基本信息
张竹青女硕导生命科学学院
电子邮件： zhuqingzhang@ucas.ac.cn
通信地址： 北京市玉泉路19号（甲）
邮政编码： 100049

研究领域主要研究方向为生物大分子构象变化相关的计算机模拟工作，包括蛋白质折叠，别构机制，固有无序蛋白质的结构特征和功能关系。蛋白质体系相分离的机制。

招生信息
招生专业071023-计算生物学
071011-生物物理学

招生方向生物大分子计算机模拟


教育背景2000-09--2005-06中科院化学所博士
1995-09--2000-07北京化工大学学士

学历
学位

工作经历2005-2007 北京大学化学与分子工程学院，理论生物中心，博士后
2008-2011 加拿大多伦多大学医学院生物化学系，博士后
2011.6-现在 中科院研究生院生命科学学院 副教授
社会兼职

教授课程计算生物学讨论课（助教）
现代药物分析
高级生物化学（助教）
计算生物学
生物单分子技术
文献阅读课

生物单分子技术

专利与奖励
奖励信息
专利成果

出版信息
代表性论文：


1. Qian Li?, Xiaojun Peng?, Yuanqing Li, Wenqin Tang, Jia'an Zhu, Jing Huang, Yifei Qi and Zhuqing Zhang. LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro.Nucleic Acids Res., (https://doi.org/10.1093/nar/gkz778) (?equal contribution)
2. Likun Zhao, Luhua Lai, Zhuqing Zhang. How calcium ion binding induces the conformational transition of the calmodulin N-terminal domain-an atomic level characterization. Phys Chem Chem Phys. 2019,21;19795-19804.
3. Likun Zhao, Yanhua Ouyang, Qian Li, Zhuqing Zhang. Modulation of p53 N-terminal transactivation domain 2 conformation ensemble and kinetics by phosphorylation. J Biomol Struct Dyn. 2019 Jul 8:1-11
4. Yanhua Ouyang, Likun Zhao, Zhang Z. Characterization of the structural ensembles of p53 TAD2 by molecular dynamics simulations with different force fields. Phys Chem Chem Phys. 2018,20:8676-8684.

5. Hu J, Chen T, Wang M, Chan HS, Zhang Z. A critical comparison of coarse-grained structure-based approaches and atomic models of protein folding. Phys Chem Chem Phys. 2017,19:13629-13639.

6. Zhuqing Zhang, and Hue Sun Chan. Transition paths, diffusive processes, and preequilibria of protein folding.Proc Natl Acad Sci U S A. 2012,109:20919-20924
7. Zarrine-Afsar* A., Zhang* Z., Schweiker KL., Makhatadze GI., Davidson AR. and Chan HS. Kinetic Consequences of Native State Optimization of Surface-Exposed Electrostatic Interactions in the Fyn SH3 Domain. Proteins. 2012,80: 858-870 (*equal contribution)
8. Hue Sun Chan, Zhuqing Zhang, Stefan Wallin and Zhirong Liu. Native Topology, Local-Nonlocal Coupling, and Nonnative Interactions: Principles of Protein Folding from Coarse-Grained Models. Annu Rew Phys Chem. 2011,62:301-32
9. Zhuqing Zhang, and Hue Sun Chan. Competition between Native Topology and Nonnative Interactions in Simple and Complex Folding Kinetics of Natural and Designed Proteins. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010, 107:2920-2925
10. Zhuqing Zhang and Hue Sun Chan. Native Topology of the Designed Protein Top7 is not Conducive to Cooperative Folding. Biophys J. 2009,96:L25-L27
11. Zhuqing Zhang, Hao Chen, Luhua Lai. Identification of amyloid fibril-forming segments based on structure and residue-based statistical potential. Bioinformatics. 2007,23:2218-2225
12. Zhuqing Zhang, Hao Chen, Hongjun Bai, Luhua Lai. Molecular dynamics simulations on the oligomer formation process of the GNNQQNY peptide from yeast prion protein Sup35. Biophys J. 2007,93;1484-1492


发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） 分子动力学模拟研究蛋白质翻译中的反转运蛋白EF4的作用机制, 主持,市地级,2015-06--2017-06
（ 2 ） 磷酸化修饰对无序蛋白质p53TAD 的结构调控研究, 主持,市地级,2016-06--2018-12
（ 3 ） 蛋白质别构调控机制研究, 参与,国家级,2017-01--2021-12

参与会议（1）Influences of Native Energetic Heterogeneity and Many-body Interaction in ? Value Analysis of Protein FoldingZhang zhuqing2014-08-03
（2）Theoretical simulation study of transition paths and diffusive processe of protein folding生物信息学和计算生物学的前沿研究Zhuqing Zhang， Hue sun Chan2013-09-23
（3）Nonnative interaction influences on folding kinetics for small proteins Top7 and Fyn SH3 domain from coarse-grained models第17次国际生物物理大会暨第12次中国生物物理学术大会Zhuqing Zhang, Arash Zarrine-Afsar, Katrina L. Schweiker, George I. Makhatadze, Alan R. Davidson and Hue Sun Chan2011-10-30


合作情况
项目协作单位

指导学生已指导学生
王漠野硕士研究生071010-生物化学与分子生物学
胡杰硕士研究生085238-生物工程
现指导学生
欧阳艳华硕士研究生085238-生物工程
赵礼坤硕士研究生085238-生物工程
李倩硕士研究生085238-生物工程