基本信息
张佩珩男硕导中国科学院计算技术研究所
电子邮件： zph@ncic.ac.cn
通信地址： 北京海淀区科学院南路6号
邮政编码： 100190

研究领域计算机系统结构、可重构计算、人工智能、生物信息学、生命健康大数据智能分析

招生信息
招生专业081201-计算机系统结构

招生方向计算机系统结构


教育背景2000-09--2005-06中国科学院计算技术研究所获工学硕士学位
1985-09--1989-07南开大学电子科学系微电子专业获理学学士学位

学历 中科院计算所 2000 研究生毕业

学位 中科院计算所 2000 工学硕士学位


工作经历
工作简历2017-01~现在,中国科学院计算技术研究所系统结构部,总工
2011-09~2016-12,中国科学院计算技术研究所高性能计算机研究中心,主任
2005-12~2007-06,美国特拉华大学计算机体系结构与并行系统实验室,国家公派访问
2005-08~2011-08,国家智能计算机研究开发中心,副主任
1996-03~现在,中国科学院计算技术研究所,正研究员级高级工程师
1989-07~1996-03,交通部科学研究院,任助理研究员

社会兼职2019-01-09-今,中科驭数（北京）科技有限公司, 董事
2018-12-29-今,苏州智能计算产业技术研究院, 副院长
2017-08-14-今,北京中科寒武纪科技有限公司, 董事
2017-08-14-今,天津中科蓝鲸信息技术有限公司, 董事
2017-08-14-今,北京神州龙芯集成电路设计有限公司, 董事
2017-05-15-今,北京中科图灵基金管理有限公司, 董事


教授课程

专利与奖励
奖励信息（1） 曙光高效能计算机系统关键技术及应用, 二等奖, 国家级, 2013
（2） 曙光4000”系列高性能计算机系统, 二等奖, 国家级, 2007
（3） 曙光4000”系列高性能计算机系统, , 部委级, 2006
（4） 大规模机群管理系统, 二等奖, 部委级, 2005
（5） 曙光3000”和可扩展并行计算机系统, 二等奖, 国家级, 2004
（6） 曙光2000”超级服务器系统, 二等奖, 国家级, 2001
（7） 曙光2000”超级服务器系统, 一等奖, 部委级, 2000

专利成果（ 1 ） 使能单根I/O设备多根共享的适配装置、系统及方法, 发明, 2015, 第 5 作者, 专利号: CN8
（ 2 ） 一种基于网卡直连的全互连通信方法及装置, 发明, 2015, 第 5 作者, 专利号: CN9
（ 3 ） 一种面向高维度网络的路由器及路由方法, 发明, 2014, 第 5 作者, 专利号: CN5
（ 4 ） 一种集成网络路由器的众核处理器系统及其集成方法和实现方法, 发明, 2014, 第 5 作者, 专利号: CN4
（ 5 ） 一种支持I/O功能动态分配的虚拟热插拔系统及其工作方法, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN2
（ 6 ） 一种基板多芯片集成的大端口互连类芯片及实现方法, 发明, 2013, 第 4 作者, 专利号: CN5
（ 7 ） 实现分布式I/O资源池化的方法及装置, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN8
（ 8 ） 一种基于PCIe数据交换的通信方法及系统, 发明, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN5
（ 9 ） 一种用于多根共享系统的I/O重映射方法和装置, 发明, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN4
（ 10 ） 一种用于多根共享系统的直接I/O虚拟化方法和装置, 发明, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN0
（ 11 ） 用于多根I/O 虚拟化共享系统的I/O 资源管理方法, 发明, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN3
（ 12 ） 多根I/O虚拟化共享方法和系统, 发明, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN2
（ 13 ） 一种支持单根IO虚拟化用户级接口控制装置及其方法, 发明, 2012, 第 5 作者, 专利号: CN4
（ 14 ） 具有硬件加速功能的智能以太网卡, 发明, 2005, 第 2 作者, 专利号: CN6
（ 15 ） 一种多IO扩展接口的服务器主板装置, 发明, 2005, 第 4 作者, 专利号: CN5
（ 16 ） 长距离视频图形阵列信号传输装置, 发明, 2004, 第 1 作者, 专利号: CN0
（ 17 ） 基于双8b/10b编码器的16b/20b编码器逻辑实现方法, 发明, 2004, 第 5 作者, 专利号: CN0
（ 18 ） 一种光神经元结构和包含该结构的神经网络处理系统, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN3
（ 19 ） 一种针对基因数据的取样字典树索引的压缩方法和系统, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN9
（ 20 ） 一种用于可调谐光装置的控制装置与方法, 发明, 2018, 第 5 作者, 专利号: CN6
（ 21 ） 一种用于光网络的拓扑重构控制方法, 发明, 2017, 第 5 作者, 专利号: CN0


出版信息
发表论文（1）Comprehensive identification of peptides in tandem mass spectra using an efficient open search engine,Nature Biotechnology,2018,其他（合作组作者）
（2）STrieGD: A Sampling Trie Indexed Compression Algorithm for Large Scale Gene Data,NPC 2018: 15th Annual IFIP International Conference on Network and Parallel Computing,2018,其他（合作组作者）
（3）Deep Sequencing Big Data Oriented Computing Model and Architecture Research,Science & Technology Innovation Herald,2016,第1作者
（4）Accelerating Irregular Computation in Massive Short Reads Mapping on FPGA Co-processor,IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems,2016,第4作者
（5）SuperDragon:A Heterogeneous Parallel System for Accelerating 3D Reconstruction of Cryo-Electron Microscopy Images,ACM Transactions on Reconfigurable Technology and Systems,2015,第4作者
（6）Accelerating Millions of Short Reads Mapping on a Heterogeneous Architecture with FPGA Accelerator,FCCM '12 Proceedings of the 2012 IEEE 20th International Symposium on Field-Programmable Custom Computing Machines,2012,第6作者
（7）Short read DNA fragment anchoring algorithm,Bmc Bioinformatics,2009,第2作者
（8）Implementation of the Smith-Waterman algorithm on a reconfigurable supercomputing platform,HPRCTA '07 Proceedings of the 1st international workshop on High-performance reconfigurable computing technology and applications: held in conjunction with SC07,2007,第1作者
（9）A Reconfigurable Accelerator for Smith–Waterman Algorithm,IEEE Transactions on Circuits and Systems II: Express Briefs,2007,第4作者
（10）一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现,计算机研究与发展,2005,第1作者

发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） 面向新一代测序大数据量的计算模型与体系结构研究, 主持,国家级,2012-01--2016-12
（ 2 ） 云计算服务器关键技术研究, 主持,市地级,2011-01--2015-12
（ 3 ） 大规模光子集成芯片专项之项目五：大规模光子集成芯片验证系统, 主持,部委级,2016-07--2020-12

参与会议

合作情况
项目协作单位

指导学生已指导学生
杨佳硕士研究生081201-计算机系统结构
李兴建硕士研究生081201-计算机系统结构
李想硕士研究生081201-计算机系统结构
戴福鑫硕士研究生081201-计算机系统结构
王田硕士研究生085211-计算机技术
包小圳硕士研究生081201-计算机系统结构
金堰安硕士研究生081201-计算机系统结构
王炳琛硕士研究生081201-计算机系统结构
邵慧子硕士研究生081201-计算机系统结构
郑华杰硕士研究生085211-计算机技术
隽鹏辉硕士研究生085212-软件工程
宋佳硕士研究生085211-计算机技术
张少龙硕士研究生085211-计算机技术
张宁硕士研究生081201-计算机系统结构
曹旭硕士研究生081201-计算机系统结构
现指导学生
程任清硕士研究生085211-计算机技术
何平硕士研究生081201-计算机系统结构
李然硕士研究生081201-计算机系统结构
杨宇昊硕士研究生085211-计算机技术
陈尧麟硕士研究生081201-计算机系统结构
贺恒逸硕士研究生085211-计算机技术
张家珲硕士研究生081201-计算机系统结构