基本信息
纪运恒男硕导中国科学院昆明植物研究所
电子邮件： jiyh@mail.kib.ac.cn
通信地址： 昆明市蓝黑路132号
邮政编码： 650201
部门/实验室：中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室
研究领域（1）重要药用类群——重楼属的专著性研究
重楼属是一个具重要药用价值的植物类群，在我国有着悠久的药用历史，也是是 “云南白药”、“宫血宁”和“季德胜蛇药片”等著名商品药的主要原料。长期以来，重楼属的分类及系统发育一直存在诸多的问题和争论。针对这些问题和争论，采用分子系统学和系统发育基因组学等方面手段，对重楼属展开了全面的专著性研究。结果表明，广义重楼属并非一个单系类群，应分为重楼属Daiswa，北重楼属Paris和日本重楼属Kinugasa等3个独立的属；发现种间杂交可能在重楼属的物种形成中发挥重要作用；提出了重楼属植物应在中新世早期起源于东亚北纬35度附近地区，在以后全球气候逐渐变冷的过程中，逐步向低纬度扩散并进入到中国的亚热带地区的假说。在此基础上综合形态学与分子证据，对广义重楼属植物进行了全面的分类修订。相关研究成果发表在Annals of Botany, BMC Plant Biology, Frontiers in Plant Science、Planta Medica、Fitoterapia、Phytotaxa等期刊上。重楼属世界性专著（英文）的编研工作正在进行中。
（2）重要药用植物类群的DNA条形码
近年来，对人参属Panax、黄精属Polygonatum、丫蕊花属Ypsilandra、延龄草属Trillium等重要药用植物类群开展了系统发育基因组学和比较基因组学研究，旨在对这些药用类群活性次生代谢产物的生物合成途径进行探索，并利用基因组数据，开发非标准材料（生药或药物制剂）分子鉴定技术。研究成果在Molecular Ecology Resources, Conservation Genetics Resources, Frontiers in Plant Science、BMC Plant Biology、Current Genetics等期刊。
（3）植物分类学
专长于黑药花科、天南星科、人参属等类群及水生被子植物分类、鉴定，熟悉植物学拉丁文和国际植物命名法规。对云南高原湖泊及湿地水生植物进行过系统的调查与采集，参与了《云南湿地》专著中水生植物部分的编写。多次参加高黎贡山、横断山等地区及苍山、大山包等国家级自然保护区生物多样性调查工作，采集并鉴定了大量的植物标本，有丰富的野外工作和组织大规模植物资源考察的经验。
（4）生物地理学
中国亚热带地区因保存了诸多的北极-第三纪孑遗成分（Arcto-Tertiary relicts，如珙桐、银杏、银杉等）而在植物区系特征上表现出显著的古特有性，这种古特有性何时开始形成？其发展与演化与东亚晚第三纪以来的气候变化（如晚第三纪全球变冷、东亚季风气候的形成、第四纪冰期）有何联系？这些问题迄今尚未得到圆满的解决。我们结合化石和分子证据，对水青树、珙桐等北极-第三纪孑遗植物的演化历史进行了分析，初步发现这些孑遗植物在第四纪冰期来临之前即已迁移到中国亚热带地区，表明该地区植物区系早在晚第三纪就形成了古特有性的雏形。阶段性成果发表在Journal of Biogeography、American Journal of Botany、Frontiers in Plant Science等期刊上。



招生信息
招生专业071001-植物学

招生方向植物系统学，植物分类学，进化生态学，保护遗传学，植物资源学


工作经历1995年7月—1997年9月：四川省会理县民族中学，中学二级教师
2000年8月—2003年12月：中国科学院昆明植物研究所，研究实习员
2004年1月—2006年12月：中国科学院昆明植物研究所，助理实习员
2007年1月—2010年12：中国科学院昆明植物研究所，副研究员
2011年1月— ：中国科学院昆明植物研究所，植物进化生态学研究组，研究组长



社会兼职2018-12-31-2022-12-31,九三学社中央委员会科普工作委员会, 委员


教授课程

专利与奖励
奖励信息
专利成果（ 1 ） 一种打破滇重楼种子休眠的方法, 发明, 2011, 第 2 作者, 专利号: CN B


出版信息（1）Ji YH, Luo P, Pei SJ, and Xu JC. 2000. Traditional utilization of Chinese chellera (Stellera chamaejasme L.) in northwest Yunnan,China. Ethnobotany 12: 23~26.
（2）Ji YH, Li H, and Xu ZF. 2004. Arisaema menglaense (Araceae: Arisaemateae), a new species from southern Yunnan,China. Annales Botanici Fennici 41：133~135. (SCI, IF=0.600)
（3）Ji YH, Fritsch PW, Li H, Xiao TJ, and Zhou ZK, 2006. Phylogeny and classification of Paris (Melanthiaceae) inferred from DNA sequence data. Annals of Botany 98: 245~256. (SCI, IF=4.041)
（4）Ji YH, Zhou ZK, and Li H. 2006. Paris xichougensis, a new combination of Trilliaceae. Acta Phytotaxonomica Sinica 44: 612~613. (SCI)
（5）Ji YH, Li H, and Zhou ZK. 2006. Paris caobangensis (Trilliaceae), a new species from northernVietnam. Acta Phytotaxonomica Sinica 44: 699~702. (SCI)
（6）Dao ZL, Chen ST, Ji YH, and Li H. 2007. Typhonium baoshanense Z. L. Dao & H. Li, a new species of Araceae from western Yunnan,China. Acta Phytotaxonomica Sinica 45: 234~238. (SCI)
（7）Ji YH, Zhou ZK, and Li H. 2007. Four new synonyms in the genus Paris (Trilliaceae). Acta Phytotaxonomica Sinica 46: 388~390. (SCI)
（8）陈文允，纪运恒，邓敏，陈绍田，周浙昆. 2007. 西畴青冈—贵州壳斗科一新记录种. 云南植物研究 29：395~396.
（9）李嵘，刀志灵，纪运恒，李恒. 2007. 高黎贡山北段种子植物区系. 云南植物研究29: 601~615.
（10）李嵘，纪运恒，刀志灵，李恒. 2008. 高黎贡山东西坡种子植物区系的比较研究. 云南植物研究30: 129~138.
（11）Liu T, and Ji YH. 2009. PsbA-trnH sequence analysis from chloroplast on medicinal plants of Artemisia (Asteraceae). Chinese Agricultural Science Bulletin 25: 46~49.
（12）Zhang FM, Su T, Yang Y, Zhai YH, Ji YH*, and Chen ST. 2010., Development of seven novel EST-SSR makers from Cycas panzhihuaensis (Cycadaceae). American Journal of Botany 97: e159~162. (SCI, IF=2.811)
（13）Yang Y, Zhai YH, Liu T, Zhang FM, and Ji YH*. 2011. Detection of Valeriana jatamansi as an adulterant of medicinal Paris by length variation of chloroplast psbA-trnH region. Planta Medica 77: 87~91, 2011. (SCI, IF=2.342)
（14）Dao ZL, Ji YH, Liu T, Liu KM, and Li H. 2011. Development of ten polymorphic microsatellite loci for Fosbergia shweliensis (Rubiaceae), a crisis endangered tree. American Journal of Botany 98: e161~163 (SCI, co-first author, IF=2.811)
（15）Chen ST, Wu XY, Ji YH*, and Yang JB. 2011. Isolation and characterization of microsatellite loci in Pistacia weinmannifolia (Anacardiaceae). International Journal of Molecular Sciences 12: 7818~7823. (SCI, IF=3.226)
（16）翟艳红，杨莹，星耀武，纪运恒，周浙昆, 云贵高原多星韭二倍体—四倍体分布格局研究, 植物科学学报 29: 43～49, 2011
（17）Liu T, and Ji YH*. 2012. Molecular authentication of the medicinal plant Paris polyphylla Smith var. yunnanensis (Melanthiaceae) and its related species by polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Journal of Medicinal Plants Research. 6: 1181-1186.
（18）Tao CC, Yang ZY, Lu RR, Liu T, Ji YH*, and Chen ST. 2012. Microsatellite markers for the relictual dove tree, Davidia involucrata (Cornaceae). American Journal of Botany 99: e108~110. (SCI, IF=2.811)
（19）Yang ZY, Lu RR, Tao CC, Chen ST, and Ji YH*. 2012. Microsatellites for Tetracentron sinense (Trochodendraceae), a tertiary relict endemic to East Asia. American Journal of Botany 99: e230-232. (SCI, IF=2.811)
(20) Sun YX, Moore MJ, Yue LL, Feng T, Chu HJ, Chen ST, Ji YH, Wang HC, Li JQ. 2014. Chloroplast phylogeography of the East Asian Arcto-Tertiarny relic Tetracentron sinensis (Trochodendraceae). Journal of Biogeography 41: 1721-1732. (SCI, IF=4.248)
(21) Lu RR, Yang ZY, Tao CC, Chen ST, and Ji YH*. 2014. Microsatellite primer development for Ottelia accuminata (Hydrocharitaceae), a submerged macrophyte endemic to southwestern China. Guihaia 34: 34-37.
(22) Li XJ, Huang YL, Yang ZY, and Ji YH*. 2015. Complete chloroplast genome of the medicinal plant Paris polyphylla var. chinensis (Melanthiaceae). Journal of Tropical and Subtropical Botany 23: 601-613.
(23) Huang YL, Li XJ, Yang ZY, Yang CJ, Yang JB, Ji YH*. 2016. Analysis of complete chloroplast genome sequences improves phylogenetic resolution of Paris (Melanthiaceae). Frontier in Plant Science 7: 1797. doi: 10.3389/fpls.2016.01797 (SCI, IF=4.298)
(24) Ji YH^*, Yang CJ, Huang YL. 2017. A new species of Paris sect. Axiparis (Melanthiaceae) from Yunnan, China. Phytotaxa 306: 234-236. (SCI, IF=1.240)
(25) Qin XJ, Si YA, Chen Y, Liu H, Ni W, Yan H, Shu T, Ji YH, Liu HY. 2017. Cytotoxic steroidal saponins from Trillium kamtschaticum. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 67: 2267-2273. (SCI, IF=2.454)
(26) Yang ZY, Ji YH^*. 2017. Comparative and phylogenetic analyses of the complete chloroplast genomes of three Arcto-Tertiary relicts: Camptotheca acuminata, Davidia involucrata, and Nyssa sinensis. Frontier in Plant Science 8: 1536. doi.org/10.3389/fpls.2017.01536 (SCI, IF=4.298)
(27) Shi YC, Yang LF, Yang ZY, Ji YH^*. 2017. The complete chloroplast genome of Pleione bulbocodioides (Orchidaceae). Conservation Genetics Resources (published online) doi: 10.1007/s12686-017-0753-x (SCI, IF=0.470)
(28) Lu TX, Shu T, Qin XJ, Ni W, Ji YH, Chen QR, Zhao Q, Liu HY. 2017. Spirostanol saponins from Ypsilandra parviflora induce platelet aggregation. Steroids, 123: 55-60 (SCI, IF=2.282)



发表著作

科研活动
参与会议

合作情况
项目协作单位

指导学生已指导学生
张芳铭硕士研究生071001-植物学
卢然然硕士研究生071001-植物学
陶程程硕士研究生071001-植物学
李晓娟硕士研究生071001-植物学
时有财硕士研究生071001-植物学
黄玉玲硕士研究生085238-生物工程