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孔宏智
职称：研究员
联系电话：(86)-010-62836489
电子邮件：hzkong@ibcas.ac.cn
个人网页：http://www.lseb.cn/ZWX/ResearcherInfo.aspx?ResearcherID=konghongzhi
课题组：进化发育与调控基因组学研究组
孔宏智，男，博士，研究员，博士生导师。
1995年毕业于西北大学生物系，2000年在中国科学院植物研究所获得博士学位并留所工作。2002年4月至2004年10月在美国宾夕法尼亚州立大学进行合作研究。主要从事被子植物花的进化发育遗传学、核基因家族和调控网络的进化以及植物系统发育和分子生物地理学研究。对被子植物花部结构的多样性有较为深入的了解，熟悉花的发育和核基因家族的进化。主持了国家自然科学基金之青年基金项目“金粟兰科的系统发育和分子生物地理学研究”、主任基金项目“被子植物中最简单的花的发育与进化”、面上基金项目“金粟兰中5个MADS-box基因的功能与进化研究”和重点基金项目“基部真双子叶植物中A、B、C和E类MADS-box基因的进化”。以第一、并列第一或通讯作者在MolecularBiologyandEvolution、PlantPhysiology、ThePlantJournal、Genetics、MolecularPhylogeneticsandEvolution、AmericanJournalofBotany、PlantSystematicsandEvolution、BotanicalJournaloftheLinneanSociety、《植物学报》和《植物分类学报》等刊物上发表论文十余篇。 主要研究领域：1．花的进化发育遗传学采用进化、发育和遗传手段，研究控制花部器官发生和发育的关键基因（如A、B、C和E类MADS-box基因）的数目、结构、表达、功能和进化，揭示新基因、新基因功能乃至新调控体系产生的基本式样及其与花部结构改变的关系，探讨关键花部性状起源和演化的分子机理以及被子植物大类群的起源和多样化机制。目前的研究重点是基部真双子叶植物花部结构的多样化机制和核心真双子叶植物花部结构的起源机制。 2．核基因家族和调控网络的进化利用分子进化和生物信息学研究手段，在基因组的层面上研究核基因家族的结构、变异、起源和演化，揭示调控网络（regulatorynetworks）和发育途径（developmentalpathways）中各结点基因和相互作用关系的保守性和变异式样，探讨控制重要生命活动（如蛋白质降解、细胞周期和减数分裂等）的起源、维持和多样化机制。近年来的研究主要集中在SKP1、F-box、Cyclin和recA/RAD51等基因家族的进化上。 3．植物系统发育和分子生物地理学在形态学（广义）、细胞学和分子系统学研究的基础上，重建植物类群（如金粟兰科）的系统发育，并结合植物地理学和古生物、古地理和古气候的资料，探讨类群的起源、演化和分布历史。主持和参加的科研项目“花部性状发育和演化的遗传调控及其分子机制”，中国科学院知识创新工程重要方向项目（KSCX2-YW-R-135;100万;2007.01-2010.12），主持人。“基部真双子叶植物中A、B、C和E类MADS-box基因的进化”，国家自然科学基金委重点基金项目（30530090;160万;2006.01-2009.12），主持人。“金粟兰中5个MADS-box基因的功能与进化研究”，国家自然科学基金委面上基金项目（30470116;21万;2005.01-2007.12），主持人。“植物进化机制的进化发育生物学研究”之子课题“AP3类MADS-box基因的功能及其进化研究”，国家自然科学基金委创新研究群体基金项目（30121003;35万;2005.01-2007.12），主持人。“植物进化过程中关键性状的进化发育遗传学研究”，中国科学院植物研究所领域前沿项目（100万;2005.12-2008.11），主持人。“被子植物中最简单的花的发育与进化”，国家自然科学基金委主任基金项目（30240002;15万;2002.05-2003.04），主持人。“金粟兰科的系统发育和分子生物地理学研究”，国家自然科学基金委青年基金项目（30100011;19万;2002.01-2004.12），主持人。“金粟兰属植物花部器官的发育与进化”，中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室基金课题（6万;2000.01-2002.12），主持人。“原始被子植物的结构、分化和演化”，路安民研究员主持的国家自然科学基金委重点基金项目（39630030;100万;1997.01-2000.12），参加人。“被子植物基部类群的结构、分化和系统学关系”，路安民研究员主持的国家自然科学基金委重点基金项目（30130030;105万;2002.01-2005.12），参加人。“横断山脉地区种子植物区系中的特有现象和物种形成的研究”，杨亲二研究员主持的中国科学院资源与生态环境研究重点项目（KSCXZ-SW-101A;25万;1997.01-1999.12），参加人。“横断山区乌头属植物物种形成与分化的研究”，杨亲二研究员主持的国家自然科学基金委面上基金项目（30070057;15万;2001.01-2003.12），参加人。“高山松的基因组构成和进化生物学研究”，王晓茹研究员主持的国家自然科学基金委面上基金项目（30070058;15万;2001.01-2003.12），参加人。论文专著SuK.,ZhaoS.,ShanH.,KongH.,LuW.,TheissenG.,ChenZ.,MengZ.,2008.TheMIKregionratherthantheC-terminaldomainofAP3-likeclassBfloralhomeoticproteinsdeterminesfunctionalspecificityinthedevelopmentandevolutionofpetals.NewPhytologist178:544-558PDFQuanL.,XiaoR.,LiW.,OhS.-A.,KongH.,AmbroseJ.C.,MalcosJ.L.,CyrR.,TwellD.,MaH.,2008.FunctionaldivergenceoftheduplicatedArabidopsisAtKIN4aandAtKIN4bgenes:criticalrolesinmeiosisandgametophytedevelopment.ThePlantJournal53:1013-1026PDFZhuX.-Y.,ChaseM.W.,QiuY.-L.,KongH.-Z.,DilcherD.L.,LiJ.-H.,ChenZ.-D.,2007.MitochondrialmatRsequenceshelptoresolvedeepphylogeneticrelationshipsinrosids.BMCEvolutionaryBiology7:217PDFKongH.*,LandherrL.L.,FrohlichM.W.,Leebens-MackJ.,MaH.,dePamphilisC.W.*,2007.PatternsofgeneduplicationintheplantSKP1genefamilyinangiosperms:evidenceformultiplemechanismsofrapidgenebirth.ThePlantJournal50:873-885(*correspondingauthors)PDFShanH.,ZhangN.,LiuC.,XuG.,ZhangJ.,ChenZ.*,KongH.*,2007.PatternsofgeneduplicationandfunctionaldiversificationduringtheevolutionoftheAP1/SQUAsubfamilyofplantMADS-boxgenes.MolecularPhylogeneticsandEvolution44:26-41(*correspondingauthors)PDFXuG.,KongH.*,2007.DuplicationanddivergenceoffloralMADS-boxgenesingrasses:evidenceforthegenerationandmodificationofnovelregulators.JournalofIntegrativePlantBiology49(6):760-768(*correspondingauthor)PDFShanH.,SuK.,LuW.,KongH.,ChenZ.,Meng,Z,2006.ConservationanddivergenceofcandidateclassBgenesinAkebiatrifoliata.Development,GenesandEvolution216:785-795PDFLinZ.,KongH.,NeiM.,MaH.,2006.OriginsandevolutionoftherecA/RAD51genefamily:Evidenceforancientgeneduplicationandsymbioticgenetransfer.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciencesUSA103:10328-10333PDFZahnL.M.*,KongH.*,Leebens-MackJ.H.,KimS.,SoltisP.S.,LandherrL.L.,SoltisD.E.,dePamphilisC.W.,MaH.,2005.TheEvolutionoftheSEPALLATAsubfamilyofMADS-boxgenes:Apre-angiospermoriginwithmultipleduplicationsthroughoutangiospermhistory.Genetics169:2209-2223(*co-firstauthors)PDFKimS.,KohJ.,YooM.-J.,KongH.,HuY.,MaH.,SoltisP.S.,SoltisD.E.,2005.ExpressionoffloralMADS-boxgenesinbasalangiosperms:Implicationfortheevolutionoffloralregulators.ThePlantJournal43:724-744PDFLiG.-S.,MengZ.,KongH.-Z.,ChenZ.-D.,TheissenG.,LuA.-M.,2005.CharacterizationofcandidateclassA,B,andEfloralhomeoticgenefromtheperianthlessbasalangiospermChloranthusspicatus(Chloranthaceae).Development,GenesandEvolution215(9):437-449PDFSoltisD.E.,AlbertV.A.,KimS.,YooM.-J.,SoltisP.S.,FrohlichM.W.,Leebens-MackJ.,KongH.,WallK.,MaH.,dePamphilisC.W.2005.EvolutionoftheFlower.InDiversityandEvolutionofPlants,Ed.R.Henry.CABIPublisherspp.165-200KongH.,Leebens-MackJ.,NiW.,dePamphilisC.W.,MaH.,2004.HighlyheterogeneousratesofevolutionintheSKP1genefamilyinplantsandanimals:Functionalandevolutionaryimplications.MolecularBiologyandEvolution21:117-128PDFWangG.*,KongH.*,SunY.*,ZhangX.,ZhangW.,AltmanN.,dePamphilisC.W.,MaH.,2004.Genome-wideanalysisofthecyclinfamilyinArabidopsisandcomparativephylogeneticanalysisofplantcyclin-likeproteins.PlantPhysiology135:1084-1099(*co-firstauthors)PDFZhangF.-M.,KongH.-Z.,GeS.,2003.AllozymevariationandpopulationdifferentiationoftheAconitumdelavayicomplexintheHengduanMountainsofChina.BiochemicalGenetics41:47-55PDFKongH.-Z.,ChenZ.-D.,LuA.-M.,2002.PhylogeneticrelationshipswithinChloranthusSw.(Chloranthaceae)basedonnuclearITSandplastidtrnL-Fsequencedata.AmericanJournalofBotany89(6):940-946PDFKongH.-Z.,LuA.-M.,EndressP.K.,2002.FloralorganogenesisofChloranthussessilifoliusK.F.Wu(Chloranthaceae)withspecialemphasisonthemorphologicalnatureoftheandroeciumofChloranthusSw.PlantSystematicsandEvolution232:181-188PDFKongH.-Z.,2001.ComparativemorphologyofleafepidermisoftheChloranthaceae.BotanicalJournaloftheLinneanSociety136:281-296PDFKongH.-Z.,2000.KaryotypesofSarcandraGardn.andChloranthusSw.(Chloranthaceae)fromChina.BotanicalJournaloftheLinneanSociety132:327-342PDFKongH.-Z.,ChenZ.-D.,2000.Phylogenyi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