基本信息
徐健 男 博导 青岛生物能源与过程研究所
电子邮件：xujian@qibebt.ac.cn
通信地址：青岛市松岭路189号
邮政编码：266101
网 址：http://www.single-cell.cn http://www.qibebt.cas.cn/

研究重点研究方向：
主要研究兴趣为单细胞水平的功能基因组学、系统生物学和合成生物学。围绕微生物高效整合生物加工（CBP）的原理和机制这一科学问题，通过单细胞分析仪器系列（Single-Cell Analysis Instrument Series；SAIS）的合作研制和应用示范，揭示单细胞尺度的微生物群落调控与进化机制，设计与组装功能性的细胞群体。论文发表于Science、Plant Cell、Nature Commu.、PLoS Biology、PLoS Genetics、PNAS、Biotechnology Advances、ISME J、Analytical Chemistry、Biotechnology for Biofuels、Bioinformatics等70余篇，他引2800余次；专利或专利申请19项。担任Algal Research、Applied and Environmental Microbiology等编委以及中国微生物学会国际合作委员会委员等。基于“单细胞拉曼分选仪”、“单细胞遗传分析仪”等创新科研仪器体系，其主持的单细胞和元基因组特色技术平台正支撑着来自9个国家的30多个产学研团队在能源、环境、海洋、健康、农业、地质等领域的微生物群落研究。全部论文列表和全文下载见：https://www.researchgate.net/profile/Jian_Xu8。
招生信息

招生专业 生物化学与分子生物学



招生方向 系统生物学，功能基因组


教育背景 1997-09--2003-06 华盛顿大学(圣路易斯) 博士学位
1993-09--1997-06 北京大学 学士学位

工作经历

工作简历 2008-06--今 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 研究员，博士生导师，功能基因组团队负责人，生物资源中心主任
2004-07--2008-05 华盛顿大学基因组测序中心 “序列组装和分析”研究小组创建人和负责人
2003-07--2004-06 华盛顿大学基因组科学中心 博士后

专利与奖励

奖励信息 （1） 国家杰出青年基金（2014），国家级，2014
（2） 2013年中科院百篇优秀博士论文（作为导师），院级级，2013
（3） 科技部中青年科技创新领军人才推进计划（2013），部委级，2013
（4） 首届中组部****青年拔尖人才计划（2012），部委级，2012

出版信息

发表论文 （1） Cellulosome Stoichiometry in Clostridium Cellulolyticum Is Regulated by Selective Rna Processing and Stabilization. ，Nat Commun ，2015，通讯作者
（2） Choreography of transcriptomes and lipidomes of Nannochloropsis reveals the mechanisms of oil synthesis in microalgae. ，Plant Cell，2014，通讯作者
（3） Oral Microbial Structure Predicts Gingivitis Susceptibility and Severity.，ISME J ，2014，通讯作者
（4） Genome-wide identification of transcription factors and transcription-factor binding sites in oleaginous microalgae Nannochloropsis，Sci Rep，2014，通讯作者
（5） Nannochloropsis Genomes Reveal Evolution of Microalgal Oleaginous Traits.，PLoS Genet，2014，通讯作者
（6） Raman Activated Cell Ejection for Isolation of Single Cells.，Anal Chem ，2013，通讯作者
（7） Dissecting and Engineering Metabolic and Regulatory Networks of Thermophilic Bacteria for Biofuel Production.，Biotechnol Adv，2013，第2作者
（8） Microevolution from Shock to Adaptation Revealed Strategies Improving Ethanol Tolerance and Production in Thermoanaerobacter. ，Biotechnol Biofuels ，2013，通讯作者
（9） Structure and Regulation of the Cellulose Degradome in Clostridium Cellulolyticum. ，Biotechnol Biofuels ，2013，通讯作者
（10） Nannochloropsis Plastid and Mitochondrial Phylogenomes Reveal Organelle Diversification Mechanism and Intragenus Phylotyping Strategy in Microalgae. ，BMC Genomics ，2013，通讯作者
（11） Establishing Oleaginous Microalgae Research Models for Consolidated Bioprocessing of Solar Energy. ，Adv Biochem Eng Biotechnol ，2012，第4作者
（12） Saliva Microbiomes Distinguish Caries-Active from Healthy Human Populations.，ISME J ，2012，通讯作者
（13） The Thermoanaerobacter Glycobiome Reveals Mechanisms of Pentose and Hexose Co-Utilization in Bacteria.，PLoS Genet ，2011，通讯作者
（14） Evolution of Symbiotic Bacteria in the Distal Human Intestine. ，PLoS Biol，2007，第1作者
（15） A genomic view of the human-Bacteroides thetaiotaomicron symbiosis，Science，2003，第1作者
（16） Inaugural Article: Honor Thy Symbionts，Proc Natl Acad Sci USA，2003，第1作者

科研活动
指导学生已指导学生

林璐 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

李敬 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

黄冉冉 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

魏力 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

辛一 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

加晶 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

何曰辉 硕士研究生 085238-生物工程

胡建强 硕士研究生 071010-生物化学与分子生物学

现指导学生

滕琳 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

黄适 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

王险 硕士研究生 081703-生物化工

王勤涛 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

张鹏 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

何曰辉 博士研究生 071010-生物化学与分子生物学

苏晓泉 博士研究生 071005-微生物学