首都医科大学是北京市属的一所重点医科大学，基础医学院是首都医科大学基础教学中最大的也是最重要的教学与科研为一体的二级学院之一。现设院长1人、书记1人、副院长4人，学院共有教职工215人，其中教授24人、副教授41人、博士17人、硕士86人，下设院办公室和学生工作办公室，分管日常工作。学院下设八个系即八个学科群，他们是细胞生物学系、生理学系、免疫学系、解剖学与组织胚胎学系、神经生物学系、生物化学与分子生物学系、药理及化学系、病理学与病理生理学系。八个系内共设教研室11个，研究室3个，其中硕士学位授权点11个、博士学位授权点4个，博导9人、硕导37人。有2个北京市重点学科（神经生物学科、解剖学与组织胚胎学科），有5个重点建设学科（生理学科、药理学科、细胞生物学科、病理学科、病原生物学科）。目前所管的不同层次的在校生近1500人。

　　教学方面：本院已具有一批优秀的师资力量和较为先进的教学设备条件，每年承担研究生、七年制、本科生、高职等层次的医学、口腔、儿科、医学工程、预防医学、药学、检验等各专业课程的教学任务近2万标准课时。多年来为北京市培养了数以千计的毕业生，他们很多已成为北京市医药卫生事业的中坚和骨干力量，正在为北京市的医、教、管卫生事业发挥着重要的作用。此外，我院共有5个学生实验室通过了市教委评估，成为北京市合格实验室（解剖、生化、化学、机能、形态）。

　　科研方面：本院具有较强的科研实力，有两个北京市重点实验室：肝脏保护与再生调节实验室和神经损伤修复实验室。本院目前正从事着以帕金森氏病的基因治疗、神经损伤及修复、神经耐缺氧因子的研究、肝脏再生的研究、抗感染免疫研究、生化与分子生物学及组织工程学研究等为重点的各类科研课题。近三年本院承担各类课题182项，其中国家级的12项、市级的41项、局级的110项，多年来获得过市级以上各类科研成果奖120多项。

　　在党中央科教兴国战略方针指引下，面对着机遇和挑战，我们决心变压力为动力与时俱进，及时调整学科的建设与发展思路，制定了我院及学科建设发展的7年规划。我院的发展理念是进一步宽领域地整合北京市医学基础，临床资源，打造较完备而坚实的基础医学、科研和教学技术平台，以学科建设为主线，本着培养、引进、外聘相结合的原则，以师资队伍建设为重点，构建学科发展的良性循环，不断提高我院科研水平和教育、教学质量，力争2010年我院将有1-2个国家级重点学科或重点实验室，3个以上市级重点学科或重点实验室，1-2个博士后流动站，1个一级学科博士学位授权点，实现我院跨越式发展，为我校早日成为国内一流，国际知名的医科大学打下坚实的基础。

　　在党的改革开放方针、政策指引下，在校党委的直接指导关怀下，学院的工作正在忙碌、有序、卓有成效地不断进步、发展，基础医学院正在为首都的医药卫生事业培养合格的医学人才而努力奋斗，贡献着自己的力量。