1、招生信息2、教育背景3、工作经历4、教授课程5、专利与奖励6、出版信息7、科研活动8、合作情况9、指导学生
基本信息
肖景发 男 硕导 中国科学院北京基因组研究所
电子邮件： xiaojingfa@big.ac.cn
通信地址： 北京市朝阳区北辰西路1-7号
邮政编码： 100101
研究领域
招生信息

招生专业071021


招生方向组学数据整合和挖掘

教育背景1998-09--2003-07 吉林大学 博士学位
1991-09--1995-07 四川大学生物系 学士学位


学历

学位
工作经历

工作简历2012-05~现在, 中国科学院北京基因组研究所, 研究员
2007-02~2012-05,中国科学院北京基因组研究所, 副研究员
2005-11~2007-02,美国犹他大学, 博士后
2003-07~2005-08,协和医科大学药物研究所, 博士后
1998-09~2003-07,吉林大学, 博士学位
1995-07~1998-08,沈阳第一制药厂, 助理工程师
1991-09~1995-07,四川大学生物系, 学士学位


社会兼职2013-09-01-今,遗传学会基因组学专业委员会,
2013-03-01-今,PloS One 杂志, 学术编委
2012-05-01-今,Frontiers in Plant science, 学术编委
2010-01-01-2014-01-01,运筹学会系统生物学分会, 理事

教授课程基因组学前沿讲座
基因组信息系统与实践
基因组学前沿
基因组学和生物技术前沿讲座
基因组学实用技术讲座

专利与奖励

奖励信息

专利成果（ 1 ）编码蛋白质DNA序列并行比对软件,2012,第 2 作者,专利号: 2012SR041110
（ 2 ）RNAdata anotation pipeline software 软件著作权,2012,第 2 作者,专利号: 2012SR013930
（ 3 ）泛基因组自动化分析软件计算机软件著作权,2013,第 2 作者,专利号: 2013SR053017
（ 4 ）人类转录组注释系统软件著作权,2013,第 2 作者,专利号: 2013SR058058
（ 5 ）虚拟中国人动态基因组数据库系统软件著作权,2014,第 1 作者,专利号: 2014SR113149
（ 6 ）大规模基因组数据泛基因组特征分析软件,2014,第 2 作者,专利号: 2014SR113147

出版信息

发表论文（1） The complete chloroplast genome provides insight into the evolution and polymorphism of Panax ginseng, Frontiers in Plant Science, 2015, 第 5 作者
（2） PanGP: A tool for quick analyzing bacterial pan-genome profile, Bioinformatics, 2014, 第 5 作者
（3） VCGDB: a dynamic genome database of Chinese population, BMC genomics, 2014, 第 5 作者
（4） Cassava Genome from a Wild Ancestor to Cultivated Varieties, Nature Communications, 2014, 第 3 作者
（5） Identification of Human HK Genes and Gene Expression Regulation Study in Cancer from Trancsriptomics Data Analysis, PLoS one, 2013, 第 2 作者
（6） Pan-genome provides insights into genome variation and evolution in Salmonella Paratyphi A, PLoS one, 2013, 第 5 作者
（7） WikiCell: a unified resource platform for human transcriptomics research, OMICS: A Journal of Integrative Biology, 2012, 第 5 作者
（8） An Integrated Analysis of Lineage-specific Small Proteins across Eight Eukaryotes Reveals Functional and Evolutionary Significance, Progress in Biochemistry and Biophysics, 2012, 第 5 作者
（9） Comparative genomic analysis of Streptococcus suis reveals significant genomic diversity among different serotypes, BMC Genomics, 2011, 第 5 作者
（10） Complete Genome Sequence of Streptococcus suis serotype 3 Strain JS3, Journal of Bacteriology, 2011, 第 5 作者
（11） Coevolution Study of Mitochondria Respiratory Chain Proteins: Toward the Understanding of Protein-Protein Interaction, Journal of Genetics and Genomics, 2011, 第 5 作者
（12） Complete Genome Sequence of Streptococcus suis serotype 14 Strain JS14, Journal of Bacteriology, 2011, 第 5 作者
（13） Homology Modeling and Molecular Dynamics Simulation Studies of Human Type 1 3？-Hydroxysteroid Dehydrogenase: Toward the Understanding of Cofactor Specificity, journal of computational chemistry, 2011, 第 5 作者


发表著作（ 1 ）基因组学核心实验方法, Genomics:essential methods, 科学出版社, 2012-03, 第 3 作者
（ 2 ）第二代测序信息处理, next-generation DNA sequencing informatics, 科学出版社, 2014-06, 第 2 作者

科研活动

科研项目（ 1 ）生物信息技术共享、转化研究平台建设, 参与, 国家级, 2012-01--2015-12
（ 2 ）基于RNA-seq策略研究天然反义转录本的调控机制, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
（ 3 ）南海部分海区重要微生物类群基因组多样性初步研究, 参与, 部委级, 2013-01--2015-12
（ 4 ）基于深度测序和Hi-C方法对染色体层次上基因表达调控机制的研究, 主持, 国家级, 2015-01--2018-12


参与会议（1）VCGDB: a dynamic genome database of the Chinese population 第8届国际生物编审会议 Yunchao Ling, Jiayan Wu, Jun Yu, Jingfa Xiao 2015-04-23
（2）Interrogating Transcriptome 第七届国际生物信息学研讨会 Jiang Zhu，Fuhong He, Jiayan Wu, Jingfa Xiao, Jun Yu 2009-06-18

合作情况

项目协作单位
指导学生