1、招生信息2、教育背景3、工作经历4、教授课程5、专利与奖励6、出版信息7、科研活动8、合作情况9、指导学生
基本信息
刘文 男 博导 中国科学院上海有机化学研究所
电子邮件： wliu@mail.sioc.ac.cn
通信地址： 上海市零陵路345号
邮政编码： 200032
研究领域
招生信息

招生专业070303


招生方向复杂天然产物的生物合成（遗传学、生物化学和化学）研究

教育背景1998-01--2000-07 美国加州大学戴维斯分校化学系 联合培养研究生
1994-09--2000-07 中国医学科学院（北京协和医科大学） 硕士、博士学位
1988-09--1992-07 四川大学 学士学位


学历

学位
工作经历

工作简历2010-08~现在, 中国科学院湖州生物制造创新中心, 中心主任
2003-08~现在, 中科院上海有机化学研究所, 研究员
2001-09~2003-08,美国威斯康星大学麦迪逊分校药学院, 研究助理
2000-09~2001-08,美国加州大学戴维斯分校化学系, 博士后
1998-01~2000-07,美国加州大学戴维斯分校化学系, 联合培养研究生
1994-09~2000-07,中国医学科学院（北京协和医科大学）, 硕士、博士学位
1988-09~1992-07,四川大学, 学士学位


社会兼职
教授课程生物有机化学

专利与奖励

奖励信息（1）上海市优秀学术带头人,院级,2013
（2）The Distinguished Lectureship Award（日本化学会）,院级,2013
（3）上海市领军人才,院级,2012
（4）中科院研究生优秀指导教师奖,院级,2012
（5）中国科学院优秀导师奖,院级,2011
（6）明治乳业生命科学奖（优秀奖）,院级,2010
（7）中国药学会-赛诺菲安万特青年生,院级,2010
（8）国务院特殊津贴,院级,2010
（9）中国科学院“百人计划”终期评估优秀,院级,2010
（10）现代生物技术集成的红霉素发酵生,国家级,2008


专利成果（ 1 ）诺丝七肽的生物合成基因簇,2011,第 1 作者,专利号: ZL 2009 1 **.7
（ 2 ）NOVEL GENE CLUSTER,2010,第 1 作者,专利号: PCT/CN2009/074178
（ 3 ）一种提高红霉素产量的方法,2010,第 1 作者,专利号: **3.5
（ 4 ）ΦC31介导的基因重组并应用于红霉素产生菌种的遗传改造,2011,第 1 作者,专利号: ZL 2009 1 **.4
（ 5 ）诺卡噻唑菌素的生物合成基因簇及其应用,2013,第 1 作者,专利号: ZL 2010 1 **.4
（ 6 ）一种萨菲菌素的生物合成基因簇,2013,第 1 作者,专利号: 2ZL 2009 1 **.8
（ 7 ）替曲卡星A的生物合成基因簇及其应用,2012,第 1 作者,专利号: ZL 2008 1 **.8
（ 8 ）诺卡噻唑菌素的生物合成基因簇及其应用,2010,第 1 作者,专利号: PCT/CN2010/075442
（ 9 ）氯丝菌素的生物合成基因簇及应用,2009,第 1 作者,专利号: ZL 2005 1 **.8
（ 10 ）阿嗪霉素的生物合成基因簇,2010,第 1 作者,专利号: ZL 2008 1 003478.8
（ 11 ）一种重组质粒、构建方法和用于红霉素产生菌的遗传改造,2010,第 1 作者,专利号: ZL 2007 1 **.9
（ 12 ）新型硫链丝菌素类似物及其制法和用途,2011,第 1 作者,专利号: **9.2
（ 13 ）新型氟代诺斯菌素及其制法和用途,2013,第 1 作者,专利号: ZL 2010 1 **.3
（ 14 ）基因工程改造六-甲基水杨酸合成酶并组合生物合成螺环乙酰乙酸内酯类抗生素,2012,第 1 作者,专利号: ZL 2009 1 **.8
（ 15 ）一种优化红霉素发酵组分的菌种、构建方法和用途,2012,第 1 作者,专利号: ZL 2007 1 **.4
（ 16 ）一种构建基因工程FK506高产菌株的方法和筑波链霉菌高产菌株,2011,第 1 作者,专利号: **0.X
（ 17 ）一种短链脱氢酶TsrU的功能及其应用,2012,第 1 作者,专利号: **7.0
（ 18 ）番红霉素的生物合成基因簇,2012,第 2 作者,专利号: ZL 2007 1 **.X
（ 19 ）一株淡黄色链霉菌突变菌株、构建方法及其用途,2013,第 1 作者,专利号: ZL 2011 1 **.6

出版信息

发表论文（1） Insight into bicyclic thiopeptide benefited from development of a uniform approach for molecular engineering and production improvement, Chemical Science , 2014, 第 5 作者
（2） Effect of Stereochemistry of Avermectin-Like 6,6-Spiroketals on Biological Activities and Endogenous Biotransformations in Streptomyces avermectinius, ChemBioChem , 2014, 第 5 作者
（3） Multiplexing of Combinatorial Chemistry in Antimycin Biosynthesis: Expansion of Molecular Diversity and Utility, Angewandte Chemie International Edition, 2013, 第 5 作者
（4） Opportunities and challenges from current investigations into the biosynthetic logic of nosiheptide-represented thiopeptide antibiotics, Current Opinion in Chemical Biology , 2013, 第 5 作者
（5） Biosynthesis of thiopeptide antibiotics and their pathway engineering, Natural Product Reports, 2013, 第 5 作者
（6） Spiroketal formation and modification in avermectin biosynthesis involves a dual activity of AveC, Journal of the American Chemical Society, 2013, 第 5 作者
（7） Characterization of a key aminoglycoside phosphotransferase in gentamicin biosynthesis, Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, 2013, 第 5 作者
（8） FK506 maturation involves a cytochrome P450 protein-catalyzed four electron oxidation in parallel with C-31 O-methylation, Journal of Bacteriology, 2013, 第 5 作者
（9） Aromatic polyketides produced by bacterial iterative type I polyketide synthases, ACS Catalysis, 2013, 第 5 作者
（10） ThioFinder: a web-based tools for the identification of thiopeptide gene clusters in DNA sequence, PloS One, 2012, 第 5 作者
（11） Biosynthetic pathway for high structural diversity of a common dilactone core in antimycin production, Organic Letter , 2012, 第 5 作者
（12） Improvement of FK506 production in Streptomyces tsukubaensis by genetic enhancement of the supply of unusual polyketide extender untis via utilization of two distinct site-specific recombination systems, Applied and Environmental Microbiology , 2012, 第 5 作者
（13） Radical-mediated enzymatic methylation: a tale of two SAMS, Accounts of Chemical Research, 2012, 第 5 作者
（14） Caerulomycins and collismycins share a common paradigm for 2,2’-bipyridine biosynthesis via an unusual hybrid polyketide-peptide assembly logic, of the American Chemical Society , 2012, 第 5 作者
（15） Insights into quinaldic acid formation in thiostrepton biosynthesis facilitating fluorinated thiopeptide generation, Chem. Biol. , 2012, 第 5 作者
（16） Insights into pyrroindomycin biosynthesis reveal a uniform paradigm for tetromate/tetronate formation, Journal of the American Chemical Society , 2012, 第 5 作者
（17） Complex biotransformations catalyzed by radical S-adenosylmethionine enzymes, Journal of Biological Chemistry , 2011, 第 5 作者
（18） An artificial attB site for specific recombination facilitates genetic manipulations towards improving the erythromycin A production in an industrial Saccharopolyspora erythraea strain, Applied and Environmental Microbiology , 2011, 第 5 作者
（19） Transcriptome mining of active biosynthetic pathways and their associated products in Streptomyces flaveolus, Angewandte Chemie International Edition , 2011, 第 5 作者
（20） Radical-mediated enzymatic carbon chain fragmentation-recombination, Nat. Chem. Biol. , 2011, 第 5 作者
（21） Characterization of NocL involved in thiopeptide nocarthiacin I biosynthesis, J. Biol. Chem. , 2011, 第 5 作者
（22） Thiostrepton maturation involving a deesterification-amidation way to process the C-terminally methylated peptide backbone, J. Am. Chem. Soc. , 2011, 第 5 作者
（23） Cloning, sequencing and characterization of the biosynthetic gene cluster of sanglifehrin A, a potent cyclophilin inhibitor, Mol. BioSyst. , 2011, 第 5 作者
（24） Knocking out of tailoring genes eryK and eryG in an industrial erythromycin-producing strain of Saccharopolyspora erythraea leading to overproduction of erythromycin B, C and D at different conversion ratios, Letters in Applied Microbiology , 2011, 第 5 作者
（25） NosA catalyzing carboxyl-terminal amide formation in nosiheptide maturation via an enamine dealkylation on the serine-extended precursor peptide, J. Am. Chem. Soc. , 2010, 第 5 作者
（26） Knocking out of tailoring genes eryK and eryG in an industrial erythromycin-producing strain of Saccaropolyspora erythraea leading to overproduction of erythromycin B, C and D at different conversion ratios, Lett. Appl. Microbiol., 2010, 第 5 作者
（27） Moving posttranslational modifications forward to biosynthesize the glycosylated antibiotic nocathiacin I in Nocardia sp. ATCC202099, Mol. BioSyst., 2010, 第 5 作者
（28） Insights into bacterial 6-methylsalicylic acid synthase and its engineering to orsellinic acid synthase for new spirotetronate generation, Chem. Biol., 2010, 第 5 作者
（29） Biosynthesis of 3-methoxy-5-methyl naphthoic acid and its incorporation into the antitumor antibiotic azinomycin B, Mol. Biosyst. , 2010, 第 5 作者
（30） Nosiheptide biosynthesis featuring a unique indole side ring formation on the characteristic thiopeptide framework, ACS Chem. Biol., 2009, 第 5 作者
（31） Thiopeptide biosynthesis featuring ribosomally synthesized precursor peptides and conserved posttranslational modifications, Chem. Biol. , 2009, 第 5 作者
（32） Dissection of two transfer reactions centered on acyl-S-carrier protein intermediates for incorporating 5-chloro-6-methyl-O-methylsalicyclic acid into chlorothricin, ChemBioChem, 2008, 第 5 作者
（33） Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis, Chem. Biol., 2008, 第 5 作者
（34） Cloning and characterization of the tetrocarcin A gene cluster from Micromonospora chalcea NRRL 11289 reveals a highly conserved stratety fro tetronate biosynthesis in spirotetronate antibiotics, J. Bacteriol., 2008, 第 5 作者
（35） Genetic modulation of the overexpression of tailoring genes eryK and eryG leading to the improvement of erythromycin A purity and production in fermentation of Saccharopolyspora erythraea, Appl. Environ. Microbiol. , 2008, 第 5 作者
（36） Characterization of the saframycin A gene cluster from Streptomyces lavendulae NRRL 11002 revealing a NRPS system for assembling the unusual tetrapeptidyl skeleton in an iterative manner, J. Bacteriol. , 2008, 第 5 作者
（37） In vivo manipulation of the bleomycin biosynthetic gene cluster in Streptomyces verticillus ATCC15003 revealing new insights into its biosynthetic pathway, J. Biol. Chem., 2008, 第 5 作者
（38） A self-phosphopantetheinylating polyketide synthase producing a linear polyene to initiate the biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotics, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2008, 第 4 作者
（39） Characterization of the maduropeptin biosynthetic gene cluster from Actinomadura madurae ATCC 39144 supporting a unifying paradigm for enediyne biosynthesis, J. Am. Chem. Soc., 2007, 第 3 作者
（40） Single chemical modifications of the enediyne core of C-1027, a radiomimetic antitumor drug, result in markedly varied cellular responses to DNA double strand breaks, Cancer Res., 2007, 第 4 作者
（41） Cloning and characterization of a bacterial iterative type I polyketide synthase gene encoding the 6-methylsalicyclic acid synthase, Biochem. Biophys. Res. Commun. , 2006, 第 5 作者
（42） Cloning, sequencing and genetic characterization of the Chlorothricin gene cluster from Streptomyces antibioticus DSM 40725 as a model for spirotetronate antibiotic biosynthesis, Chem. Biol. , 2006, 第 5 作者
（43） Biosynthesis of the b-amino acid moiety of the enediyne antitumor antibiotic C-1027 featuring b-amino acyl-S-carrier protein intermediates, J. Am. Chem. Soc. , 2005, 第 4 作者
（44） The neocarzinostatin biosynthesis gene cluster from Streptomyces carzinostaticus ATCC15944 involved two iterative type I polyketide synthase, Chem. Biol. , 2005, 第 1 作者
（45） Biochemical characterization of the SgcA1 ？-D-glucopyranosyl-1-phosphate thymidyltransferase from the enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthetic pathway and overexpression of sgcA1 in Streptomyces globisporus to improve C-1027 production, J. Natl. Prod. , 2004, 第 2 作者
（46） A novel dehydroalanine-dependenttyrosine aminomutase in enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthesis, J. Am. Chem. Soc., 2003, 第 2 作者
（47） Discovering and Expressing Cryptic Metabolic Pathways: Enediyne Natural Products as a Paradigm, Nat. Biotechnol. , 2003, 第 4 作者
（48） Rapid PCR Amplification of Minimal Enediyne PKS Cassettes Leads to a Predictive Familial Classification Model For Divergent Enediyne PKS Genes, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2003, 第 1 作者
（49） Biosynthesis of Enediyne Antitumor Antibiotic C-1027, Science , 2002, 第 1 作者
（50） Genes for Production of Enediyne Antitumor Antibiotic C-1027 in Streptomyces globisporus are Clustered with the cagA Gene that Encodes the C-1027 Apoprotein, Antimicrob. Agent. Chemother., 2000, 第 1 作者


发表著作
科研活动

科研项目（ 1 ）新型聚酮和聚肽类抗生素的次生代谢（生物合成）研究, 主持, 国家级, 2009-01--2012-12
（ 2 ）具有重要生理活性的天然产物的化学合成, 参与, 国家级, 2009-09--2014-08
（ 3 ）以产量提高、品质优化为导向的重要抗生素工业用生产菌株的代谢工程改造研究, 主持, 国家级, 2011-02--2013-12
（ 4 ）以生物合成机制解析为基础的抗生素结构改造和品质优化研究, 主持, 省级, 2013-07--2015-06
（ 5 ）化学理念指导的抗生素生产菌种遗传改造关键技术研究与应用, 主持, 部委级, 2013-01--2015-06
（ 6 ）化学小分子探针引导的细胞信号转导途径研究, 参与, 国家级, 2013-01--2015-12
（ 7 ）基于生物合成机制研究的林可霉素工业生产菌株的代谢工程改造项目支出计划, 主持, 研究所（学校）, 2012-01--2014-12
（ 8 ）天然产物独特结构单元的生物合成机制研究, 主持, 国家级, 2009-01--2012-12


参与会议（1）Biosynthesis-Based Mining of New PathwaysTheir Associated Natural Products 英国John Innes Centre-中国科学院 Wen Liu 2013-04-13
（2）Combinatorial Mining of New Biosynthetic PathwaysTheir Associated Natural Products 日本药学会第133届年会 Wen Liu 2013-03-23
（3）Biosynthetic Mining of New PathwaysTheir Associated Natural Products: 日本化学会第93届年会 Wen Liu 2013-03-09
（4）Generality and Specificity in Thiopeptide Biosynthesis 第十六届国际放线菌生物学大会会议(ISBA16) Wen Liu 2011-12-11
（5） Thiopeptide Antibiotic Biosynthesis: Generality and Specificity 2011年天然产物生物合成学术研讨会 Wen Liu 2011-09-16

合作情况

项目协作单位
指导学生