删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)

北京基因组所等合作研究全景解析我国耐多药结核病

本站小编 Free考研/2020-06-02

近日,中国科学院北京基因组研究所陈非研究组与北京胸科医院暨国家结核病临检实验室许绍发、黄海荣课题组合作,针对我国首次“全国结核病耐药性基线调查”采集的4,600份样本所获取的357株耐多药 (Multi-drug resistance, MDR) 结核病菌株,进行了大规模基因组测序,结合迄今为止最全面的抗生素药敏实验(18种抗结核药物)和流调数据,揭示了中国耐多药结核病的流行病学/耐药特征、特有耐药基因和SNPs,以及耐多药结核病菌株在中国种群的扩张历史。本研究的采集样本覆盖全国31个省市自治区70个区县市,是对我国耐多药结核病的一次全面解析研究。该成果以“Cross-sectional whole-genome sequencing and epidemiological study of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in China”为题在线发表于国际传染病研究领域期刊Clinical Infectious Diseases
  据WHO全球结核病报告,结核病从2014年至今已经连续四年超过艾滋病成为全球第一传染病杀手,并位列全球十大最致命疾病之一。全球每年新增结核病例超过1,000万例,死亡人数超过100万。目前耐药结核仍是结核病难于根治的最主要原因之一,其死亡率极高,治愈率仅为54%,对全球公共卫生构成巨大威胁。
  本次大规模研究流调数据的统计结果显示,耐多药结核病患者中复治比例高于初治,具有明显的性别、人群和地域特点。通过对18种抗结核药物在耐多药菌株中耐药率的计算,研究人员发现一线抗结核药物中吡嗪酰胺的耐药率最低,二线抗结核药物中贝达喹啉(0.8%)、德拉马尼(1.4%)和利奈唑胺(2.8%)的耐药率较低,这三种药也是目前WHO优先推荐用于耐多药结核病治疗的药物。
  对我国7个行政区耐药流行情况的分析表明,我国耐多药结核病耐药形势十分严峻。我国50%以上的耐多药菌株同时耐5种以上抗结核药物。通过Fisher精确检验7个行政区耐多药菌株联合耐药模式的分析发现,五种一线药具有高频的共耐药模式,其他药物中除两种氟喹诺酮类药物氧氟沙星和莫西沙星外,均呈现低频的共耐药模式。
  科研人员结合耐药表型与基因型数据,运用三种统计学及一种机器学习方法进一步揭示了耐多药结核病耐药表型的遗传基础。筛选到42个耐药相关的SNPs和44个耐药相关基因,其中31个耐药相关基因为本次研究首次发现,为耐药结核的诊治提供了新靶标。此外,贝叶斯skyline分析结果表明我国耐多药结核病种群大小的改变与我国经济社会环境和国家结核防控体系建设紧密相关。从2000年开始到2006年,我国耐多药结核病种群数量增长得到了有效的控制,并在2006年以后呈明显下降趋势,这主要得益于2000年以后我国政府在政策、资金等方面加大了对结核病防控治的支持。
  该研究为我国耐药结核的精准诊治提供了坚实的数据及理论基础,并对全球耐药结核的防控提供了有益的借鉴及参考。研究得到科技部传染病防治重大专项、中国科学院重点部署等项目的资金资助。
  文章链接

  中国耐多药结核病分布及流行

  影响我国耐多药结核病种群大小的改变因素
相关话题/药物 数据

  • 领限时大额优惠券,享本站正版考研考试资料!
    大额优惠券
    优惠券领取后72小时内有效,10万种最新考研考试考证类电子打印资料任你选。涵盖全国500余所院校考研专业课、200多种职业资格考试、1100多种经典教材,产品类型包含电子书、题库、全套资料以及视频,无论您是考研复习、考证刷题,还是考前冲刺等,不同类型的产品可满足您学习上的不同需求。 ...
    本站小编 Free壹佰分学习网 2022-09-19
  • 北京基因组所开发长非编码RNA数据库LncBook
    近日,由基因组所开发的人类长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)数据库LncBook正式上线。该项研究成果以“LncBook: a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs”为题在国际学术期刊Nuclei ...
    本站小编 Free考研 2020-06-02
  • 北京基因组所举办第三届国际生命与健康大数据论坛
    10月11至14日,“第三届国际生命与健康大数据论坛”在中国科学院北京基因组研究所召开。论坛依托中国科学院国际大科学计划“国际健康大数据共享计划”项目和国家重点研发计划“国际生命组学数据共享计划”项目,由北京基因组所生命与健康大数据中心主办。包括美国国家生物技术信息中心、康奈尔大学医学院、俄罗斯科学 ...
    本站小编 Free考研 2020-06-02
  • 北京基因组所等开发从低分辨率Hi-C数据中提取高分辨率3D基因组结构的新方法
    高等真核生物的核内活动, 从基因转录,DNA的复制到DNA损伤修复等,都与基因组的三维空间结构息息相关。因此,3D基因组研究成为近年来的前沿热点领域。Hi-C是目前最常见的全基因组检测染色质三维结构的组学技术。然而,由于Hi-C具有分辨率相对较低,测序量要求极高的特点,在类似精准医学人群队列这样的大 ...
    本站小编 Free考研 2020-06-02
  • 国际生物多样性与健康大数据联盟成立
    10月14日,国际生物多样性与健康大数据联盟启动仪式在京举行。该联盟依托中国科学院北京基因组研究所,成员主要来自“一带一路”沿线国家。包括巴基斯坦、沙特、泰国、俄罗斯、新加坡、美国等多个国家的机构代表参加了启动仪式。  该联盟是在国际生物科学联合会倡导的“国际生物多样性及健康大数据共享”计划框架下成 ...
    本站小编 Free考研 2020-06-02
  • 佳木斯高频相干散射雷达数据与SuperDARN实现数据交换
    近日,佳木斯高频相干散射雷达数据与国际超级双极光雷达网(Super Dual Auroral Radar Network, SuperDARN)实现数据交换。  SuperDARN是一个高频雷达国际合作组织。该组织起源于上世纪80年代,之后不断发展壮大,目前共包括有来自英国,美国,加拿大,日本,中国 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30
  • 基于张衡一号数据的首个全球磁场模型面世
    近日,在长沙召开的“第四届中国电磁监测卫星计划国际学术研讨会”上,欧空局SWARM卫星首席科学家Gauthier HULLOT教授特别介绍了新一轮国际地磁参考场(International Geomagnetic Reference Field,IGRF)候选模型的测评情况,其中由张衡一号高精度磁强 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30
  • 空间中心科研人员建立中国区域高分辨率电离层数据同化模型
    电离层数据同化,是指将零散分布的电离层多源观测数据融合到背景模式当中,使背景场与观测值相互匹配,从而建立既包含内在物理过程,又反映真实观测的电离层模型的重要方法。数据同化可以有效的弥补观测的时空局限和背景模型的精度偏差,是电离层空间天气现报预报领域的研究重点之一。  国家空间科学中心空间环境研究预报 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30
  • 《中国图象图形学报》被Scopus数据库收录
    近日,经过严格的期刊遴选程序,《中国图象图形学报》正式被Scopus数据库收录。这是继美国EBSCO数据库,日本JST数据库收录之后,《中国图象图形学报》再次获得国际知名数据库的收录。  Scopus数据库是全球最大同行评议文献摘要与引文数据库,由全球最大的出版社爱思唯尔(Elsevier)出版社负 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30
  • 空天院科研人员在嫦娥四号探测数据形貌与矿物科学研究中取得系列成果
    在嫦娥四号工程任务中,中科院空天信息创新研究院遥感科学国家重点实验室行星遥感团队(www.pmrslab.cn)研发了月球车导航定位与月面环境感知技术与软件,在北京航天飞行控制中心业务化应用于遥操作任务,在着陆点定位、月面三维地形重建、障碍识别、月球车视觉导航定位等方面做出了重要贡献。  在参加工程 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30
  • 《地球大数据(英文)》被Scopus数据库收录
    近日,由国际数字地球学会、中国科学院空天信息创新研究院、中国科学院A类战略性先导科技专项“地球大数据科学工程”共同主办的学术期刊《地球大数据(英文)》(Big Earth Data)被Scopus数据库正式收录。这是继2018年5月该刊被DOAJ(国际开放获取期刊检索系统)收录后,获得的另一大型文献 ...
    本站小编 Free考研 2020-05-30