基本信息
徐自祥男硕导中国科学院天津工业生物技术研究所
电子邮件： xu_zx@tib.cas.cn
通信地址： 天津市空港经济区西七道32号
邮政编码：

研究领域

招生信息
招生专业085216-化学工程

招生方向计算生物学
合成生物学
系统生物学


教育背景2001-09--2006-09西北工业大学博士
1998-09--2001-06江苏大学硕士
1993-09--1995-06合肥师范学院本科毕业

学历
学位

工作经历
工作简历2014-04~现在,中国科学院天津工业生物技术研究所,副研究员
2009-04~2014-04,中国科学院天津工业生物技术研究所,助理研究员
2006-11~2009-03,东南大学,博士后
2001-09~2006-09,西北工业大学,博士
1998-09~2001-06,江苏大学,硕士
1993-09~1995-06,合肥师范学院,本科毕业

社会兼职

教授课程

专利与奖励
奖励信息
专利成果

出版信息
发表论文（1）In Silico Genome-Scale Reconstruction and Analysis of the Shewanella loihica PV-4 Metabolic Network,Journal of Biological Systems,2018,第1作者
（2）Saccharomyces cerevisiae transcription factors involved in multidrug resistance and their roles in the response to lignocellulose-derived inhibitors,Microbial Cell Factories,2017,第2作者
（3）Find_tfSBP: find thermodynamics feasible and smallest balanced pathways with high yield from large-scale metabolic networks,Scientific Reports,2017,第1作者
（4）High-throughput metagenomic analysis of petroleum-contaminated soil microbiome reveals the versatility in xenobiotic aromatics metabolism,Journal of Environmental Sciences,2017,第2作者
（5）全细胞网络重建与细胞工厂设计,生物化学与 生物物理进展,2014,第1作者
（6）ReacKnock: identifying reaction deletion strategies for microbial strain optimization based on genome-scale metabolic network,PLoS ONE,2013,第1作者
（7）Analysis of enhanced current-generating mechanism of Geobacter sulfurreducens strain via model-driven metabolism simulation,PLoS ONE,2013,第2作者
（8）Construction and analysis of the weighted-network model of energy metabolism in Escherichia. coli,PLoS ONE,2013,第1作者
（9）Development of Thermodynamic Optimum Searching (TOS) to Improve the Prediction Accuracy of Flux Balance Analysis,Biotechnology and Bioengineering,2013,第3作者
（10）产电微生物基因组及代谢网络分析,应用与环境 生物学报,2012,第2作者
（11）In-silico search for optimal fluxes and theoretical gene knockout strategies for E. coli,Chemical and Biochemical Engineering Quarterly,2011,第2作者

发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） 黑曲霉中央代谢与调控动态建模与柠檬酸高产机理研究, 主持,国家级,2014-01--2017-12
（ 2 ） 细胞网络重构与途径设计, 参与,国家级,2011-01--2015-08
（ 3 ） 工业微生物基因组测序及分析, 参与,国家级,2011-01--2013-12
（ 4 ） 化学品生物合成路线的计算模拟和优化, 主持,省级,2015-04--2018-03

参与会议（1）RegKnock: identifying gene knockout strategies for microbial strain optimization based on regulatory and metabolic integrated network第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会Zixiang Xu2014-10-06
（2）Find Smallest Balanced Pathway in Large-scale Metabolic Networks in Pseudo-Steady State ConditionZixiang Xu2012-06-24


合作情况
项目协作单位

指导学生