术研究所中国科学院系统微生物工程重点实验室,天津300308;2.中国科学院大学,北京100049收稿日期:2020-10-07;接收日期:2021-01-26;网络出版时间:2021-03-15基金项目:国家重点研发计划(No.20 ...
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  • 酿酒酵母基因编辑技术研究进展
    李宏彪1,梁晓琳1,2,周景文1,21.江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室,江苏无锡214122;2.江南大学未来食品科学中心,江苏无锡214122收稿日期:2020-08-25;接收日期:2020-11-13基金项目:国家重点研发计划(No.2017YFC1600403),国家优秀青年科学基 ...
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  • 高通量自动化微生物微液滴进化培养与筛选技术及其装备化
    郭肖杰1,2,王立言3,张翀1,2,4,邢新会1,2,4,51.清华大学化学工程学系生物化工研究所,北京100084;2.工业生物催化教育部重点实验室,北京100084;3.清华大学无锡应用技术研究院生物育种中心,江苏无锡214000;4.清华大学合成与系统生物学中心,北京100084;5.清华大学 ...
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  • 基于CRISPR/Cas系统的黑曲霉基因组编辑技术
    郑小梅1,2,3,4,郑平1,2,3,4,孙际宾1,2,3,41.中国科学院天津工业生物技术研究所,天津300308;2.中国科学院系统微生物工程重点实验室,天津300308;3.中国科学院大学,北京100049;4.国家合成生物技术创新中心,天津300308收稿日期:2020-09-25;接收日期 ...
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  • 应用生物技术降解木质纤维素水解液中呋喃醛
    孙慧敏,邹丽花,郑兆娟,欧阳嘉南京林业大学化学工程学院,江苏南京210037收稿日期:2020-06-10;接收日期:2020-08-06;网络出版时间:2020-09-01基金项目:国家重点研发计划(No.2018YFA0902200)资助摘要:木质纤维素是地球上储量最为丰富的可再生有机碳资源,但 ...
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  • 体内连续进化技术的研究进展
    翟昊天,祁庆生,侯进山东大学微生物技术国家重点实验室,山东青岛266273收稿日期:2020-06-01;接收日期:2020-08-12;网络出版时间:2020-08-31基金项目:国家自然科学基金(Nos.31970082,31770101)资助摘要:实验室进化是遗传育种、提高微生物性能的重要方式 ...
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  • 双特异性抗体构建在肿瘤临床治疗中的应用
    王璐瑶,魏振华,熊伟佳,白素杭,喻长远,杨昭北京化工大学生命科学与技术学院,北京100029收稿日期:2020-06-06;接收日期:2020-08-04基金项目:中央高校基本科研业务费(No.buctrc201910),京津冀基础研究合作专项(No.19JCZDJC65800(Z)),国家重点研发 ...
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  • 显微注射法制备转基因家蝇技术的建立
    王蓝晨1,杨阳1,3,尚小丽2,3,王兵1,2,袁林2,朱贵明1,2,31.贵州医科大学生物与工程学院生物与医学工程重点实验室,贵州贵阳550025;2.贵州医科大学生物与工程学院生物技术工程研究中心,贵州贵阳550025;3.贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室,贵州贵阳550025 ...
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