名:刘剑锋
性别:男
出生年月:1972.06
职称:教授
学位/学历:博士/研究生
工作单位:中国农业大学动物科技学院动物遗传育种繁殖系
专业:动物遗传育种与繁殖
主要研究方向:数量遗传学和统计基因组学
E-mail:liujf@cau.edu.cn
电话:010-62731921
工作经历:
起止时间
单位
从事专业技术工作
1996.6-2005.7
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
动物遗传育种
2005.8-2008.7
密苏里大学堪萨斯校区医学院
统计基因组学和生物信息学
2008.11-至今
中国农业大学动物科技学院
分子数量遗传学和畜禽育种
主持和参加项目:
2006.1-2010.12参加“973”课题《抗病和抗逆基因的克隆分析》;
2009.1-2011.12主持“985”工程队伍建设优秀人才项目;
2010.1-2012.12主持国家自然科学基金《应用基因组结集信息建立复杂性状基因精确定位的新方法》;2010.1-2012.12主持教育部留学回国人员科研基金项目《基于基因组集成信息建立基因精确定位的新方法》;
2010.1-2012.12:主持北京市自然科学基金《远交群体数量性状QTL的贝叶斯压缩定位》;
2011.1-2013.12:主持教育部新世纪人才支持项目;2012-2014参加教育部****与创新团队发展计划《畜禽分子育种创新团队》。
主要研究和教学工作简介:
主要从事全基因组关联分析、基因组选择、远交群体复杂性状基因定位理论研究、生物信息学和数据挖掘平台构建和奶牛、猪分子育种研究。主讲本科生《畜牧生物统计与试验设计》、参讲研究生《数量遗传学》、《动物育种原理和方法》课程。
主要学术任职:
中国畜牧兽医学会信息技术分会理事;
《FrontiersinStatisticalGeneticsandMethodology》期刊编委,《Genetica》、《BMCGenetics》、《BMCBioinformatics》、《Bioinformatics》、《Heredity》特约审稿人。
主要论文
1.LiuJ,ZhangY,ZhangQ,WangL,ZhangJ:StudyonmappingquantitativetraitlociforanimalcomplexbinarytraitsusingBayesian-MarkovchainMonteCarloapproach.SciChinaCLifeSci2006,49(6):552-559.
2.YangTL,ZhaoLJ,LiuYJ,LiuJF,ReckerRR,DengHW:Geneticandenvironmentalcorrelationsofbonemineraldensityatdifferentskeletalsitesinfemalesandmales.CalcifTissueInt2006,78(4):212-217.
3.LiuJ,LiuY,LiuX,DengHW:Bayesianmappingofquantitativetraitlociformultiplecomplextraitswiththeuseofvariancecomponents.AmJHumGenet2007,81(2):304-320.
4.LiuJ,PapasianC,DengHW:Incorporatingsingle-locustestsintohaplotypecladisticanalysisincase-controlstudies.PLoSGenet2007,3(3):e46.
5.ZhangF,LiuJ,ChenJ,DengHW:HAPSIMU:ageneticsimulationplatformforpopulation-basedassociationstudies.BMCBioinformatics2008,9:331.
6.LiuYJ,PapasianCJ,LiuJF,HamiltonJ,DengHW:Isreplicationthegoldstandardforvalidatinggenome-wideassociationfindings?PLoSOne2008,3(12):e4037.
7.LiuXG,LiuYJ,LiuJ,PeiY,XiongDH,ShenH,DengHY,PapasianCJ,DreesBM,HamiltonJJetal:AbivariatewholegenomelinkagestudyidentifiedgenomicregionsinfluencingbothBMDandbonestructure.JBoneMinerRes2008,23(11):1806-1814.
8.LiuYJ,LiuXG,WangL,DinaC,YanH,LiuJF,LevyS,PapasianCJ,DreesBM,HamiltonJJetal:Genome-wideassociationscansidentifiedCTNNBL1asanovelgeneforobesity.HumMolGenet2008,17(12):1803-1813.
9.LiuJ,PeiY,PapasianCJ,DengHW:Bivariateassociationanalysesforthemixtureofcontinuousandbinarytraitswiththeuseofextendedgeneralizedestimatingequations.GenetEpidemiol2009,33(3):217-227.
10.ZhangL,LiuJ,DengHW:Amultilocuslinkagedisequilibriummeasurebasedonmutualinformationtheoryanditsapplications.Genetica2009,137(3):355-364.
11.LiuYZ,PeiYF,LiuJF,YangF,GuoY,ZhangL,LiuXG,YanH,WangL,ZhangYPetal:Powerfulbivariategenome-wideassociationanalysessuggesttheSOX6geneinfluencingbothobesityandosteoporosisphenotypesinmales.PLoSOne2009,4(8):e6827.
12.PeiYF,ZhangL,LiuJ,DengHW:Multivariateassociationtestusinghaplotypetrendregression.AnnHumGenet2009,73(Pt4):456-464.
13.GaoH,FangM,LiuJ,ZhangQ:BayesianshrinkagemappingformultipleQTLinhalf-sibfamilies.Heredity2009,103(5):368-376.
14.JiangL,LiuJ,SunD,MaP,DingX,YuY,ZhangQ:GenomewideassociationstudiesformilkproductiontraitsinChineseHolsteinpopulation.PLoSOne2010,5(10):e13661.(同等第一)
15.ZhangZ,LiuJ,DingX,BijmaP,deKoningDJ,ZhangQ:Bestlinearunbiasedpredictionofgenomicbreedingvaluesusingatrait-specificmarker-derivedrelationshipmatrix.PLoSOne2010,5(9).
16.HuF,LiuJF,ZengZB,DingXD,YinCC,GongYZ,ZhangQ:QTLIdentificationUsingCombinedLinkageandLinkageDisequilibriumMappingforMilkProductionTraitsonBTA6inChineseHolsteinPopulation.Asian-AustJAnimSci2010,23(10):1261–1267.
17.LuX,LiuJF,GongYF,WangZP,LiuY,ZhangQ:MappingquantitativetraitlociforTlymphocytesubpopulationsinperipheralbloodinswine.BMCGenet2011,12:79.(同等第一)
18.FangM,LiuJ,SunD,ZhangY,ZhangQ,ZhangY,ZhangS:QTLmappinginoutbredhalf-sibfamiliesusingBayesianmodelselection.Heredity2011,107(3):265-276.(同等第一)
19.JiangJ,JiangL,ZhouB,FuW,LiuJF,ZhangQ:Snat:aSNPannotationtoolforbovinebyintegratingvarioussourcesofgenomicinformation.BMCGenet2011,12:85.(通讯)
20.ZhangZ,DingX,LiuJ,ZhangQ,deKoningDJ:Accuracyofgenomicpredictionusinglow-densitymarkerpanels.JDairySci2011,94(7):3642-3650.
21.LuX,GongYF,LiuJF,WangZP,HuF,QiuXT,LuoYR,ZhangQ:Mappingquantitativetraitlociforcytokinesinthepig.AnimGenet2011,42(1):1-5.
22.LiuY,LuX,LuoYR,ZhouJP,LiuXY,LiuJF,DingXD,ZhangQ:Molecularcharacterizationandassociationanalysisofporcineinterferonregulatoryfactor1gene.MolBiolRep2011,38(3):1901-1907.
著作软件:
肉牛杂交遗传评估系统V1.0
牛基因组单核苷酸多态性单机注释系统V1.0牛基因组单核苷酸多态性在线注释系统V1.0