基本信息
徐平勇 男 博导 生物物理研究所
电子邮件:pyxu@ibp.ac.cn
电话:**
通信地址:北京市朝阳区大屯路15号
邮政编码:100101
研究领域1) 发展新型荧光蛋白和小分子探针及其相关的超高分辨显微成像新技术和方法
超高分辨率显微成像技术能够突破衍射极限,提供生物大分子纳米尺度的定位和结构信息,是生物成像的研究热点和发展趋势,为解决生命科学领域的诸多问题提供了新的可能。该技术获得了2014年诺贝尔化学奖。该技术的实现及其在细胞生物学的应用需要具有特殊光化学性质的荧光蛋白和小分子探针。本课题组根据不同超高分辨成像技术的特点和需求,开发具有相应潜能的新型荧光探针,进一步推动超高分辨率显微成像的发展和应用。目前,课题组主要集中在发展可用于多种超高分辨显微成像技术的荧光蛋白探针,同时发展可应用于光电联合显微成像技术的荧光探针等,并探讨它们在细胞生物学中的应用。
本课题组目前已经发展了多种能满足当前常用超高分辨成像方法的荧光蛋白探针,并与诺贝尔化学奖获得者、美国科学院院士等多个实验室合作,在超高分辨显微成像领域探针发展方向位列前3名。已取得的成果包括:开发了具有高亮度、完美单体性质和高标记密度的光转化荧光蛋白mEos3,可应用于光激活定位显微镜(Photoactivated localization microscopy,PALM)(PNAS、nature method);具有高信噪比,高光稳定性的光开光荧光蛋白Skylan系列,例如可应用于可逆饱和荧光转换显微镜(reversible saturable (or switchable) optical fluorescence transitions ,RESOLFT)的Skylan-R;非线性结构光照明显微镜(Nonlinerstructured-illumination microscopy,non-liner SIM)的Skylan-NS(Science);光学波动超高分辨成像技术(Superresolution optical fluctuation imaging,SOFI)的Skylan-S(ACS Nano)等。
2) 代谢性疾病分子机制研究
糖尿病是危害人类健康的一大杀手。糖尿病的发生与胰岛素分泌失调密切相关。胰岛素储存在胰岛β细胞中,β细胞的合成和代谢途径不仅可以调控胰岛素释放来控制血糖水平,还可以通过调节胰岛β细胞的数量和功能来影响胰岛素的合成与分泌。因此β细胞的代谢和功能对胰岛素的分泌调控作用至关重要。
本课题组将以代谢相关基因敲除小鼠和糖尿病易发基因敲除小鼠为模型,以胰腺β细胞这个主要的血糖代谢调控单元为出发点,研究调控胰腺β细胞合成和代谢途径的关键分子和信号通路,并通过高通量测序技术解析非编码RNA对胰腺β细胞的功能影响,有助于全面地认识糖尿病等代谢相关疾病的发生与发展机制。
招生信息
招生专业 生物物理学
细胞生物学
招生方向 超高分辨显微成像探针和技术
代谢性疾病分子机制研究
教育经历 2000-09--2004-06 华中科技大学 博士
1996-09--2000-06 华中师范大学 硕士
1992-09--1996-06 华中师范大学 学士
工作经历
工作简历 2010-10--今 中国科学院生物物理研究所 研究员
2006-09--2010-09 中国科学院生物物理研究所 副研究员
2004-09--2006-08 中国科学院生物物理研究所 博士后、助理研究员
社会兼职 2012-01--今 中国化学会生物物理化学专业委员会,委员
2011-09--今 Dataset Papers in Biology ,编委
2011-03--今 The Scientific World Journal,编委
2005-09--今 中国生物物理学会,会员
2005-09--今 美国生物物理学会,会员
专利与奖励
奖励信息 (1) 中科院青年创新促进会基金,院级级,2011
(2) 卢嘉锡青年人才奖,院级级,2009
(3) 国家自然科学奖,二等奖,国家级,2008
出版信息
发表论文 (1) Extended resolution structured illumination imaging of endocytic and cytoskeletal dynamics,Science,2015,第5作者
(2) Development of a Reversibly Switchable Fluorescent Protein for Super-Resolution Optical,ACS Nano,2015,通讯作者
(3) Bayesian localization microscopy based on intensity distribution of fluorophores,Protein Cell,2015,通讯作者
(4) The specific and rapid labeling of cell surface proteins with recombinant FKBP-fused fluorescent proteins,Protein Cell,2014,通讯作者
(5) Light-induced protein translocation by genetically encoded unnatural amino acid in Caenorhabditis elegans,Protein Cell,2013,通讯作者
(6) C13C4.5/Spinster, an evolutionarily conserved protein that regulates fertility in C-elegans through a lysosome-mediated lipid metabolism process ,Protein Cell,2013,通讯作者
(7) A sensitive and quantitative autolysosome probe for detecting autophagic activity in live and prestained fixed cells,Autophagy,2013,通讯作者
(8) An aromatic amino acid in the coiled-coil 1 domain plays a crucial role in the auto-inhibitory mechanism of STIM1,Biochemical Journal,2013,通讯作者
(9) A new series of reversibly switchable fluorescent proteins with beneficial properties for various applications,Proc Natl Acad Sci U S A,2012,通讯作者
(10) Rational design of true monomeric and bright photoactivatable fluorescent proteins,Nature Methods,2012,通讯作者
(11) Rational Design of ZnSalen as a Single and Two Photon Activatable Fluorophore in Living Cells,Chemical Science,2012,通讯作者
(12) A novel fluorescent protein pair for dual-color two-photon laser scanning microscopy.,Progress in Biochemistry and Biophysics.,2012,通讯作者
(13) Luminescent zinc salen complexes as single and two-photon fluorescence subcellular imaging probes,Chem Commun (Camb),2011,通讯作者
(14) HID-1 is a novel player in the regulation of neuropeptide sorting,Biochem J.,2011,通讯作者
(15) HID-1 is a peripheral membrane protein primarily associated with the medial- and trans- Golgi apparatus,Protein Cell,2011,通讯作者
(16) Mechanism of different spatial distributions of Caenorhabditis elegans and human STIM1 at resting state,Cell Calcium,2009,通讯作者
(17) Functional stoichiometry of the unitary calcium-release-activated calcium channel,Proc Natl Acad Sci U S A,2008,第1作者
(18) Overlapping functions of different dynamin isoforms in clathrin-dependent and -independent endocytosis in pancreatic beta cells,Biochem Biophys Res Commun,2008,通讯作者
(19) A pre-docking role for microtubules in insulin-stimulated glucose transporter 4 translocation,FEBS J.,2008,通讯作者
(20) Mapping the interacting domains of STIM1 and Orai1 in Ca2+ release-activated Ca2+ channel activation,J Biol Chem.,2007,第1作者
(21) Role of H(abc) domain in membrane trafficking and targeting of syntaxin 1A,Biochem Biophys Res Commun.,2007,通讯作者
(22) Interaction of Munc18 and Syntaxin in the regulation of insulin secretion,Biochem Biophys Res Commun.,2007,通讯作者
(23) Dissecting Multiple Steps of GLUT4 Trafficking and Identifying the Sites of Insulin Action, Cell Metab. ,2007,通讯作者
(24) Aggregation of STIM1 underneath the plasma membrane induces clustering of Orai1,Biochem Biophys Res Commun.,2006,第1作者
(25) Domain requirement for the membrane trafficking and targeting of syntaxin 1A,J Biol Chem.,2006,通讯作者
(26) Munc13-1 is required for the sustained release of insulin from pancreatic beta cells,Cell Metab.,2006,第3作者
(27) Direct interaction with syntaxin 1A defines the intracellular localization of Munc18a,Progress in Biochemistry and Biophysics,2005,第1作者
(28)A new pair for inter- and intra-molecular FRET measurement,Biochem Biophys Res Commun.,2005,第1作者
发表著作 (1) 光学纳米显微学和新型显微技术(章节:用于光学显微成像技术中的荧光蛋白),Optical Nanoscopy and Novel Microscopy Techniques (chapter: Fluorescent proteins for optical microscopy,pp 111-134),CRC Press,2014-07,第1作者
(2) 神经递质释放分子机制,Molecular Mechanisms of Neurotransmitter Release,Humana Press,2008-09,第2作者
科研活动
科研项目 (1) 多细胞生物自噬过程中膜的构建与融合,参与,国家级,2015-01--2020-12
(2) 新型荧光蛋白改造以及新型活细胞超高分辨显微成像方法研究,主持,国家级,2014-01--2017-12
(3) 《细胞代谢失调与糖尿病发生的分子机制》《2013CB910103》,主持,国家级,2013-01--2017-01
(4) 新型荧光蛋白改造用于超高分辨显微成像研究,主持,国家级,2013-01--2014-01
(5) 应用于双色超高分辨率成像的新型荧光蛋白的开发,主持,省级,2013-01--2016-12
(6) 非天然氨基酸荧光标记新方法用于超高分辨率胰岛素囊泡定位研究,主持,国家级,2012-01--2015-01
参与会议 (1) Reversibly switchable fluorescent proteins for single molecule localization-based super-resolution imaging,国际纯粹和应用生物物理学联盟大会 ,2014-08,Pingyong Xu
(2) Developing Photoactivitable Fluorescent Proteins for Diffraction-limited and Superresolution Imaging,第58届美国生物物理大会(超分辨成像分会主持),2014-02,Pingyong Xu
(3) Rational design of true monomeric and bright photoactivatable and photoconvertible fluorescent proteins,第十七届国际生物物理大会,2011-11,Mingshu Zhang, et al
(4) A new series of reversibly switchable fluorescent proteins (RSFPs) with beneficial properties for various applications,第十六届国际细胞生物学大会(ISCC),2011-07,Hao Chang et al
合作情况本课题组在超高分辨显微成像中的研究工作得到了该领域的广泛认可,许多国际国内著名的成像专家及其他领域专家都与申请人建立了紧密的合作关系。
项目协作单位HHMI,与2014 年诺贝尔化学奖获得者、超高分辨成像专家Eric Betzig合作,本课题组发展的新型荧光蛋白Skylan-SIM 在非线性结构光(NL-SIM)超高分辨显微成像技术取得重大突破,该工作文章已经被Science接收;
NIH ,与国际著名的美国科学院院士PALM 成像创始人Jennifer Lippincott-Schward合作,3B 成像方法上取得重大突破,正在准备写稿,有望近期发表;
国内与北京大学、中国科学院计算技术研究所等单位合作,并取得了一定成果。
指导学生现指导学生
刘奇 硕士研究生 071009-细胞生物学
王慧玉 硕士研究生 071011-生物物理学
付志飞 硕士研究生 071011-生物物理学
骆晨 博士研究生 071011-生物物理学
薛福东 博士研究生 071011-生物物理学
联合培养学生张茜 博士研究生 2011-2016 华中师范大学 联合培养
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
中国科学院大学研究生导师简介-徐平勇
中国科学院大学 免费考研网/2016-05-09
相关话题/技术 细胞 生物 生物物理学 细胞生物学
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