教师简介

张子丁，博士、教授、博士生导师，中国农业大学农业生物技术国家重点实验室研究人员，主要从事蛋白质生物信息学及计算系统生物学的教学和科研。



学习与工作经历

2005.11－至今中国农业大学生物学院，教授
2002.05－2005.10瑞士雀巢公司研究中心，生物信息学研究科学家
2000.07－2002.04瑞典Lund大学分子生物物理系，结构生物信息学博士后
1990.09－2000.03天津大学化工学院，获工学学士、硕士、博士学位


研究方向

蛋白质生物信息学及计算系统生物学
欢迎具有生物、化学、计算机、物理和数学背景的青年学子报考本课题组的研究生！
更多信息，欢迎浏览http://protein.cau.edu.cn


主讲课程

蛋白质结构预测（研究生）
结构生物学（本科生）

联系方式

电话：62734376
邮件：zidingzhang[at]cau[dot]edu[dot]cn
通讯地址：北京市海淀区圆明园西路2号,中国农业大学生物学院





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发表文章

Selectedpublicationsinthepast5years

ChenZ,WangY,ZhaiY-F,SongJ&ZhangZ(2013)ZincExplorer:anaccuratehybridmethodtoimprovethepredictionofzinc-bindingsitesfromproteinsequences.MolBioSyst,9:2213-2222.

ChenZ,ZhouY,SongJ&ZhangZ(2013)hCKSAAP_UbSite:Improvedpredictionofhumanubiquitinationsitesbyexploitingaminoacidpatternandproperties.BBA-ProteinsandProteomics,1834:1461-1467.

DongX,ZhangY-J&ZhangZ(2013)Usingweaklyconservedmotifshiddeninsecretionsignalstoidentifytype-IIIeffectorsfrombacterialpathogengenomes.PLoSONE,8:e56632.

HanL,ZhangY-J,SongJ,LiuMS&ZhangZ(2012)IdentificationofcatalyticresiduesusinganovelfeaturethatIntegratesthemicroenvironmentandgeometricallocationpropertiesofresidues.PLoSONE,7:e41370.

LiZ-G,HeF,ZhangZ&PengY-L(2012)Predictionofprotein-proteininteractionsbetweenRalstoniasolanacearumandArabidopsisthaliana.AminoAcids,42:2363-2371.

ZhouY,ZhouY-S,HeF,SongJ&ZhangZ(2012)Cansimplecodonpairusagepredictprotein-proteininteraction?MolBioSyst,8:1396-1404.

ZhouY,LiuJ,HanL,LiZ-G&ZhangZ(2011)Comprehensiveanalysisoftandemaminoacidrepeatsfromtenangiospermgenomes.BMCGenomics,12:632.

WangX-F,ChenZ,WangC,YanR-X,ZhangZ&SongJ(2011)Predictingresidue-residuecontactsandhelix-helixinteractionsintransmembraneproteinsusinganintegrativefeature-basedrandomforestapproach.PLoSONE,6:e26767.

ChenZ,ChenY-Z,WangX-F,WangC,YanR-X&ZhangZ(2011)Predictionofubiquitinationsitesbyusingthecompositionofk-spacedaminoacidpairs.PLoSONE,6:e22930.

WangT-Y,HeF,HuQ-W&ZhangZ(2011)Apredictedprotein–proteininteractionnetworkofthefilamentousfungusNeurosporacrassa.MolBioSyst,7:2278-2285.

YanR-X,ChenZ&ZhangZ(2011)Outermembraneproteinscanbesimplyidentifiedusingsecondarystructureelementalignment.BMCBioinformatics,12:76.

HeF,ZhouY&ZhangZ(2010)DecipheringtheArabidopsisfloraltransitionprocessbyintegratingaprotein-proteininteractionnetworkandgeneexpressiondata.PlantPhysiol,153:1492-1505.

YanR-X,SiJ-N,WangC&ZhangZ(2009)DescFold:Awebserverforproteinfoldrecognition.BMCBioinformatics,10:416.

HeF,ZhangY,ChenH,ZhangZ&PengY-L(2008)Thepredictionofprotein-proteininteractionnetworksinriceblastfungus.BMCGenomics,9:519.

TangY-R,ShengZ-Y,ChenY-Z&ZhangZ(2008)Animprovedpredictionofcatalyticresiduesinenzymestructures.ProteinEngineeringDesign&Selection(PEDS),21:295-302.

ChenY-Z,TangY-R,ShengZ-Y&ZhangZ(2008)Predictionofmucin-typeO-glycosylationsitesinmammalianproteinsusingthecompositionofk-spacedaminoacidpairs.BMCBioinformatics,9:101.

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获奖情况



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承担项目及课题

课题组已完成国家自然科学基金青年基金1项，国家“十一五”863计划生物信息与生物计算技术专题1项和教育部新世纪优秀人才资助计划1项。
课题组正承担国家自然科学基金面上项目2项,教育部博士点基金1项。




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专利情况



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社会兼职