百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析
外文标题：Gene Cloning and Sequence Analysis of Chitinase Gene in Zinnia elegans
文献类型：期刊
作者：张振鲁[1]
机构：中国人民大学环境学院,北京100872;吉林省农业科学院植物保护研究所/农业部东北农作物有害生物综合治理重点实验室,吉林长春130033;东北农业大学园艺学院,黑龙江哈尔滨150030;吉林省农业科学院植物保护研究所/农业部东北农作物有害生物综合治理重点实验室,吉林长春,130033;东北农业大学园艺学院,黑龙江哈尔滨,150030;中国人民大学环境学院,北京,100872
年：2013
期刊名称：安徽农业科学
期：25
页码范围：10256-10258,10398
增刊：增刊
所属部门：环境学院
语言：中文
ISSN：0517-6611
链接地址：http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_ahnykx201325015.aspx
DOI：10.3969/j.issn.0517-6611.2013.25.015
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基金：农业部转基因重大专项; 吉林省科技厅科技条件与平台建设—吉林省科技基础条件平台建设项目; 吉林省农科院植保所青年基金项目
关键词：百日草;几丁质酶基因;克隆;序列分析
摘要：[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析.[方法]以百日草“梦境”系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析.[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70％以上,其中与葡萄的同源性最高,为74％;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70％以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构.[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础.
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