我院于1986年7月28日经国务院学位委员会批准成为第三批硕士学位授予单位之一，成为食品工程和发酵工程两个一级学科硕士授予点，目前有26名在读研究生在院攻读硕士学位。近20年来已有50多名硕士研究生毕业参加工作，这中间的许多人成为国内外食品和发酵领域的拔尖人才，研究生教育和培养为我院培养和输送了一批有能力有水平的专业人才，成为我院培养人才的重要组成部分，为确立我院在国内外学术界的地位做出了突出贡献，这些人中有的已经成为我院的院领导和高级研究人员。八十年代，在尹宗伦、萧家捷、王薇青、管敦仪、熊子书等一大批知名老专家的培养和带动下，我院研究生培养教育工作掀起一个高潮。2002年以来，我院的研究生教育工作进入到一个新的快速发展阶段，研究生培养工作开创了崭新的局面，正在进入一个新高潮，研究生教育成为实现我院发展战略的重要组成部分，近三年来我院平均每年招收9名研究生，全部为第一志愿录取。

　　为改善研究生住宿条件，院领导想方设法解决这些问题，投资150多万元，建筑面积1000多平米、楼高3层的研究生和单身职工公寓楼已于2005年年底建成，研究生宿舍安装了宽带网、电话、淋浴等设备，彻底改善了研究生住宿问题。在研究生待遇方面，入学后每月发放生活补贴800元，2005年初我院研究生导师根据项目情况对进入课题的在读研究生按月发放100元-300元补贴。

　　研究生在读的两年半时间里，有一年半的时间是进入课题组完成论文，在这期间我们非常重视在读研究生的思想政治教育和业余文化生活，从他们进院报道的那一天起，党团组织和工会就积极吸收和联系他们参加本院组织的各种活动，每年的职工趣味运动会和春节联欢、共青团活动都有他们活跃的身影。

　　近年来，我院逐步完善了研究生招生管理、培养制度，目前我院研究生规章制度初步形成一个体系，分别完善了关于导师的规章制度、关于学位部分的规章制度、关于研究生中期管理和培养的规章制度同时还制作了研究生用各种表格，制定了学位申请流程图、研究生中期管理流程图等。

　　研究院的研究生教育培养优势在于科研优势明显，研究生培养与科研实践活动紧密相连。研究院是与工业生产实践紧密相关的工业研究院，以我院为例，我院的研究生在第一年基础课读完以后，就立即投入到导师的课题项目中去，下到一线工厂与本院和企业技术人员和工人共同在实践中学习知识、解决问题、思考问题，通过深入基层与实践相结合写出能够结合企业实际、有深度、有前瞻性的高质量的论文。2005年酿酒研发部的硕士生张彦青的硕士论文《人工神经网络在啤酒酿造过程中的应用研究》获得了院内外专家的高度评价。

　　研究院拥有一批常年奋斗在科研一线，接受过良好的科学训练，具有较高的科学素养和学术水平的研究人员，一般每个导师最多带2个学生，他们都具有高级或正高级职称，在研究生培养方面比大学里的导师拥有更多的科研实践经验。

　　从2003年开始我院毕业的研究生开始实行双向选择，毕业生一部分留院工作，一部分进入社会，目前我院研究生招生全部为公费研究生。