中国音乐学院音乐学系建立于1981年，前身是北京艺术学院音乐理论学科。音乐学系现设民族音乐、音乐史以及体系音乐三个教研室。中国音乐学院音乐学系教师中拥有博士学位的比例达到90%。音乐学系教师具有较强的教学和科研能力，曾荣获：北京市优秀教学成果一等奖（民族音乐教学，2005年）；北京市“人才强教”学术创新团队（民族音乐教研室、2006）；北京市优秀教学团队（中国音乐史学教学团队，2008）北京市教育教学成果一等奖（传统音乐教学团队，2008）；国家级教育教学成果二等奖（传统音乐教学团队，2009）；北京市优秀教学团队（传统音乐教学团队，2010）。教师个人也多次荣获国家、省部级奖项。

　　音乐学系致力于培养具有一定马克思主义基本理论素养和系统的专业基本知识、具备音乐实践技能和教学能力的高级专门人材，经过五年的本科阶段教育，使其能够胜任在专业或普通院校、社会文艺团体、艺术研究单位和文化机关、出版及广播、影视部门从事教学、研究、编辑、评论、管理等方面的工作。

　　建系以来，音乐学系培养本科毕业生200多人，硕士生30多人，其中有数名毕业生在其他院校（含香港与国外留学）进一步深造，获博士学位。近年来，他们已逐步成为各教学、科研岗位的骨干力量。

　　音乐学系本科必修的本专业课程包括汉族民歌、说唱音乐、戏曲音乐、民族器乐、少数民族民歌、世界民族民间音乐、民族音乐学概论、采风技能、中国古代音乐史、中国近现代音乐史、西方音乐史、音乐美学、古代乐论等专业课程。此外，音乐学系还承担全院各系音乐学方面上述所有课程的共同课教学；同时，音乐学系教师还为全院开设了20余门选修课程。