中医医史文献是从史学、文献学的角度，研究中医药学理论与经验、学术特征、文化内涵与发展规律的一门学科，是中医学重要的基础学科。本学科由我校著名中医专家任应秋教授于50年代创建，1981年首批批准为博士学位授权点，1996年我校中医学一级学科被批准为博士后流动站，本学科是流动站基地之一，目前形成了医学人文系为主、以中医信息研究室、中医文化研究中心、医史博物馆为支撑的合理布局。现有正副教授24人，师资力量雄厚，其中鲁兆麟教授和钱超尘教授为著名中医专家和学术带头人。本学科的4门主要课程（各家学说、医学史、医古文和中医文献学）均为全国教材的主编，并为中华中医药学会各家学说专业委员会、医古文研究会和李时珍研究会的主任委员单位，医学史分会、中医文献学分会和中医文化分会副主任委员单位。1995年以来，主持和参与各级课题53项，发表论文336篇，出版著作88部，获国家级奖1项，部局级奖13项，学科整体优势明显，在全国高等中医院校同类学科中处于领先地位。本学科的研究方向有4个：
　　
　　1.中医学术发展规律及流派研究通过深入研究历代名医的学术思想和临床经验，探讨中医学术流派的形成和发展，进而揭示中医学术发展的内在规律，并凸显中医各家理论对临床的指导意义和实用价值。尤其侧重于近现代北京地区医学流派学术上的传承、发展与推广应用。
　　
　　2.中医临床文献研究以病证为研究切入点，探讨古今中医文献有关各病证的学术发展源流，阐述历代医家对各病证病因病机、诊断治疗的认识与发展沿革，总结他们诊治各科病证的学术理论和临证经验，为提高当今诊疗水平和临床疗效服务。
　　
　　3.中医文化研究从外史角度、利用诠释学的方法，研究中医学形成的文化社会背景、总体发展规律及其学术特征、思维方法，阐明中西医学临床思维的异同，从文化研究回归到医学研究，以促进中医药学术的发展。
　　
　　4.中外传统医学比较与交流史研究通过比较研究，寻找中西医学的交叉点和突破点，探索中西医学结合的新思路，为当今中医药走向世界提供依据；并通过东西方医学文化交流史和中医药西传波斯、南亚，东传日本、高丽的历史实证研究，证明中医学在历史上对世界医学产生深刻而广泛的影响。
　　
　　研究方向特色为：（1）文献研究与临床密切结合；（2）以文化研究为起点，以医学研究为目的；（3）符合未来医学科技与人文相结合的发展模式；（4）与北京市文化经济建设、中医药事业发展密切相关。
　　
　　通过数年的学科建设，使本学科成为北京市的中医医史文献研究中心，成为北京市中医文化宣传与国际交流的窗口，成为高层次医史文献人才的培养基地，最终将使本学科点建设成为在我国医史文献领域具有带动和幅射作用的国内一流学科。