水利史研究所，原名为国民政府水利委员会整理水利文献委员会，是国内唯一从事水利史、灾害史、水文化、水利社会学的专业研究所，拥有文物保护工程（水利类）勘测设计甲级资质。水利史研究所下设三个研究室：水文化与水利史研究室、信息与灾害风险研究室、生态景观与遗产保护规划研究室。水利部江河水利志指导委员会秘书处挂靠本所，也是水利部江河水利志收藏馆的代管单位。

　　我国水利史研究起源于1936年，70多年间发展，成为国内外具有影响力的水利史研究中心，在水利文献、水旱灾害档案、地方志和现代江河水利志资料等收藏方面，居国内外同类收藏的首位。近年，水利史的研究在灾害机理、减灾战略与风险分析方面积极拓展；在文化遗产保护方面，研发水利遗产保护与生态、水环境修复相结合的实用技术。在“十二五”期间，针对水利大发展的需求，研究重点方向是：水旱灾害与灾害史，水利战略研究，区域水环境与水资源演变、水利史和水文化的基础研究，水利遗产保护战略等。

　　作为我国历史最为悠久的、唯一的水利史研究机构，水利史研究所为我国水利史研究工作，历史水利文献资料整理收藏工作，为我国水利建设、水利事业的发展做出了不可替代的贡献，在我国水利工作现代化进程中起到了重要的支撑作用。

　　水利史研究所现有正式职工11人，其中教授级高级工程师2人，高级工程师3人，高级政工师1人，工程师3人，助理工程师2人；其中获博士学位3人，硕士学位6人。特聘专家2人，其中教授级高级工程师1人，高级工程师1人。在读硕士1名。

　　1936年，“整理水利文献委员会”的武同举、赵世暹着手整编淮河、黄河、长江、运河河工档案。1937年7月7日，由于抗日战争全面爆发，整理水利委员会随中央水利实验处西迁重庆，更名为“整理水利文献室”，1945年抗日战争胜利后，随中央水利实验处迁回南京。1956年值国家大学和科研院所调整之际，水利文献室的全体成员和图书迁往北京，进入新组建的北京水利水电研究院，更名为“水利史研究所”，1961年改为“水利史研究室”。1969年水利水电科学研究院撤销时，研究室同时解散，但根据水利部的指示，在文革开始之际所有图书资料封存得以完好保留下来。1978年水利水电科学研究院恢复后，“水利史研究室”随之恢复。2001年水利水电科学研究院的科研机构调整，水利史研究室编入新成立的防洪减灾所。2007年重新恢复水利史研究室，于2009年更名为水利史研究所。

　　水利史研究所收藏整理了大量的历史水利文献资料。拥有130000件清代故宫洪涝档案及近2000年水旱灾害文献档案的收藏，线装书20000余册；水利专著500余部；地方志（古代）2000多种，是水利史、灾害及减灾研究的重要信息源，约占全国总收藏量的70%。水利史研究室在水利古籍整编方面有60多年历史，校注有《漕河图志》、《治水筌蹄》、《二十五史河渠志注释》以及《再续行水金鉴》等。这些历史文献资料在我国水利规划、水利建设、科研，以及丰富治水思路和解决水利宏观问题的研究中，发挥着重要作用。

　　近年来，在水利部、国家防办、国家文物局的支持下，水利史研究所进入了一个新的发展阶段。在机构建设上，形成了以水利史与水文化研究、灾害与信息和生态景观与遗产保护规划为主的机构设置形式；在人才培养上，形成了老、中、青三代阶梯式的研究队伍；在教学上，形成了硕士、博士、博士后教育为一体的教学单位；在科研方面，已有多项成果成为当代水利建设的借鉴，其中“中国历史大洪水研究”、“中国重大自然灾害与减灾对策”以及“中国水旱灾害研究”，荣获国家科技进步二等奖，此外有多个科研项目获省部级奖励。

今天的水利史研究所已成为为国家培养高素质、创造性水利人才的摇篮，水利史研究的前沿和知识创新的重要基地，水利史研究领域国际交流的桥梁与窗口。