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北京协和医学院基础学院研究生导师简介-张正国

北京协和医学院 免费考研网/2013-09-26




张正国教授博士生导师

研究方向与目前进展

生物医学信息的处理与分析
  • 数据挖掘和知识发现技术研究
  • 本研究方向建立的一个生物医学知识发现科研教学平台已初具规模。在硬件方面,建立了光缆因特网接入和百兆内部网,建立了支持WEB、FTP、数据库和生物医学计算等服务的多台服务器。在软件方面,配备了相应的数据库管理系统、生物分子分析和模拟软件。在该平台上可以开展生物医学高通量数据的采集、存储、分析和并行计算等实验。在此基础上,依托学校丰富的生物医学数据资源,分别建立了人类心电信号数据库(数据量200G)、北京市青少年生理常数数据库、北京协和医院人工耳蜗中心数据库、蛋白转导结构域数据库和中文OMIM数据库等。我们正在这个平台上进行恶性心脏事件的多因素的分析。该平台可通过因特网和内部网向授权用户提供多种目前通用的生物信息学计算服务(BLAST,wEMBOSS,Rosetta,BASE等)和十余个数据库的数据服务。这个平台可以用于本科生和研究生的生物医学信息学课程的教学,也可以支持博士生和硕士生开展高水平的生物医学信息学研究工作
  • 心脏信息学研究
  • 在心率变异性(HRV)分析方面,研究主要包括临床常见的心肌缺血和房颤发生发展过程中的HRV变化。运用时频分析法,利用国际上标准心电数据库数据,结合动物实验数据,研究心率变异性(HRV)对心肌缺血状态的响应,确定敏感参数和判别方法,并且探讨缺血缓解与自主神经调节之间可能存在的联系。利用自行开发的,与国际上大型心电信号数据库兼容的关系型数据库中的数据,通过对房颤相关的心电信RR间期进行非线性复杂度和分形分析,探讨房颤的心室率动力学特性和昼夜节律变化及其其中的自主神经调节机制。研究的目的与临床需求相结合,探讨临床热点病症在自主神经系统中的反映和相关的调节机制。为HRV用于心肌缺血的判别分析,为房颤的临床治疗提供依据。在心脏激动序列无创测量方面,采用真实几何形状的心脏模型,考虑心肌的各向异性,建立能解决心电正向问题和逆向问题的模型。以正向模拟的结果为基础,使用模型解决从BSPM推测心脏异位激动点的逆向问题,并结合典型临床病例,考虑典型的心肌损伤疤痕和由此产生的异位激动点共存的情况,并优化模型的求解,为消融术中心室异位激动点的无创定位提供依据。利用整合实验数据所建立的数据库,我们还开展了心外膜电位与体表心电关系研究(家兔)、自主神经系统对心脏电活动调制作用研究(大鼠)和人心电近日节律(Circadianrhythm)研究。

    主要学习及工作简历

    1998.5-今
    北京协和医学院
    博士生导师

    1996.7-2009.10
    中国医学科学院基础医学研究所生物医学工程系
    主任

    1995.8-1996.2
    美国爱荷华大学医学院
    高级访问学者

    1993.5-今
    中国医学科学院基础医学研究所
    教授/研究员

    1989.7-1990.7
    美国加州大学旧金山分校医学院
    博士后

    1987.7-1993.5
    中国医学科学院基础医学研究所
    助理研究员

    1985.7-1987.7
    中国医学科学院基础医学研究所
    实习研究员

    1982.9-1985.7
    中国协和医科大学
    硕士
    社会任职
    教育部高等学校生物医学工程专业教学指导委员会??????????委员
    美国电子电气工程师学会(IEEE)???????高级会员
    中国生物医学工程学会????????????????????高级会员,副秘书长
    中国仪器仪表学会医疗仪器分会??????理事
    中国电子学会医药信息学分会??????????高级会员,委员
    中国声学会语言听觉音乐声学分会???高级会员,委员
    中国微循环学会???????????????????????????????理事
    中国仪器仪表学会医疗仪器分会??????理事
    中国康复医学会听力康复委员会??????常务委员

    代表性学术论文
    通讯作者:
    *Roleofparasympatheticoveractivityinwaterimmersionstress-inducedgastricmucosallesioninrat,J.AppliedPhysiology,2005,99:2416-2422
    *Structureanalysisoftheproteintransductiondomainofhumanperiod1anditsmutantanalogs,J.Mol.Graph.Mod.,2005,23(5):389-394
    *心电信息数据库系统开发,生物医学工程学杂志,2006,23(4):713-716
    *持续性心房颤动心室率的昼夜节律变化,国际生物医学工程杂志,2006,29(5):257-259,266
    *UsingC'deviationtostudystructuresofcentralaminoacidsinpeptidefragments,AminoAcids.2007,33(4):689-693
    *生物医学时间序列中的模体,中国医药生物技术,2006,1(1):69-71
    *基于网络的基因芯片数据存储分析系统,中国生物医学工程学报,2007,26(3):474-479
    *TissueMap:人类基因和蛋白质表达数据库,中国生物医学工程学报,2008,27(2):187-190
    *应用MPEG-7建立乳腺X线影像数据库,中国生物医学工程学报,2008,27(2):260-264
    *基于网络的面部畸形患者三维数据库的建立,中华整形外科杂志,2008,24(4):311-313
    *应用HL7标准建立心电信息数据库,中国生物医学工程学报,2008,27(3):400-404
    *一种新的长时心电信号模拟方法,中国生物医学工程学报,2009,28(3):362-366
    *主成分分析在基因芯片聚类分析中的适用性评估,中国医药生物技术,2009,4(3):207-211
    *一种基于GeneOntology注释信息的基因选择算法,中国生物医学工程学报,2009,28(5):696-700
    *Stereologicalmeasurementofrat’sseminiferoustubule,ChineseMedicalJournal,2009,122(21):2543-2646

    联系方式
    邮箱:zhangzg126@126.com
    相关话题/医学

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