陈匡时
博士、特聘研究员
生物医学工程系特聘研究员
(办公地址:北京大学综合科研楼112)
联系电话:+86-
电子邮箱:chenak@pku.edu.cn
个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpage.asp?id=4464
教育经历
2004-2008,博士:宾夕法尼亚大学 (University of Pennsylvania) 专业:生物医学工程
2000-2002,硕士:加州大学-圣地亚哥校区 (UC San Diego) 专业:生物医学工程
1996-2000,学士:加州大学-圣地亚哥校区 (UC San Diego) 专业:生物医学工程
主要科研工作经历
2013-至今, 北京大学工学院生物医学工程系- 特聘研究员
2010-2013, 美国国家卫生研究院 (NIH),Jennifer Lippincott-Schwartz 实验室,博士后
2010-2012, 美国国家标准与技术研究院 (NIST),Anne L. Plant 实验室,博士后
2009/2010, 美国宾夕法尼亚大学,Andrew Tsourkas 实验室,博士后
主要荣誉
·The US. National Research Council (NRC) Research Associate Fellowship (2010-2012).
·Solomon R. Pollack Award for Excellence in Graduate Bioengineering Research (Best Ph.D. Thesis)(2009)
主要论文列表
1. Mao, S., Yachen, Ying., Wu, X., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* CRISPR/Dual-FRET Molecular Beacon for Sensitive Live-Cell Imaging of Non-Repetitive Genomic Loci. Nucleic Acids Res, 2019; DOI: 10.1093/nar/gkz752
2. Ding, T., Chen, A.K.* and Zuhong Lu*. The applications of nanopores in studies of proteins. Sci. Bull. 2019; DOI: 10.1016/j.scib.2019.07.029. (Review)
3. Wu, X., Mao, S., Yachen, Ying., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* Progress and Challenges for Live-Cell Imaging of Single Genomic Loci Using CRISPR-Based Platforms. Genomics, proteomics & bioinformatics. 2019; DOI: 10.1016/j.gpb.2018.10.001.
4. Yang, Y., Qu, N., Tan, J., Rushdi, M.N., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* Roles of Gag-RNA interactions in HIV-1 virus assembly deciphered by single-molecule localization microscopy. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018; 115, 6721-6726.
5. Wu, X., Mao, S., Yang, Y., Rushdi, M.N., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* A CRISPR/molecular beacon hybrid system for live-cell genomic imaging. 2018; Nucleic Acids Res, 46, e80.
6. Pak A.J., Grime J.M.A., Sengupta P., Chen, A.K., Durumeric A.E.P., Srivastava A., Yeager M., Briggs J.A.G., Lippincott-Schwartz J., Voth G.A.. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017; DOI: 10.1073/pnas..
7. Ma Z., Wu X., Krueger C.J., and Chen, A.K.* Engineering Novel Molecular Beacon Constructs to Study Intracellular RNA Dynamics and Localization. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2017; Oct;15(5):279-286. (Review)
8. Qu, N., Ma, Z., Zhang, M., Rushdi, M.N., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* Inhibition of retroviral Gag assembly by non-silencing miRNAs promotes autophagic viral degradation. Protein Cell. 2017; DOI: 10.1007/s13238-017-0461-z
9. Chen, M., Ma, Z., Wu, X., Mao, S., Yang, Y., Tan, J., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* A molecular beacon-based approach for live-cell imaging of RNA transcripts with minimal target engineering at the single-molecule level. Sci Rep. 2017; 7, 1550.
10. Yu, X., Zhang, Y., Li, T., Ma, Z., Jia, H., Chen, Q., Zhao, Y., Zhai, L., Zhong, R., Li, C., Zou, X., Meng, J., Chen, A.K., Puri, P.L., Chen, M., Zhu, D.* Long Non-coding RNA Linc-RAM Enhances Myogenic Differentiation by Interacting with MyoD. Nat. Commun. 2017; 8: 14016
11. Zhao, D., Yang, Y., Qu, N., Chen, M., Ma, Z. Krueger, C.J., Behlke, M.A. and Chen, A.K.* Single-Molecule Detection and Tracking of RNA Transcripts in Living Cells Using Phosphorothioate-Optimized 2’-O-Methyl RNA Molecular Beacons. Biomaterials. 2016; 100: 172-183.
12. Chen, A.K., Sengupta, P., Waki, K., Van Engelenburg, S., Ochiya, T., Ablan, S.D., Freed, E.O. and Lippincott-Schwartz, J.* MicroRNA binding to the HIV-1 Gag protein inhibits Gag assembly and virus production. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A., 2014; 111(26):E2676-83.
13. Chung, K.H., Chen, A.K., Anderton, C.R., Bhadriraju, K., Plant, A.L., Bush, B.G., Cook, R.F. and Frank F. Frictional properties of native and functionalized type I collagen thin films. Appl. Phys. Lett. 2013; 103 (14), 143703-143703-5.
14. Chen, A.K. * Delrio, F., Peterson, A.W., Chung, K.H., Bhadriraju, K, and Plant, A.L. Cell spreading and proliferation in response to the composition and mechanics of engineered fibrillar extracellular matrices. Biotechnol Bioeng. 2013: 110: 2731-2741.
15. Chen, A.K.* and Tsourkas A. Developing Molecular-Beacon Constructs for Improved Live-Cell Analysis and Imaging of RNA. Am. Biotech. Lab. 2010; 28 (7): 10-13. (Review).
16. Chen, A.K., Davydenko, O., Behlke, M., and Tsourkas A.* Ratiometric Bi-Molecular Beacons: Ratiometric Bimolecular Beacons for the Sensitive Detection of RNA in Single Living Cells. Nucleic Acids Res. 2010; 38 (14): e148.
17. Cheng, Z., Chen, A.K., Lee H-Y., and Tsourkas, A.* Examination of Folate-Targeted Liposomes with Encapsulated Poly(2-Propylacrylic acid) as a pH-responsive Nanoplatform for Cytosolic Drug Delivery. Small. 2010; 6 (13): 1398-401.
18. Chen, A.K., Behlke, M., and Tsourkas, A.* Subcellular Trafficking and Functionality of 2'-O-methyl and 2'-O-methy-phosphorothioate Molecular Beacons. Nucleic Acids Res. 2009; 37 (22): e149.
19. Chen, A.K. and Tsourkas, A.* Imaging RNA in Living Cells with Molecular Beacons: Current Perspectives and Challenges. J. Innov. Opt. Health Sc. 2009; 2 (4): 315-324. (Review)
20. Chen, A.K., Cheng, Z., Behlke, M., and Tsourkas, A.* “Assessing the Sensitivity of Commercially Available Fluorophores to the Intracellular Environment”. Anal Chem. 2008; 80 (19): 7437-44.
21. Chen, A.K., Behlke, M., and Tsourkas, A.* “Efficient Cytosolic Delivery of Molecular Beacon Conjugates and Flow Cytometric Analysis of Target RNA”. Nucleic Acids Res. 2008; 36 (12): e69.
22. Elias, D.R., Thorek, D.L., Chen, A.K., Czupryna, J., and Tsourkas, A.* “In vivo Imaging of Cancer Biomarkers Using Activatable Molecular Probes”. Cancer Biomarkers. 2008; 4 (6): 287-305. (Review).
23. Chen, A.K., Behlke, M., and Tsourkas, A.* “Avoiding False-Positive Signals with Nuclease-Vulnerable Molecular Beacons in Single Living Cells”. Nucleic Acids Res. 2007; 35 (16): e105.
24. Chen, A.K., Latz, M.I., Sobolewski, P., and Frangos, J.A.* “Evidence for the Role of G-Proteins in Flow Stimulation of Dinoflagellate Bioluminescence.” Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 2007; 292(5): R2020-7.
25. Thorek, D.L.J., Chen, A.K., Czupryna, J., and Tsourkas, A.* “Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticle Probes for Molecular Imaging.” Ann Biomed Eng. 2006; Jan;34(1):23-38 (Review).
26. Chen, A.K., Latz, M.I., and Frangos, J.A.* The Use of Dinoflagellate Bioluminescence to Characterize Cell Stimulation in Bioreactors.” Biotechnol Bioeng. 2003; 83(1): 93-103.
出版书籍章节
1. Ying Y., Mao S., Krueger C.J., Chen A.K.* (2019) Live-Cell Imaging of Long Noncoding RNAs Using Molecular Beacons. In: Shav-Tal Y. (eds) Imaging Gene Expression. Methods in Molecular Biology, vol 2038. Humana, New York, NY
2. Chen, M., Mao, S., Wu, X., Mao, S., Ma., Z., Yang, Y., Krueger, C.J. and Chen, A.K.* (2019) Single-Molecule Analysis of RNA Dynamics in Living Cells Using Molecular Beacons. In: Wajapeyee, Narendra, Gupta, Romi (eds) Epitranscriptomics. Methods in Molecular Biology, vol 1870. Humana Press, New York, NY.
3. Chen M., Yang Y., Krueger C.J., Chen, A.K.* (2018) Optimizing Molecular Beacons for Intracellular Analysis of RNA. In: Gaspar I. (eds) RNA Detection. Methods in Molecular Biology, vol 1649. Humana Press, New York, NY. pp 243-257.
4. Yang Y., Chen M., Krueger C.J., Tsourkas A., Chen, A.K.* (2018) Quantifying Gene Expression in Living Cells with Ratiometric Bimolecular Beacons. In: Gaspar I. (eds) RNA Detection. Methods in Molecular Biology, vol 1649. Humana Press, New York, NY. pp 231-242.
5 Crayton, S.H., Chen, A.K., Liu, J.F., Higbee-Dempsey, E.M., Huang, C.-H., Tsourkas, A. and Cheng Z. (2017) Molecular Imaging In Comprehensive Biomaterials II, edited by Ducheyne, P., Grainger, D.W., Healy, K.E., Hutmacher, D.W., Kirkpatrick, C.J., Elsevier Inc., pp 424-466.
6. Chen, A.K., Rhee, W.J., Bao G. and Tsourkas, A.* (2011)Delivery of Molecular Beacons for Live-cell Imaging and Analysis of RNA, RNA Detection and Visualization, Jeffrey E. Gerst, Humana Press, pp 159-174.
7. Crayton, S.H., Chen, A.K., Cheng, Z., Tsourkas, A.* (2010) Molecular Imaging In Comprehensive Biomaterials, edited by Ducheyne, P., Healy, K., Hutmacher, D., Kirkpatrick, C.J., Elsevier Inc., pp 305-328.
8. Thorek, D.L.J., Czupryna, J., Chen, A.K., Tsourkas, A.* (2006) Molecular Imaging of Cancer with Superparamagnetic Iron Oxide Nanoparticles. In Cancer Imaging, edited by M.A. Hayat. Elsevier Science/Academic Press, pp 85-95.
专利申请
1. Andrew Tsourkas and Antony Chen. Quantitative Molecular Probes, 2007. US Application Number: 12/282.612; International Application Number: PCT/US07/064099.
2. Andrew Tsourkas and Antony Chen. Novel Molecular Beacons. 2009. US Application Number: 61/244,378; International Application Number: PCT/US10/49301.
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈匡时
本站小编 Free考研考试/2020-04-10
相关话题/北京大学 师资
北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈默涵
陈默涵助理教授、研究员、博士生导师北京大学工学院力学与工程科学系助理教授北京大学应用物理与技术研究中心研究员联系电话:电子邮箱:mohanchen@pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpaget.asp?id=660教育与工作经历:2018/11–至今助理教授,北京大学,工学院力学与工程科学系,应用物理与技术研究中心2018/05–2018/1 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈璞
陈璞博士、教授中国振动工程学会理事中国力学学会计算力学专业委员会委员北京振动工程学会常务理事校教代会代表联系电话:电子邮箱:chenpuus@yahoo.com个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpage.asp?id=169教育经历:1978.10-1982.7北京大学力学系,本科1982.6理学学士1982.9-1984.11北京大学力学系,硕士生1984.1 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈正
陈正博士、特聘研究员航空航天工程系研究员、博士生导师燃烧实验室(PKUCombustionLab)负责人联系电话:电子邮箱:cz@pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpaget.asp?id=210教育经历:2009年1月,普林斯顿大学,机械与航空工程系,博士2003年7月,清华大学,工程力学系,硕士2001年7月,清华大学,工程力学系,学士工 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈永强
陈永强博士、副教授力学与工程科学系副教授联系电话:电子邮箱:chenyq@pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpaget.asp?id=266教育经历:2009.8至今北京大学力学与工程科学系副教授2008.9-2008.10英国卡迪夫大学国际合作资助学术访问2006.12-2008.1英国卡迪夫大学博士后(ResearchAssociate) ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-楚天广
楚天广博士、教授工业工程与管理系教授联系电话:电子邮箱:chutg@pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpage.asp?id=171教育经历:工学博士:清华大学工程力学系,1993理学硕士:哈尔滨工业大学应用数学系,1989理学学士:河南大学数学系,1984研究领域:运动稳定性、智能控制、机器学习、复杂网络背景资料:《宇航学报》编委ISRNA ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-戴志飞
戴志飞博士、教授国家杰出青年科学基金获得者教育部新世纪优秀人才国家重点研发计划首席科学家中国医药生物技术协会造影技术分会主任委员中国生物材料学会影像材料与技术分会副主任委员中国医师协会介入医师分会介入医学工程专委会副主任委员中国生物医学工程学会生物医学光子学分会副主任委员中国医药生物技术协会纳米生物技术分会副主任委员BioconjugateChemistry副主编Theranostics编委联系电 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-陈伟
陈伟助理教授,研究员,博士生导师北京大学工学院力学与工程科学系助理教授北京大学工程科学与新兴技术高精尖创新中心Co-PI联系电话:电子邮箱:w.chen@pku.edu.cn个人主页:主要研究方向系统与控制理论,网络化控制系统,智能电网,网络科学,动态网络,信息物理安全教育经历2010-2014,博士:香港科技大学(导师:丘立教授)专业:电子及计算机工程2008-2010,硕士:香港科技大学(导师 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-邸元
邸元博士、副教授北京大学工学院能源与资源工程系副教授联系电话:;**电子邮箱:diyuan@mech.pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpaget.asp?id=150工作经历:1996年7月--1998年6月:北京大学力学与工程科学系,博士后。1998年7月--至今:在北京大学力学与工程科学系、工学院能源与资源工程系,从事教学、科研工作,讲 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-邓旭亮
邓旭亮联系电话:电子邮箱:kqdengxuliang@bjmu.edu.cn个人主页:教育经历:1995.9-1999.6北京医科大学口腔医学院硕博连读(BeijingMedicalUniversity,Doctoral)1990.9-1995.6北京医科大学口腔医学院本科(BeijingMedicalUniversity,Bachelor)学术简历:2014.9至今北京大学口腔医学院,副院长,特 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10北京大学工学院导师教师师资介绍简介-董蜀湘
董蜀湘博士、教授北京大学工学院材料科学与工程系教授;美国弗吉尼亚理工大学兼职教授联系电话:电子邮箱:sxdong@pku.edu.cn个人主页:http://www2.coe.pku.edu.cn/subpaget.asp?id=201研究领域:涉及铁电、铁磁材料,器件和理论,包括:(1)磁电复合材料、磁电器件和磁-弹-电耦合理论;(2)压电微马达、空间(低温)超声马达与驱动器,(3)磁传感器,电 ...北京大学考研导师 本站小编 Free考研考试 2020-04-10