染色质互作是真核生物基因组组装的基础，并且在调控真核基因细胞特异性表达中发挥重要作用. 染色质互作的发生与特定的蛋白质有关，目前已经发现CTCF（CCCTC binding facor，转录阻抑物）和黏连蛋白与染色质互作相关，然而并不清楚是否还有其他蛋白质参与染色质互作. 我们将整合高通量染色体构象捕获（Hi-C）和染色质免疫沉淀-测序（ChIP-seq）数据，在GM12878和K562细胞系中挖掘与染色质互作相关的转录因子，并对发现的转录因子做功能分析. 我们在频繁发生互作的染色质位点中发现RUNX3、SPI1等转录因子也可能参与染色质互作. 另外，通过FP-growth的数据挖掘方法还发现多个转录因子可能协同作用参与染色质互作. 研究结果将为染色质互作相关实验的开展提供先验知识.
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染色质互作相关转录因子的挖掘及功能分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-02
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