安徽医科大学公共卫生学院于2000年正式成立。她的前身是安徽医科大学卫生系，筹建于1958年，成立于1974年，已走过几十年的风雨历程，目前已成为集教学科研为一体，学科门类齐全、人才梯队较为合理，在国内外具有一定影响的公共卫生学院。
　　
　　学院目前设有7个系，它们是流行病与卫生统计学系、劳动卫生与环境卫生系、食品卫生与营养学系、卫生毒理学系、儿少卫生与妇幼保健学系、全科医学/家庭医学系、医学检验学系。有理化中心实验室、分子生物学实验室、毒理中心实验室三个教学科研实验平台，拥有高压液相色谱仪、气相色谱仪等先进设备，有计算机多媒体教室并有sas、spss正版统计软件。可进行相关技术服务。附设预防医学研究所，创办《疾病控制杂志》。现有流行病学与卫生统计学，劳动卫生与环境卫生学、儿少与妇幼卫生学三个硕士学位点。有一个省级重点学科、二个校级重点学科和一个校级重点扶持学科。《预防医学》课程2000年被确定为安徽省级重点建设课程。
　　
　　目前全院有教授14人，副教授17人，高级实验师4人，中级职称20余人，博士（含在读）8人，硕士17人，聘任国内外知名学者专家为客座教授5人，省内著名专家为兼职教授4人，副教授25人。建立2所教学医院、6个教学防疫站（疾病控制中心和卫生监督所）和一个教学妇幼保健所，以及2个教学妇幼保健院。
　　
　　学院坚持以教为本，教学、科研、学科发展齐头并进的办学方针，努力提高教学质量，积极进行教学改革，拓宽专业口径，适应人才市场需求。科研成绩突出，建院以来承担各类科研课题46项，发表学术论文800余篇，学术专著40余部，获17项省级以上奖励；主编和参编全国高等医药规划教材7部。
　　
　　学院面向全省招收预防医学、全科医学、检验医学本、专科生和全脱产和半脱产成人教育本、专科生，其中2003年增招预防医学（卫生监督与卫生法学）成教生。2002年我院预防医学专业和妇幼专业毕业生一次就业率高达87%，其中有25%录取为研究生。毕业生普遍受到用人单位好评，数十人已担任地市级以上卫生机构的领导，绝大多数已成为我省各级卫生防疫机构的骨干力量，部分毕业同学成为国内一些科研院所、大专院校的学科带头人。据不完全统计有100余人被全国各兄弟院校和研究所录取为博士、硕士研究生。出国深造多人，目前仍有数十人在国外工作和学习，有的毕业生科研成果在国内外产生了较大的学术影响，还有人已成为国内外具有一定知名度的专家学者或企业家。