1、招生信息2、教育背景3、工作经历4、专利与奖励5、出版信息6、科研活动7、合作情况8、指导学生9、教授课程
基本信息
杨军 男 博导 城市环境研究所
电子邮件：jyang@iue.ac.cn
通信地址：福建厦门集美大道1799号
邮政编码：


研究领域富营养化与藻类水华、
微型生物生态与多样性、
生物监测与生态评价、
单细胞生物（原生动物，藻类，细菌）
招生信息欢迎对城市水生态安全（饮用水源地、景观水体、市政污水）、微型生物生态（细菌、藻类、原生动物）、生态健康与毒理等方面感兴趣的同学报考。


招生专业 环境科学
水生生物学
生态学

招生方向 淡水生态，富营养化，水源地生物监测与评价
原生动物，藻类，细菌等单细胞生物
群落生态，微型生物多样性与生态
教育背景 2001-09--2006-08 中国科学院水生生物研究所 理学博士
1997-09--2001-08 河北大学生命科学学院 理学学士


学历-- 研究生


学位-- 博士


出国学习工作2006.09－2008.11，加拿大Dalhousie大学地球科学系，Killam博士后
工作经历2008.11至今，中国科学院城市环境研究所，研究员、博士生导师
2006.09－2008.11，加拿大Dalhousie大学地球科学系，Killam博士后


社会兼职 2014-11--今 中国生态学学会淡水生态专业委员会委员
2014-03--今 国际微生物生态学会（ISME）会员
2009-09--今 国际有壳虫学会理事，理事
2009-07--今 中国原生动物学会理事，理事


工作简历 2008-11--今 中国科学院城市环境研究所 研究员
2006-09--2008-10 加拿大Dalhousie大学地球科学系 Killam博士后

专利与奖励福建省杰出青年基金（2012-2014年）

厦门市杰出青年基金（2010-2012年）

加拿大Killam博士后奖（2006-2008年）

中国科学院院长奖学金（2006年）

第12届国际原生动物学大会“最佳报告奖”（2005年）


奖励信息 （1） Izaak Walton Killam Postdoctoral Fellowship，一等奖，其他级，2006
（2） 中国科学院院长奖学金优秀奖，一等奖，院级级，2006


专利成果
出版信息64) Wang HT, Liao GS, D’Souza M, Yu XQ, Yang J, Yang XR, Zheng TL. 2015. Temporal and spatial variations of greenhouse gas fluxes from a tidal mangrove wetland in Southeast China. Environmental Science and Pollution Research(接受, SCI源刊)
63) 王丽娜, 陈辉煌, 刘乐冕, 余正, 杨军*. 2015. 亚热带分层水库固氮微生物时空分布格局. 生态学报 DOI: 10.5846/stxb**4 (接受, 通讯作者)
62) Wang LN, Yu Z, Yang J*, Zhou J. 2015. Diazotrophic bacterial community variability in a subtropical deep reservoir is correlated with seasonal changes in nitrogen. Environmental Science and Pollution Research(接受, SCI源刊, 通讯作者)

61) Wang YM, Liu LM, Chen HH, Yang J*. 2015. Spatiotemporal dynamics and determinants of planktonic bacterial and microeukaryotic communities in a Chinese subtropical river. Applied Microbiology and Biotechnology 99: 9255–9266 (SCI源刊, 通讯作者)
60) 王丽娜, 余正, 田野, 张文静, 杨军*. 2015. 基于克隆文库技术分析瘤棘砂壳虫的食物组成. 生态学报, 35: 6183–6188 (通讯作者)
59) Liu LM#, Yang J#, Lv H#, Yu XQ, Wilkinson DM, Yang J*. 2015. Phytoplankton communities exhibit a stronger response to environmental changes than bacterioplankton in three subtropical reservoirs. Environmental Science & Technology 49: 10850–10858 (SCI源刊, 通讯作者)
58) Liu Y, Yang J*. 2015. Complete mitochondrial genome of Esox reichertii (Amur pike). Mitochondrial DNA 26: 927–928 (SCI源刊, 通讯作者)
57) Liu LM, Yang J*, Yu Z, Wilkinson DM. 2015. The biogeography of abundant and rare bacterioplankton in the lakes and reservoirs of China. The ISME Journal 9: 2068–2077 (SCI源刊, 通讯作者)
56) Yu Z, Yang J*, Liu LM, Zhang WJ, Amalfitano S. 2015. Bacterioplankton community shifts associated with epipelagic and mesopelagic waters in the Southern Ocean. Scientific Reports 5:12897(SCI源刊, 通讯作者)
55) Wang YM, Yang J*, Liu LM, Yu Z. 2015. Quantifying the effects of geographical and environmental factors on distribution of stream bacterioplankton within nature reserves of Fujian, China. Environmental Science and Pollution Research 22:11010–11021 (SCI源刊, 通讯作者)
54) Yu LY, Zhang WJ*, Liu LM, Yang J. 2015. Determining microeukaryotic plankton community around Xiamen Island, southeast China, using Illumina MiSeq and PCR-DGGE techniques. PLoS ONE 10:e** (SCI源刊)
53) Yu XQ, Yang J*, Liu LM, Tian Y, Yu Z. 2015. Effects of Spartina alterniflora invasion on biogenic elements in a subtropical coastal mangrove wetland. Environmental Science and Pollution Research 22:3107–3115(SCI源刊, 通讯作者)
52) Gomaa F#,*, Yang J#,*, Mitchell EAD, Zhang WJ, Yu Z, Todorov M, Lara E. 2015. Morphological and molecular diversification of Asian endemic Difflugia tuberspinifera (Amoebozoa, Arcellinida): a case of fast morphological evolution in protists? Protist 166:122–130 (SCI源刊, 通讯作者)

51) 周菁, 余正, 刘开国, 田野, 余小青, 刘乐冕, 张文静, 杨军*. 2014. 典型亚热带热分层水库秋季细菌群落垂直分布. 生态学报, 34: 6205–6213(通讯作者)
50) Liu Y, Yang J*. 2014. The complete mitochondrial genome sequence of Xingkai topmouth culter (Culter alburnus). Mitochondrial DNA 25:451–453 ( SCI源刊, 通讯作者)
49) Wang YB, Zhang WJ*, Lin YS, Zheng LM, Cao WQ, Yang J. 2014. Spatial and seasonal variations of large Tintinnid ciliates in Shenhu Bay of China. Oceanological and Hydrobiological Studies 43:292–302 (SCI源刊)
48) Ju LH, Yang J*, Liu LM, Wilkinson DM. 2014. Diversity and distribution of freshwater testate amoebae (Protozoa) along latitudinal and trophic gradients in China. Microbial Ecology 68:657–670 (SCI源刊, 通讯作者)
47) Yu Z, Zhou J, Yang J*, Yu XQ, Liu LM. 2014. Vertical distribution of diazotrophic bacterial community associated with temperature and oxygen gradients in a subtropical reservoir. Hydrobiologia 741:69–77 ( SCI源刊, 通讯作者)
46) Liu LM, Yang J*, Lv H, Yu Z. 2014. Synchronous dynamics and correlations between bacteria and phytoplankton in a subtropical drinking water reservoir. FEMS Microbiology Ecology 90: 126–138 (SCI源刊, 通讯作者)
45) Yu Z, Yang J*, Amalfitano S, Yu XQ, Liu LM. 2014. Effects of water stratification and mixing on microbial community structure in a subtropical deep reservoir. Scientific Reports 4: 5821( SCI源刊, 通讯作者)
44) Wang YB, Zhang WJ*, Lin YS, Cao WQ, Zheng LM, Yang J. 2014. Phosphorus, nitrogen and chlorophyll-a are significant factors controlling ciliate communities in summer in the northern Beibu Gulf, South China Sea. PLoS ONE 9: e101121 (SCI源刊)
43) Yu Z, Yang J*, Liu LM. 2014. Denitrifier community in the oxygen minimum zone of a subtropical deep reservoir. PLoS ONE 9: e92055 ( SCI源刊, 通讯作者)
42) Lv H, Yang J*, Liu LM, Yu XQ, Yu Z, Chiang PC. 2014. Temperature and nutrients are significant drivers of seasonal shift in phytoplankton community from a drinking water reservoir, subtropical China. Environmental Science and Pollution Research 21:5917–5928 ( SCI源刊, 通讯作者)
41) Yu Z, Zhang WJ, Liu LM, Yang J*. 2014. Evidence for two different morphotypes of Difflugia tuberspinifera from China. European Journal of Protistology 50:205–211 ( SCI源刊, 通讯作者)
40) Yu Z, Yang J*, Yu XQ, Liu LM, Tian Y. 2014. Aboveground vegetation influences belowground microeukaryotic community in a mangrove nature reserve. Wetlands 34:393–401 ( SCI源刊, 通讯作者)
39) Tu YT, Chiang PC, Yang J, Chen SH, Kao CM. 2014. Application of a constructed wetland system for polluted stream remediation. Journal of Hydrology 510:70–78 (SCI源刊)
38) Yu Z, Yang J*, Zhou J, Yu XQ, Liu L M, Lv H. 2014. Water stratification affects the microeukaryotic community in a subtropical deep reservoir. Journal of Eukaryotic Microbiology 61:126–133 ( SCI源刊, 通讯作者)

37) Liu LM, Yang J*, Yu XQ, Chen GJ, Yu Z. 2013. Patterns in the composition of microbial communities from a subtropical river: Effects of environmental, spatial and temporal factors. PLoS ONE 8: e81232 (SCI源刊, 通讯作者)
36) Lv H, Yang J*, Liu LM. 2013. Temporal pattern prevails over spatial variability in phytoplankton communities from a subtropical water supply reservoir. Oceanological and Hydrobiological Studies 42:420–430 ( SCI源刊, 通讯作者)
35) Wang YB, Zhang WJ, Lin YS, Zheng LM, Cao WQ, Yang J. 2013. Spatial pattern of the planktonic ciliate community and its relationship with the environment in spring in the northern Beibu Gulf, South China Sea. Oceanological and Hydrobiological Studies 42: 470–479 (SCI源刊)
34) Wang CF, Yu XQ, Lv H, Yang J*. 2013. Nitrogen and phosphorus removal from municipal wastewater by the green alga Chlorella sp. Journal of Environmental Biology 34: 421–425 (SCI源刊, 通讯作者)
33) Liu LM, Zhang DH, Lv H, Yu XQ, Yang J*. 2013. Plankton communities along a subtropical urban river (Houxi River, southeast China) as revealed by morphological and molecular methods. Journal of Freshwater Ecology 28:99–112 (SCI源刊, 通讯作者)

32) Zhang YY, Yang J*, Yin XX, Yang SP, Zhu YG*. 2012. Arsenate toxicity and stress responses in the freshwater ciliate Tetrahymena pyriformis. European Journal of Protistology 48: 227–236 (SCI源刊, 通讯作者)
31) Yang J*, Yu XQ, Liu LM, Zhang WJ, Guo PY. 2012. Algae community and trophic state of subtropical reservoirs in southeast Fujian, China. Environmental Science and Pollution Research 19: 1432–1442 (SCI源刊, 通讯作者)
30) Zhang WJ, Lin YS, Cao WQ, Yang J. 2012 Genetic diversity and variance of Stentor coeruleus (Ciliophora: Heterotrichea) inferred from inter-simple sequence repeat (ISSR) fingerprinting. Journal of Eukaryotic Microbiology 59: 157–162 (SCI源刊)
29) Zhang YY, Zhang F, Yang J, Jiao NZ. 2012. Host responses of a marine bacterium, Roseobacter denitrificans OCh114, to phage infection. Archives of Microbiology 194: 323–330 (SCI源刊)
28) Yang J, Zhang YY, Liu LM, Wang CF, Yu XQ. 2012. Microbial community and urban water quality. Bulletin of the Chinese Academy of Sciences 26: 76–83
27) 余小青, 杨军*, 刘乐冕, 田原, 余正, 王昌付. 2012. 九龙江口滨海湿地生源要素空间分布特征. 环境科学, 33:3739–3747 (通讯作者)
26)刘乐冕, 杨军*, 余小青, 余正, 张永雨, 田野, 张冬红. 2012. 厦门后溪流域沿城乡梯度浮游细菌多样性及其与环境因子的关系. 应用与环境生物学报, 18: 591–598 (通讯作者)

25) Liu LM, Yang J*, Zhang YY. 2011. Genetic diversity patterns of microbial communities of in a subtropical riverine ecosystem (Jiulong River, southeast China). Hydrobiologia 678:113–125 (SCI源刊, 通讯作者)
24) Zhang YY, Chen ZH, Zhen Z, Yang J. 2011. Metaproteomic evaluation on the microbial community functions in a mesoscale cyclonic eddy perturbation. African Journal of Microbiology Research 5:3890–3894 (SCI源刊)
23) Zhang YY, Huang CX, Yang J*, Jiao NZ. 2011. Interactions between marine microorganisms and their phages. Chinese Science Bulletin 56: 1770–1777 (SCI源刊, 通讯作者)
22) Yin XX, Zhang YY, Yang J, Zhu YG. 2011. Rapid biotransformation of arsenic by a model protozoan Tetrahymena thermophila. Environmental Pollution 159:837–840 (SCI源刊)

21) 杨军*, Smith HG, Wilkinson DM. 2010. 北极、南极和西藏有壳虫区系与分布. 生物多样性, 18(4): 373–382 (通讯作者)
20) 刘乐冕, 杨军*, 张文静, 余正. 2010. 原生动物瘤棘砂壳虫六个自然种群的形态计量学分析. 动物学研究, 31(4): 435–443 (通讯作者)
19) 张文静, 杨军, 田野. 2010. 有壳肉足虫的结构、运动以及生殖. 生物学通报, 45(1): 12–14
18) Yang J, Smith HG, Sherratt TN, Wilkinson DM. 2010. Is there a size limit for cosmopolitan distribution in free-living microorganisms? A biogeographical analysis of testate amoebae from polar areas. Microbial Ecology 59:635–645 (SCI源刊, Cover story)
17) 张文静, 杨军*, 沈韫芬. 2009. 中国有壳肉足虫(原生动物)五新纪录描述. 动物分类学报, 34(3): 686–690 (通讯作者)
16) Yang J*, Zhang WJ, Shen YF. 2009. Relationships between testate amoebae assemblages (Protozoa) and geographic factors in Yunnan Plateau lakes, China. Journal of Freshwater Ecology 24:437–443 (SCI源刊, 通讯作者)
15) Yang J*, Zhang WJ, Shen YF, Feng WS, Wang XH. 2007. Monitoring of organochlorine pesticides using PFU systems in Yunnan lakes and rivers, China. Chemosphere 66: 219–225 (SCI源刊, 通讯作者)
14) Zhang WJ, Yang J, Yu YH, Shu SW, Shen YF. 2006. Population genetic structure of Carchesium polypinum (Ciliophora: Peritrichia) in four Chinese lakes inferred from ISSR fingerprinting: high diversity but low differentiation. Journal of Eukaryotic Microbiology 53: 358–363 (SCI源刊)
13) Yang J, Zhang WJ, Feng WS, Shen YF. 2006. Geographical distribution of testate amoebae in Tibet and northwestern Yunnan and their relationships with climate. Hydrobiologia 559: 297–304 (SCI源刊)
12) Yang J, Meisterfeld R, Zhang WJ, Shen YF. 2005. Difflugia mulanensis nov. spec. (Protozoa, Rhizopoda), a freshwater testate amoeba from Lake Mulan, China. European Journal of Protistology 41: 269–276 (SCI源刊, Cover story)
11) Yang J, Zhang WJ, Feng WS, Shen YF. 2005. Freshwater testate amoebae of nine Yunnan Plateau lakes, China. Journal of Freshwater Ecology 20: 743–750 (SCI源刊)
10) Yang J, Zhang WJ, Feng WS, Shen YF. 2005. Testate amoebae (Protozoa: Rhizopoda) from northwest Yunnan, China. Journal of Freshwater Ecology 20: 583–590 (SCI源刊)
9) Zhang WJ, Yang J, Yu YH, Shen YF. 2005. Identification, cloning and characterization of microsatellite DNA in Euglena gracilis. Journal of Eukaryotic Microbiology 52: 356–359 (SCI源刊)
8) Yang J, Shen YF. 2005. Morphology, biometry and distribution of Difflugia biwae Kawamura, 1918 (Protozoa: Rhizopoda). Acta Protozoologica 44: 103–111 (SCI源刊)
7) 杨军, 沈韫芬. 2005. 根足类原生动物半圆表壳虫壳体生物矿化特征. 动物学杂志, 40(1): 1–7
6) 杨军, 冯伟松, 沈韫芬. 2005. 中国砂壳虫属两新纪录种形态研究(表壳目, 砂壳科). 动物分类学报, 30(1): 52–56 (英文)
5) Yang J, Beyens L, Shen YF, Feng WS. 2004. Redescription of Difflugia tuberspinifera Hu, Shen, Gu et Gong, 1997 (Protozoa: Rhizopoda: Arcellinida: Difflugiidae) from China. Acta Protozoologica 43: 281–289 (SCI源刊)
4) 杨军, Beyens L, 沈韫芬, 冯伟松. 2004. 瘤棘砂壳虫(肉足亚门: 根足总纲)壳体元素组成. 动物学研究, 25(5): 452–455 (英文)
3) 杨军, 冯伟松, 沈韫芬. 2004. 中国砂壳虫属新纪录(肉鞭门, 根足总纲, 叶足纲, 表壳目, 砂壳科). 动物分类学报, 29(2): 239–247
2) 冯伟松, 杨军, 叶志鸿, 缪炜, 余育和, 黄铭洪, 沈韫芬. 2004. 凡口铅锌矿湿地处理系统的土壤原生动物. 动物学杂志, 39(1): 2–11
1) 杨军, 冯伟松, 缪炜. 2004. 中国淡水与土壤有壳肉足虫最新分类名录及其区系分析. 水生生物学报, 28(4): 426–433

科研活动

科研项目 （1） 亚热带分层水库营养状态波动的时空特征与微生态学机理，主持，国家级，2014-01--2017-12
（2） 湖泊与湿地生态系统对全球变化的响应及生态恢复对策研究，参与，国家级，2012-01--2016-08
（3） 水库型水源地有壳虫多样性及其与氮磷的关系，主持，国家级，2012-01--2015-12
（4） 中国东南沿海城市群环境污染调控技术与示范，参与，国家级，2012-01--2015-12
（5） 微型生物群落在水源地水质监测与预警中的应用，主持，市地级，2010-10--2012-09
（6） 厦门水库型水源地原生动物多样性及其水质监测，主持，院级级，2010-01--2012-12


参与会议
合作情况

项目协作单位
指导学生已指导学生

刘乐冕 博士研究生 083001-环境科学

吕宏 硕士研究生 083001-环境科学

刘瑜 博士研究生 083001-环境科学

鞠丽华 硕士研究生 083001-环境科学

余正 博士研究生 083001-环境科学

现指导学生

汪永明 博士研究生 083001-环境科学

王丽娜 硕士研究生 085229-环境工程

杨军 博士研究生 083001-环境科学

郭云艳 硕士研究生 071300-生态学

刘敏 博士研究生 083001-环境科学

薛媛媛 博士研究生 083001-环境科学

彭凤 硕士研究生 071300-生态学

教授课程