基本信息
陈德亮 男 硕导 生命科学学院
电子邮件：dlchen@ucas.ac.cn
通信地址：北京市玉泉路19号甲
邮政编码：100049


研究领域生物物理、生物化学及结构生物学

研究内容：

Rhodopsins是七次螺旋跨膜蛋白超家族的主要成员，在太古菌界（如：Bacteriorhodopsin、Halorhodopsin）、细菌界（如：Proteorhodopsin、Xanthorodopsin）以及高等真核界（如：Rhodopsin、Channelrhodopsin-1）中广泛分布。参与离子传递、信号转导以及能量转换等重要生命活动。

光驱动质子跨膜传递的Rhodopsin蛋白是其中的一个重要亚家族。它们借助特异性结合的视黄醛分子吸收可见光的能量，经历一系列中间体的结构变化（光循环）过程，最终将细胞质内侧的质子跨膜传递至细胞膜外侧，形成跨膜的质子梯度势能。部分极端古菌与海洋细菌利用此质子势能，驱动细胞膜上的三磷酸腺苷（ATP）酶合成生命活动所必需的ATP。是继氧化磷酸化、光合作用后的又一类产能方式。真菌中也发现有此亚家族蛋白，但生理功能至今未知。

我们长期的研究目标：

开展Rhodopsin蛋白家族的结构与功能的研究，进行蛋白的结构设计，结合自然进化模拟以改造出全新的功能与性状；阐明Rhodopsin蛋白在真菌等真核生物中的生理功能。

主要研究技术：

运用晶体衍射、顺磁共振、原子力显微镜等结构生物学技术研究Rhodopsin家族蛋白的空间结构以及构象变化。

运用超快时间分辨光谱、多波长吸收光谱、微电流分析等谱学方法研究膜蛋白传递离子的动力学过程。

运用荧光光谱、分子标记、免疫沉淀等细胞生物学方法研究Rhodopsin蛋白在细胞中的定位及生理功能。




研究兴趣：

1） 细胞离子通道的结构功能及离子跨膜传递机理
2） 空间定位顺磁共振技术在生物大分子结构解析中的应用
3） 膜蛋白结晶的新方法：Lipid Cubic Phase和Bicelle
4） 蛋白质分子结构的人工设计与功能改造
招生信息欢迎化学、生物、物理等理工科专业的学生报考。

欢迎对本研究领域感兴趣的大学本科学生申请毕业设计。
招生专业 生物物理学



招生方向 膜蛋白的结构与功能，蛋白质的分子结构设计与功能改造，顺磁共振


教育背景 1998-09--2003-06 中国科学院生物物理研究所 硕博连读研究生
1993-09--1997-06 厦门大学 本科生


出国学习工作2003-2008
美国加州大学Irvine分校，生理生物物理系，Postgraduate Researcher

2008-2009
美国加州大学Irvine分校，生理生物物理系，Assistant Specialist


学位 中科院生物物理研究所 -- 博士

工作经历2009-目前
中国科学院研究生院，讲师、副教授
教授课程 纳米生物学、 文献阅读课、 蛋白质晶体学
出版信息

发表论文 （1） A Light-Powered Bio-Capacitor with Nanochannel Modulation，Advanced Materials，2014，第5作者
（2） A proteorhodopsin-based biohybrid light-powering pH sensor，Physical Chemistry Chemical Physics，2013，通讯作者
（3） Effect of VIVO(dipic-Cl)(H2O)2 on Lipid Metabolism Disorders in the Liver of STZ-Induced Diabetic Rats，Journal of Diabetes Research，2013，通讯作者
（4） 氮氧自由基自旋探针R1 在特定空间位点上对bacteriorhodopsin 产生颜色调谐效应的机理分析，Color Tuning in bacteriorhodopsin induced by nitroxide free radical spin probe R1 at specific site，生物物理学报，2010，第1作者
（5） 质子传递蛋白Bacteriorhodopsin颜色调谐的机理，Mechanism of color tuning in proton transporter bacteriorhodopsin，中国科学院研究生院学报，2010，第1作者
（6） 菌紫质光循环中N态的结构变化，Structural changes in the N and N’ states of the bacteriorhodopsin photocycle， Biophysical Journal，2009，第1作者
（7） 菌紫质O态的结构变化的顺磁共振研究，Electron paramagnetic resonance study of structural changes in the O photointermediate of bacteriorhodopsin，Journal of Molecular Biology，2007，第1作者
（8） 高碱性诱导菌紫质紫膜变性下的结构变化，Structural changes of purple membrane and bacteriorhodopsin during its denaturation，Journal of Physical Chemistry B，2005，第2作者
（9） 分子识别介导的紫膜定向组装，Oriented assembly of purple membrane on solid support mediated by molecular recognition，Journal of Physical Chemistry B，2003，第1作者


发表著作
科研活动

科研项目 （1） 膜蛋白Leptosphaeria rhodopsin 二聚化组装的结构机制，主持，国家级，2013-01--2016-12
（2） 视黄醛蛋白Leptosphaeria Rhodopsin中的质子跨膜传递机制的研究，主持，国家级，2012-01--2015-12
（3） 跨膜质子传递通道Leptosphaeria-rhodopsin结构与功能的研究，主持，部委级，2011-07--2013-06


参与会议
合作情况合作实验室：

Lanyi Janos K. University of California, Irvine
Brown Leonid University of Guelph
项目协作单位中国科学院生物物理研究所

指导学生已指导学生

孟倩 硕士研究生 085238-生物工程

现指导学生

赵宏深 硕士研究生 071011-生物物理学

李龙杰 硕士研究生 085238-生物工程

季亮亮 硕士研究生 071011-生物物理学