RBM15是一种RNA结合蛋白，参与到RNA的m6A修饰及可变剪接调控中. 然而，RBM15在转录组水平如何调控可变剪接尚不清楚. 本研究应用超分辨率荧光显微镜技术发现，RBM15在细胞核中形成斑点状结构，且与核斑有密切接触或完全定位于核斑中. 核斑为细胞核中无膜细胞器，富含多种剪接因子，这提示RBM15可能参与到可变剪接的调控过程中. 为了确定RBM15能否及如何调控可变剪接，我们利用siRNA敲低RBM15，并对敲低RBM15和野生型细胞进行二代测序. 结果显示，敲低RBM15能够引起1 111个转录本中的1 279个可变剪接事件的变化. 与已发表的RBM15-CLIP数据进行比较分析，我们发现，这1 111个转录本中，有191个能够与RBM15结合，提示这191个转录本可能为RBM15调控的直接靶标. 进一步的分析表明，RBM15结合能够促进这191个转录本中的121个发生内含子或外显子的滞留. 该研究揭示了RBM15在转录组水平调控可变剪接的规律.
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RBM15结合促进RNA内含子或外显子滞留
本站小编 Free考研考试/2022-01-02
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