教授、博士生导师，担任生物医学工程系常务副主任，兼管教学、培养。兼任中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员、国际期刊Int.J.Comput.IntelligenceinBioinformaticsandSystemsBiology(IJCIBSB)副主编、DatasetPapersinBiol.编委、HansJ.Comput.Biol.(HJCB)编委。
1992年本科毕业于华中科技大学工程力学专业。1997年硕士毕业于北大流体力学专业。2000年博士毕业于北大流体力学专业。2001－02年北大湍流与复杂系统国家重点实验室博士后，开始转入生物信息学的交叉学科研究。2003年1月留校任教，2006年加入北大工学院生物医学工程系。2007－08年赫尔辛基大学芬兰基因组中心访问学者。目前同时兼任湍流与复杂系统国家重点实验室、北京大学定量生物学中心、北京大学蛋白质科学中心的成员。
目前主要研究领域为生物医学信息学和计算系统生物学，研究兴趣包括环境与人体微生物组学、基因组复杂结构信息分析、比较基因组学、生物进化以及生物分子动力学等。近年来主持发展的微生物基因组分析与基因预测系列方法达到国际领先水平，并被应用于美国St.Louis华盛顿大学、英国Sanger研究所和法国原子能委员会（CEACadarche）等多项国际微生物基因组测序计划。与美国GeorgiaInstituteofTechnology生物医学工程系相关实验室保持良好的合作关系。研究结果已在NucleicAcidsRes.、Bioinformatics、BMCBioinformatics、BMCGenomics等生物信息学领域刊物发表，多篇论文被BioMedCentral评为“高访问率论文”（'Highlyaccessedarticle'onBioMedCentral），并多次被Cell、Nature、Nat.Methods、Nat.Rev.Microbiol.等正面引用或专门报道。
先后主持和合作承担国家自然科学基金、国家科技部973计划等国家级项目共计14项。开设研究生专业必修课《生物医学应用数学》、《理论与系统生物学实验》，生物医学工程专业本科生必修课《生物医学工程设计》、专业选修课《计算生物学导论》以及研究生专业选修课《生物医学中的系统生物学》等课程。
所领导的研究小组现指导在读博士生9人、硕士生2人，已指导毕业博士生7人、硕士生5人，并作为博士生导师获得了2010年北京市优秀博士论文、2011年北京大学优秀博士论文二等奖、2011年全国优秀博士论文提名奖。先后获得中国生物医学工程联合学术年会青年优秀论文奖（指导教师、通讯作者），以及北大宝洁奖教金、北大方正优秀奖教金、埃克森-美孚北大奖教金等。
（Latestupdatedin2012）
