学科 | 一级学科（名称与代码） | 二级学科（名称与代码） |
| 理 学 | 大气科学（0706） | 气象学（070601） |
生物学（0710） | 微生物学（071005） | |
| *生物化学与分子生物学（071010） | ||
| *生物物理学（071011） | ||
| 生态学（071012） | ||
| 工 学 | 农业工程（0828） | 农业机械化工程（082801） |
| *农业水土工程（082802） | ||
| 农业生物环境与能源工程（082803） | ||
| 环境科学与工程（0830） | 环境科学（083001） | |
| 环境工程（083002） | ||
| 食品科学与工程（0832） | 食品科学（083201） | |
| 农产品加工及贮藏工程（083203） | ||
农 学 农 学 | *作物学（0901） | *作物栽培学与耕作学（090101） |
| *作物遗传育种（090102） | ||
| *作物种质资源学（090120） | ||
| *农产品质量与食物安全（090121） | ||
| *作物生态学（090122） | ||
| *作物信息科学（090123） | ||
| *作物气象学（090124） | ||
| *药用植物资源学（090125） | ||
*园艺学（0902） | *果树学（090201） | |
| *蔬菜学（090202） | ||
| *茶学（090203） | ||
| *农业资源利用（0903） | *土壤学（090301） | |
| *植物营养学（090302） | ||
| *农业水资源利用（090320） | ||
| *农业区域发展（090321） | ||
| *农业遥感（090322） | ||
| *草地资源利用与保护（090323） | ||
*植物保护（0904） | *植物病理学（090401） | |
| *农业昆虫与害虫防治（090402） | ||
| *农药学（090403） | ||
| *杂草科学（090420） | ||
| *病虫测报（090421） | ||
| *生物安全（090422） | ||
| *农业微生物学（090423） | ||
*畜牧学（0905） | *动物遗传育种与繁殖（090501） | |
| *动物营养与饲料科学（090502） | ||
| *草业科学（090503） | ||
| *特种经济动物饲养学 （含：蚕、蜂等）（090504） | ||
*兽医学（0906） | *基础兽医学（090601） | |
| *预防兽医学（090602） | ||
| *临床兽医学（090603） | ||
| 林学（0907） | 野生动植物保护与利用（090705） | |
| 管理学 | 管理科学与工程（1201） | |
| *农林经济管理学（1203） | *农业经济管理（120301） | |
| *农业资源与环境经济学（120320） | ||
| *农产品贸易（120321） | ||
| *农业技术经济（120322） | ||
| *农业信息管理学（120323） | ||
| *农业经营管理（120324） | ||
| 图书馆、情报与档案学（1205） | 情报学（120502） |
注：带*为博士学位授权点，加粗字体为2005年新增自主设置学科
