汉江水体和沉积物中噬菌体特征研究

孙立宇^1,2, 尚韵依^1,2, 李治龙^1,2, 薛泽环², 刘唐^2,3,?

1. 北京大学深圳研究生院环境与能源学院, 深圳 5180552. 教育部水沙科学重点实验室, 北京大学环境工程系, 北京 1008713. 深圳大学化学与环境工程学院, 深圳 518061

收稿日期:2022-03-02修回日期:2022-04-06出版日期:2023-01-20发布日期:2023-01-20
通讯作者:刘唐, E-mail: liutang(at)szu.edu.cn

基金资助:国家自然科学基金(41907203)资助

Characteristics of Phages in Water and Sediments of Hanjiang River

SUN Liyu^1,2, SHANG Yunyi^1,2, LI Zhilong^1,2, XUE Zehuan², LIU Tang^2,3,?

1. School of Environment and Energy, Peking University Shenzhen Graduate School, Shenzhen 5180552. Key Laboratory of Water and Sediment Sciences (MOE), Department of Environmental Engineering, Peking University, Beijing 1008713. College of Chemistry Environmental Engineering, Shenzhen University, Shenzhen 518061

Received:2022-03-02Revised:2022-04-06Online:2023-01-20Published:2023-01-20
Contact:LIU Tang, E-mail: liutang(at)szu.edu.cn

摘要/Abstract

摘要： 基于2014年3月和10月汉江中下游6个断面的水体和沉积物监测样品, 获得384个高质量vOTUs (viral Operational Taxonomic Units)。研究表明, vOTUs中95%以上隶属Caudovirales(有尾噬菌体目), 丰度居前3位的科分别为Myoviridae(肌尾噬菌体科)、Siphoviridae(长尾噬菌体科)和Podoviridae(短尾噬菌体科)。主坐标分析和相似性分析结果表明, 沉积物中病毒群落结构相对稳定, 而水体中群落易随季节发生变化, 同流域的水体和沉积物中群落可能具有连通性。宿主来自2域(界)19门, 丰度最高的宿主是 Proteobacteria门(变形菌门)。88%的vOTUs具有单一的门水平的宿主, 有3个vOTUs 跨越5个门。跨域(界)感染的vOTUs在感染古菌界Thermoproteota门的同时, 最常见的是感染细菌界的Bacteroidota门(拟杆菌门)。与水体相比, 沉积物中宿主的群落组成更加多样。Pearson相关分析表明, 噬菌体与其宿主的组成在门水平上一致。

引用本文

孙立宇, 尚韵依, 李治龙, 薛泽环, 刘唐. 汉江水体和沉积物中噬菌体特征研究[J]. 北京大学学报自然科学版, 2023, 59(1): 125-132.
SUN Liyu, SHANG Yunyi, LI Zhilong, XUE Zehuan, LIU Tang. Characteristics of Phages in Water and Sediments of Hanjiang River[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Pekinensis, 2023, 59(1): 125-132.





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