藏东南高山环境综合观测研究站位于西藏自治区林芝县鲁朗镇北6km左右318国道西侧的山间荒地，站区占地总面积30亩。站址地理位置为东经94°44¢，北纬29°46¢，距八一镇以东75公里。从拉萨出发沿川藏公路东行480公里到达站址所在地鲁朗镇，沿线均为沥青路面。林芝地区米林机场于2006年10月正式通航，该机场距站址120km左右。

　　藏东南站的总体科学目标是通过监测水热组分在山地地区传输过程以及对地表景观的影响，为全球变化条件下山地垂直带及其环境效应的研究提供一流和完善的基础数据，为当地的生态、环境建设和经济社会发展提供科学依据。
　

　　藏东南站由办公生活区、观测场和附近观测点三个部分组成。办公生活区建设于2006年8月完成，220平方米的欧洲与藏式风格相结合的小楼成为科研办公、客座接待和在站职工宿舍与后勤用房。目前，该站主要观测内容有：

　　（1）高山生态过渡带环境及土壤环境监测系统。主要对高山林线附近的微气象和土壤温湿度进行高频监测，包括色季拉山西侧阳坡的方枝柏和阴坡的急尖长苞冷杉生长与气候要素的相关关系、色季拉山东坡微气象与土壤温湿度和热通量。监测始于2005年8月，仪器主要由台湾生产的自动气象站和土壤温度/湿度探测器组成。

　　（2）海洋性冰川变化/湖泊监测系统。主要对帕龙藏布源头的多个冰川和然乌湖进行监测，冰川微气象、冰川动态变化、湖泊水位、入/出湖流量、湖水化学指标等。监测始于2006年5月。

　　（3）大气边界层与降水同位素监测系统。监测仪器包括一个可以观测4层风温湿、雨量、气压、3层土壤热通量及5层土壤温湿度的20米的大气边界层观测塔、一套可以测量近地层大气中风温湿、水汽及CO2脉动量的大气湍流系统和一套可以观测向上、向下短波辐射及向上、向下的长波辐射通量的辐射观测系统。同时，收集每场降雨的样品进行同位素测定。监测始于2006年11月。