细胞工厂设计课题组
胡黔楠男博导中国科学院上海营养与健康研究院
电子邮件： hu_qn@tib.cas.cn
通信地址： 中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）
邮政编码：

细胞工厂设计定位于微生物细胞工厂设计。致力于为智能生物制造提供信息决策流程化服务，以生物合成、制造相关的大数据研究为基础，解决大宗化学品、生物基产品以及高附加值天然药物的细胞工厂设计的核心科技问题，开发细胞工厂设计流程化系统，创造符合工业化需求的工业菌种。部分在线工作见于实验室网站：http://www.rxnfinder.org，以及http://www.ditad.org。

招生信息基于研究组已有的信息化系统，进行相关模块的完善、拓展和应用。
具有国内外著名院校或研究机构授予的生物信息学、计算生物学、系统生物学、分子生物学、微生物学、生物化学、天然药物化学等相关专业的学士及以上学位，在系统生物学、合成生物学、代谢工程等方面有较强的科研背景，有从事信息导向细胞工厂设计与应用的兴趣。
有较强的工作责任心、组织协调能力和团队协作精神；具有独立开展科研工作的能力；有强烈的科研兴趣，语言表达与写作能力较好。
课题组急需多个专业、多种层次人才的加盟。
招生专业071023-计算生物学
085238-生物工程

招生方向合成生物学


教育背景2001-09--2004-06中南大学博士
1998-09--2001-06中南大学硕士
1993-09--1997-07中南工业大学学士

学历
学位

工作经历
工作简历2017-07~现在,中国科学院上海生命科学研究院,研究员
2014-11~2017-06,中国科学院天津工业生物技术研究所,研究员
2010-03~2014-11,武汉大学,副教授
2008-08~2010-02,京都大学,产官学研究员
2007-03~2008-07,加州大学尔湾分校,博士后
2004-10~2007-02,爱尔兰根-纽伦堡大学,博士后

社会兼职

专利与奖励
奖励信息（1） 中国化学会青年优秀论文奖, , 部委级, 2004

专利成果

出版信息
发表论文（1）SynBioEcoli a comprehensive metabolism network of engineered E. coli in three dimensional visualization.,Quantitative Biology,2017,通讯作者
（2）PhID: an open-access integrated pharmacology interactions database for drugs, targets, diseases, genes, side-effects and pathways.,Journal of Chemical Information and Modeling,2017,通讯作者
（3）EcoSynther: A customized platform to explore biosynthetic potential in E. coli.,ACS Chemical Biology,2017,通讯作者
（4）Multi-fields modelforpredictingtarget–ligand interaction,Neurocomputing,2016,通讯作者
（5）BioSynther: a customized biosynthetic potential explorer,Bioinformatics,2016,通讯作者
（6）Predicting target-ligand interactions using protein ligand-binding site and ligand substructures.,BMC Syst Biol,2015,通讯作者
（7）VNP: Interactive Visual Network Pharmacology of Diseases, Targets, and Drugs.,CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol,2014,第1作者
（8）Genome-scale screening of drug-target associations relevant to Ki using a chemogenomics approach.,Plos One,2013,通讯作者
（9）ChemoPy: freely available python package for computational biology and chemoinformatics.,Bioinformatics,2013,第3作者
（10）Assignment of EC numbers to enzymatic reactions with reaction difference fingerprints.,Plos One,2012,第1作者
（11）RxnFinder: biochemical reaction search engines using molecular structures, molecular fragments and reaction similarity.,Bioinformatics,2011,第1作者

发表著作