基本信息
孙宝发男硕导中国科学院北京基因组研究所
电子邮件： sunbf@big.ac.cn
通信地址： 北京市朝阳区北辰西路1号104楼
邮政编码： 100101

研究领域

招生信息
招生专业0710J3-生物信息学
0710Z1-基因组学
0710Z2-计算生物学

招生方向RNA甲基化表观转录调控


教育背景2009-09--2013-01中国科学院大学博士
2006-09--2009-09汕头大学硕士
2002-09--2006-09湖南科技大学学士

学历
学位

工作经历
工作简历2016-01~现在,中国科学院北京基因组研究所,副研究员
2013-07~2015-12,中国科学院北京基因组研究所,助理研究员
2009-09~2013-01,中国科学院大学,博士
2006-09~2009-09,汕头大学,硕士
2002-09~2006-09,湖南科技大学,学士

社会兼职

教授课程生物化学与分子生物学实验


专利与奖励
奖励信息（1） 中国科学院青年创新促进会会员, 院级, 2016

专利成果

出版信息
发表论文（1）5-methylcytosine promotes pathogenesis of bladder cancer through stabilizing mRNAs,Nature Cell Biology,2019-08,第1作者
（2）Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma,Cell Res,2019-07,第1作者
（3）A novel m6A reader Prrc2a controls oligodendroglial specification and myelination,Cell Research,2019,第1作者
（4）Identification of entacapone as a chemical inhibitor of FTO mediating metabolic regulation through FOXO1,Science Translational Medicine,2019,第1作者
（5）METTL3-mediated m6A modification is required for cerebellar development,Plos Biology,2018-06,第7作者
（6）mRNA m6A plays opposite role in regulating UCP2 and PNPLA2 protein expression in adipocytes,Int J Obes (Lond),2018,第1作者
（7）Circulating tumor DNA 5-hydroxymethylcytosine as a novel diagnostic biomarker for esophageal cancer,Cell Research,2018,第1作者
（8）5-Hydroxymethylome in Circulating Cell-free DNA as A Potential Biomarker for Non-small-cell Lung Cancer,Genomics Proteomics Bioinformatics,2018,第11作者
（9）Cytoplasmic m6A reader YTHDF3 promotes mRNA translation,Cell Research,2017,第11作者
（10）Mettl3-mediated m6A regulates spermatogonial differentiation and meiosis initiation,Cell Research,2017,第1作者
（11）5-methylcytosine promotes mRNA export - NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m5C reader.,Cell Research,2017,第1作者
（12）m6A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification,Nature,2017,第1作者
（13）A Balance of Yki/Sd Activator and E2F1/Sd Repressor Complexes Controls Cell Survival and Affects Organ Size,Dev Cell,2017,第5作者
（14）Nuclear m6A reader YTHDC1 regulates mRNA splicing,Molecular Cell,2016,第1作者
（15）Deep RNA sequencing analysis of syncytialization-related genes during BeWo cell fusion,Reproduction,2016,第5作者
（16）Bacteriophage WO can mediate horizontal gene transfer in endosymbiotic Wolbachia genomes,Front Microbiol,2016,第2作者
（17）Contribution of Multiple Inter-Kingdom Horizontal Gene Transfers to Evolution and Adaptation of Amphibian-Killing Chytrid, Batrachochytrium dendrobatidis,Front Microbiol,2016,第1作者
（18）Molecular analysis of DNA in blastocoele fluid using next-generation sequencing,J Assist Reprod Genet,2016,第11作者
（19）Dynamic m6A modification and its emerging regulatory role in mRNA splicing,Science Bulletin,2015,第1作者
（20）Genome-wide 5-hydroxymethylcytosine modification pattern is a novel epigenetic feature of globozoospermia,Oncotarget,2015,第2作者
（21）Discriminative host sanction together with relatedness promote the cooperation in fig/fig wasp mutualism,J Anim Ecol,2015,第2作者
（22）Non-quantitative adjustment of offspring sex ratios in pollinating fig wasps,Sci Rep,2015,第2作者
（23）Regulation of transcription factors on sexual dimorphism of fig wasps,Sci Rep,2015,第1作者
（24）Horizontal functional gene transfer from bacteria to fishes,Sci Rep,2015,第1作者
（25）Smg6/Est1 licenses embryonic stem cell differentiation via nonsense-mediated mRNA decay,EMBO J,2015,第5作者
（26）FTO and obesity: mechanisms of association,Diabetes Reports,2014,第2作者
（27）Mammalian WTAP is a regulatory subunit of the RNA N6-methyladenosine methyltransferase,Cell Research,2014,第1作者
（28）FTO-dependent demethylation of N6-methyladenosine regulates mRNA splicing and is required for adipogenesis,Cell Research,2014,第1作者
（29）Discriminative host sanctions in a fig-wasp mutualism,Ecology,2014,第3作者
（30）Redox-active quinones induces genome-wide DNA methylation changes by an iron-mediated and Tet-dependent mechanism,Nucleic Acids Res,2014,第10作者
（31）piRBase: a web resource assisting piRNA functional study,Database,2014,第4作者
（32）Multiple ancient horizontal gene transfers and duplications in lepidopteran species,Insect molecular biology,2013,第1作者
（33）Multiple interkingdom horizontal gene transfers in Pyrenophora and closely related species and their contributions to phytopathogenic lifestyles,PLoS One,2013,第1作者
（34）Obligate mutualism within a host drives the extreme specialization of a fig wasp genome,Genome biology,2013,第2作者

发表著作

科研活动
科研项目（ 1 ） m5C调控mRNA翻译的功能研究, 主持,国家级,2017-01--2020-12
（ 2 ） RNA m6A甲基化修饰调控mRNA选择性剪接机制研究, 主持,国家级,2015-01--2017-12
（ 3 ） RNA m6A 修饰甲基转移酶复合物及其表观调控因子鉴定和作用机制研究, 参与,国家级,2015-01--2018-12
（ 4 ） mRNA甲基化调控儿童TEL/AML1阳性急性淋巴细胞白血病发生发展机制研究, 参与,国家级,2015-01--2018-12
（ 5 ） 污染物诱发核酸损伤、修复与基因突变的分子机制, 参与,部委级,2014-06--2014-12
（ 6 ） 可逆化学修饰调控lncRNA二级结构机制及其功能研究, 参与,国家级,2018-01--2020-12
（ 7 ） 2016年青年创新促进会, 主持,部委级,2016-01--2019-12
（ 8 ） RNA结构对斑马鱼胚胎发育的调控机制研究, 主持,国家级,2019-01--2022-12

参与会议

合作情况
项目协作单位

指导学生