1、招生信息2、教育背景3、工作经历4、教授课程5、专利与奖励6、出版信息7、科研活动8、合作情况9、指导学生
基本信息
沈虎峻 男 硕导 大连化学物理研究所
电子邮件：hshen@dicp.ac.cn
通信地址：辽宁省大连市沙河口区中山路457号
邮政编码：116023


研究领域1. 发展GB-EMP粗粒化力场
针对有机小分子体系发展GB-EMP粗粒化力场，并将GB-EMP粗粒化力场应用于生物大分子体系，使得我们能快速并且准确地抓住生物大分子的主要动力学特征。

2. 蛋白质的动力学与功能的研究
针对RNA依赖的RNA聚合酶的功能的理论研究，深入理解RNA聚合酶的动力学行为与其功能关系，为其他RNA聚合酶或DNA聚合酶的理论研究打下坚实的基础。

3. 关于DNA的力学性质的研究
我们与美国宾州大学著名化学家Dr.Scott Milner一起，发展出一套研究DNA力学性质的理论方法，并使用分子动力学模拟研究不同序列的DNA的力学特性。

4. 关于DNA的G四联体折叠动力学
DNA的G四联体是由鸟嘌呤的核酸序列所构成的四股型态,在不同的一价阳离子如K+, Na+ 等，G四联体的动力学特征以及结构都不同。深入研究DNA的G四联体折叠动力学为癌症的基础研究提供一定的理论指导。

5. 关于蛋白质的折叠动力学研究
蛋白质的折叠问题一直是科学问题中最难解决的问题之一。蛋白质的折叠动力学的理论研究需要准确的分子力场和快速有效的取样手段。因此发展准确的分子力场以及有效的取样手段是蛋白质的折叠动力学研究的两个关键。

招生信息物理化学

计算化学和生物
教育背景

学历1992/8-1996/6 天津南开大学 本科

1996/8-1999/6 天津南开大学新能源材料研究所 硕士研究生

2000/8-2006/5 美国约翰霍普金斯大学 博士研究生



学位理学博士
工作经历2006/6-2008/8 美国康莱尔大学 博士后

2008/9-2010/9 美国宾州州立大学 博士后
出版信息1. Shen, Hujun; Moustafa, Ibrahim M.; Cameron, Craig E.; Colina, Coray M. “Exploring the Dynamics of Four RNA-dependent RNA Polymerases by a Coarse-Grained model” J. Phys Chem. B 2012, 116, 14515-14524

2. Shen, Hujun; Sun, Hui; Li, Guohui “What is the role of motif D in the nucleotide incorporation catalyzed by the RNA-dependent RNA polymerase from Poliovirus” PLos. Comp. Bio. 2012, 8:e**.

3. Zhang, Dapeng; Shen, Hujun; Li, Guohui; Zhao, Bailin; Yu, Anchi; Wang, Hailin “Specific and Sensitive Fluorescence Anisotropy Sensing of G-quadruplex Structures via a Photo-induced Electron Transfer Mechanism” Analytical Chemistry 2012, 84:8088-8094.

4. Shen, Hujun; Hricko, Patrick J.; Colina, Coray M.; Milner, Scott T. ”Chiral elasticity of DNA” Soft Matter 2012, 8:10090-10094.

5. Shen, Hujun; Xia, Zheng; Li, Guohui; Ren, Pengyu. “A Review of Physics-Based Coarse-grained Potentials for the Simulations of Protein Structure and Dynamcis”Annual Reports in Computational Chemistry 2012, 8:129-148.

科研活动1. 863项目： 新药研发与蛋白质折叠数值模拟软件系统及应用(项目批准号：2012AA01A305)
2012-2015
子课题负责人
190万


2. 自然科学基金重大研究计划： 肿瘤靶向MRI/NIR 双模态自组装探针的构建及基于新型粗粒化分子模型的理论探索 (四）（项目批准号：**）
2013-2015
子课题负责人
15万