中国科学院植物研究所地处美丽的香山脚下，占地74公顷，是我国植物基础科学的综合研究中心。其前身为1928年创建的静生生物调查所和1929年成立的北平研究院植物研究所，1950年合并为中国科学院植物分类研究所，1953年改为中国科学院植物研究所。1950年以来，先后获得国家自然科学奖一等奖2项，其他国家级、中科院和省部级科研成果奖160余项。
植物研究所以“整合植物生物学”为学科定位，围绕与植物学发展密切相关的国家战略需求——生态环境、现代农业、植物资源和系统进化等领域，利用实验生物学（包括“组学”）、生物信息学等最新技术和手段，通过植物系统本身不同组织层次（分子、亚细胞、细胞、组织、器官、个体、群体和生态系统）以及植物科学与相关学科和技术的交叉融合进行整合研究。
植物研究所目前拥有系统与进化植物学研究中心、植物生态学研究中心、分子发育生物学研究中心、光合作用研究中心、信号转导和代谢组学研究中心和植物园；综合办公室、人事教育处和科研计划财务处；文献与信息管理中心，还有系统与进化植物学国家重点实验室、植被与环境变化国家重点实验室、中国科学院光合作用与环境分子生理学重点实验室；内蒙古锡林郭勒草原生态系统国家野外科学观测研究站、内蒙古鄂尔多斯草地生态系统国家野外科学观测研究站、湖北神农架森林生态系统国家野外科学观测研究站、中国科学院北京森林生态系统定位研究站、多伦恢复生态学试验示范研究站、浑善达克沙地生态研究站、中国北方林生态系统定位研究站、东乌珠穆沁草原生态系统管理研究站、华西亚高山植物园；中国生态系统研究网络（CERN）生物分中心。
植物研究所主办的刊物有Journal of Integrative Plant Biology（植物学报） (SCI-E)、《植物分类学报》(SCI-E)、《植物生态学报》、《植物学通报》、《生物多样性》、《生命世界》、《中国植物园》、《植物引种驯化集刊》。
植物研究所为国家首批批准的硕士和博士学位授予单位之一，目前博士学位授予点有植物学、发育生物学与生态学；硕士学位授予点有植物学、发育生物学、细胞生物学与生态学。并设有博士后流动站。
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