宏蛋白质组学是一门新型科学，它运用质谱技术规模化地采集自然界微生物种群的蛋白质信息，并结合多种组学数据，开展微生物种群的遗传特征及其生物功能的研究．宏蛋白质组学的信息分析与传统蛋白质组学方法有较大的不同，亟需拓展新的分析思路．由于宏蛋白质组的研究对象是复杂度极高的微生物样品，因此，需要构建尽可能囊括样本中所含微生物的基因组信息的物种数据库．面对庞大的数据库，必须考虑到分析过程中所消耗的计算资源和鉴定结果的质控标准，因此，需要高度优化库容量、搜库、假阳性控制等参数．鉴于宏蛋白质组数据中广泛存在复杂的同源蛋白质序列，因此，需要充分利用NCBI数据库中的分类信息进行匹配，并运用LCA算法过滤处理才能将蛋白质有效地归组到物种．本文立足于宏蛋白质组学信息分析，从宏蛋白质组的数据库建立、蛋白质归并、生物学意义发掘等几个方面着手，对该领域的发展现状、面临挑战以及未来研究方向进行了评述．
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宏蛋白质组学信息分析的基本策略及其挑战
本站小编 Free考研考试/2022-01-02
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