微生物学系现有教职工20人，其中院士2人，教授6人，副教授4人。微生物学专业是我国首批建立的硕士、博士授予点，并设有博士后流动站。现为国家级重点学科和211工程中国农业大学重点建设学科。微生物学已建成既有微生物基础和应用基础理论，又具有生产和产业开发等全方位发展的学科与应用体系。
　　
　　九五、十五期间微生物学系教师主持省级以上的课题30项。1993年来，全系共发表科研论文200多篇、教材9部、专著5部、译著3部，并获各种科技成果奖7项。