电子信息与电气工程系现有电子信息工程、自动化、通信工程、电子信息工程（ 2+3 ）四个本科专业，其中电子信息工程专业为国家级特色专业，自动化专业为国家实施“卓越工程师教育培养计划”专业。目前全系在校生1200余人。该系师资力量雄厚，拥有一支结构合理、理论水平高、实践能力强、敬业爱岗、勇于钻研和创新的教师队伍。在36名专任教师中，教授、副教授14人，硕士以上学位的教师31人。目前仍有5位教师在攻读硕士、博士学位，教师中1人获省级教坛新秀称号。

　　该系下设有电子信息工程、自动化、通信工程、实验技术、基础等五个教研室，拥有CPLD、PLC、高频、通信原理、自控原理、电气控制、运动控制、过程控制、图像处理、系统仿真、检测与转换技术、微波技术、通信技术、测量技术、DSP技术等一批设备先进、管理规范的专业实验室；机器视觉与智能控制技术重点实验室；GE Fanuc自动化系统应用实训室。形成电路系统、信息处理、智能控制、运动控制、无线通信、网络通信方向实验室。这些实验室的建设，保证了教学科研工作的需要。

　　该系教师重视教学研究和科研工作，承担了国家、省、厅、院级教科研项目多项，发表了各类教、科研论文100余篇。其中一类论文30余篇。

　　该系按照学院“地方性、应用型、国际化”的办学定位，借鉴德国应用科学大学的人才培养模式，加强基础、面向应用、提高素质，在教学过程中注重强化分析、解决问题能力的构建，提高学生综合素质与工程素养。自2005年以来，在历届全国大学生电子设计竞赛、“挑战杯”全国大学生课外学术作品竞赛、中国科技大学"机器人设计大赛"、 IMAGINE CUP、“毕　杯”全国电子创新设计竞赛、全国大学生电子信息类实践创新作品评选、安徽省大学生工程训练综合能力竞赛等一系列专业竞赛中，获全国特等奖一项、一等奖五项、二等奖十一项、三等奖五项，华东及省级以上各类奖项近60项的好成绩。这些专业竞赛激发了学生的专业热情，对学生应用能力、创新能力和实践能力有很大的提高。

　　按照合肥学院与德国安哈尔特应用科学大学两校合作办学协议，自2007年起该系电子信息工程（2+３）专业实行双文凭双学位培养模式，在合作培养过程中充分发挥中、德两国大学的特色和优势，培养德智体美全面发展的应用型人才。目前07、08、09级该专业学生已顺利进入第二阶段在德国的学习。部分07级学生已毕业，并进入硕士阶段学习。

　　由于重视教学、重视人才培养质量，本系毕业生基础扎实，知识面广，适应能力强，深受用人单位好评，连续3年就业率持续保持在99%以上，位居学院前3名。该系每年均有近15%的毕业生分别考取德国及中国多所高校的研究生继续深造。录取的院校有德国的慕尼黑工业大学、汉诺威大学、哥廷根大学等，国内的中国科技大学、武汉大学、东南大学、电子科技大学、南京航天航空大学、南京邮电大学、北京理工大学、合肥工业大学、上海大学等多所高校。