基本信息
蔡军男博导中国科学院北京基因组研究所
电子邮件： juncai@big.ac.cn
通信地址： 中国科学院北京基因组研究所
邮政编码： 100101

研究领域

招生信息

招生专业071022-基因组学
071021-生物信息学
071007-遗传学

招生方向体细胞组学分析；单细胞组学
精准基因组医学数据分析


教育背景1999-09--2005-12清华大学研究生-博士
1995-09--1999-09清华大学本科-学士

学历 -- 研究生

学位 -- 博士


工作经历
工作简历2009-05~现在,中国科学院北京基因组研究所,研究员
2006-03~2008-06,美国伊利诺伊大学香槟分校,博士后

社会兼职

教授课程精准基因组医学新技术前沿研讨课
遗传咨询与未来医疗
基因组学与医学健康研讨课
遗传咨询入门


专利与奖励
奖励信息
专利成果

出版信息
发表论文（1）Genetic Load and Potential Mutational Meltdown in Cancer Cell Populations,Molecular Biology and Evolution,2019-05,其他（合作组作者）
（2）DSMNC: a Database of Somatic Mutations in Normal Cells,Nucleic Acids Research,2019-01,通讯作者
（3）Histone arginine methylation by Prmt5 is required for lung branching morphogenesis through repression of BMP signaling,J Cell Sci,2018,第6作者
（4）Tumor diversity and evolution revealed through RADseq,Oncotarget,2017,第5作者
（5）体细胞谱系追踪研究进展,Research advances in lineage tracing of somatic cells,发育医学电子杂志,2017,通讯作者
（6）Acetoacetate Accelerates Muscle Regeneration and Ameliorates Muscular Dystrophy in Mice,Journal of Biological Chemistry,2016,第4作者
（7）Unique features of mutations revealed by sequentially reprogrammed induced pluripotent stem cells,Nature Communications,2015,通讯作者
（8）Whole Genome Sequencing Identifies Genetic Variances in Culture-Expanded Human Mesenchymal Stem Cells,Stem Cell Reports,2014,第1作者
（9）Exome sequencing identifies frequent mutation of MLL2 in non-small cell lung carcinoma from Chinese patients,Scientific Reports,2014,通讯作者
（10）Identification of medium-sized genomic deletions with low coverage, mate-paired restricted tags,BMC Genomics,2013,第4作者
（11）Determination of genomic copy number alteration emphasizing a restriction-site based strategy of genome re-sequencing,Bioinformatics,2013,通讯作者
（12）Sperm, but not oocyte, DNA methylome is inherited by zebrafish early embryos,Cell,2013,其他（合作组作者）
（13）Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data,PNAS,2011,第1作者
（14）Modeling co-expression across species for complex traits: insights to the difference of human and mouse embryonic stem cells,PLoS Computational Biology,2010,第1作者
（15）A core Klf circuitry regulates self-renewal of embryonic stem cells,Nature Cell Biology,2008,第2作者
（16）Cross-species de novo identification of cis-regulatory modules with GibbsModule: application to gene regulation in embryonic stem cells.,Genome Research,2008,第2作者
（17）A genome-wide survey of alternative translational initiation events in human.,Science in China Series C: Life Sciences,2007,第2作者
（18）Alteration of protein subcellular location and domain formation by alternative translational initiation.,Proteins,2006,第1作者
（19）Inferring protein -protein interactions from messenger RNA expression profiles with SVM.,Journal of Biological Systems,2005,第1作者
（20）ATID: a web-oriented database for collection of publicly available alternative translational initiation events,Bioinformatics,2005,第1作者
（21）Classifying G-protein coupled receptors with bagging classification tree,Computational Biology and Chemistry,2004,第2作者

发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） 诱导多能干细胞的单细胞起源和特异性基因组变异来源组成的研究, 主持,国家级,2016-01--2019-12
（ 2 ） 基因组学与表观遗传信息深度挖掘, 主持,国家级,2018-07--2020-12

参与会议（1）A survey of somatic genome deletions and HBV DNA insertions in a Hepatocellular Carcinoma (HCC) caseJun Cai2010-09-27


合作情况
项目协作单位

指导学生已指导学生
张卓凡硕士研究生085238-生物工程
李莹硕士研究生071022-基因组学
庄雯硕士研究生0710Z1-基因组学
李轩硕士研究生085238-生物工程
苗雪霞博士研究生0710Z1-基因组学
赵宁硕士研究生0710Z1-基因组学
现指导学生
王力飞博士研究生0710Z1-基因组学
于泽阳博士研究生0710Z1-基因组学
崔博宇博士研究生0710Z1-基因组学
许雯秋博士研究生0710Z1-基因组学
王晓丹硕士研究生0710Z1-基因组学
肖镜舒硕士研究生085238-生物工程
聂瑞博士研究生0710Z1-基因组学
李溪硕士研究生0710Z1-基因组学
王翠霞硕士研究生0710Z1-基因组学
李盼盼博士研究生0710Z1-基因组学