北京中医药大学管理学院始建于1983年5月，原称培训部，同时是卫生部在全国指定建立的七所管理干部培训中心之一，也是唯一的一所中医卫生管理干部培训基地。1987年改称卫生管理系，2000年改称为管理学院。目前管理学院的主要任务有两个，一是进行学历教育，面向全国招生，现有研究生、七年制本硕连读（中医专业医院管理研究方向）、本科生等多个教育层次。二是为全国中医药事业、企业机构进行管理干部培训。设有三个专业：公共事业管理专业、工商管理专业、中医专业（医院管理研究方向，七年制本硕连读）。一个硕士点：社会医学与卫生事业管理专业硕士点。管理学院已经实行并将继续推进教学管理制度的改革。目前实行奖学金、贷学金制度。主辅修制，鼓励优秀学生辅修第二专业，跨院系、跨专业等选修，拓宽知识面，培养复合型人才。