中科院植物所王雷研究组此前的研究发现PIF蛋白是生物钟核心组分PRR基因家族的直接靶基因,介导着生物钟对下胚轴光周期依赖性生长、以及高温诱导叶片衰老过程的调控。为研究PIF蛋白在调控顶端弯钩发育过程中的器官特异性机制,研究人员分别获取子叶、顶端弯钩以及下胚轴的材料进行转录组分析。有趣的是,对差异表达基因进行功能富集分析时发现,参与调控细胞分裂的基因在子叶和顶端弯钩中的差异表达基因中显著富集,但在下胚轴中的差异表达基因并没有富集,这表明PIF蛋白在不同器官中可能发挥着不同的作用。
研究人员通过对器官特异性转录组、光诱导的转录组以及ChIP-seq大数据的联合分析发现BUB3.1可能是PIF蛋白参与调控细胞分裂的潜在共同靶基因。实验证明PIF蛋白可直接结合BUB3.1的启动子,并转录抑制其表达,而且BUB3.1过表达转基因株系呈现顶端弯钩部分打开的表型,这也进一步说明胞质分裂可能参与了调控顶端弯钩的打开过程。
PIF1、PIF3、PIF4、PIF5的四突变体pifq在黑暗下呈现顶端弯钩完全打开的表型,研究人员在黑暗下生长的pifq突变体以及野生型光处理6小时后的材料中观察到了成膜体,但在黑暗下的野生型材料中并没有观察到成膜体。胞质分裂会影响细胞倍性,研究人员利用对不同器官的细胞倍性分析发现pifq突变体子叶和顶端弯钩中的细胞倍性显著低于野生型,但其下胚轴中的细胞倍性与野生型没有明显差异。咖啡因(Caffeine)是一种胞质分裂的有效抑制剂,研究发现咖啡因处理可显著促进野生型植株顶端弯钩的发育,进一步说明胞质分裂在调控顶端弯钩发育过程中发挥着重要作用。综上所述,该研究阐明了PIF蛋白可以调控胞质分裂,进而影响顶端弯钩发育,揭示了PIF蛋白以器官特异性方式调控细胞分裂的新机制。
该研究成果于5月11日发表于国际学术期刊Cell Reports。中科院植物所张媛媛副研究员为论文第一作者,王雷研究员为通讯作者,在读博士生李娜也参与了部分研究工作。该研究得到了国家自然科学基金面上项目、中科院战略性先导科技专项B类项目以及中科院青促会等项目的资助。
论文链接:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109095
(分子生理实验室供稿)

PIF蛋白调控胞质分裂和顶端弯钩发育的工作模型
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